RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000508139.1

FGFR4-210, Transcript of fibroblast growth factor receptor 4, humanhuman

TSL 5

Gene FGFR4, Length 720 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR4-210ENST00000508139 TRPM4Q8TD43 1214 aa22.74■■□□□ 1.23
FGFR4-210ENST00000508139 VPS33BQ9H267 617 aa22.74■■□□□ 1.23
FGFR4-210ENST00000508139 ERBB4Q15303 1308 aa22.74■■□□□ 1.23
FGFR4-210ENST00000508139 SHTN1A0MZ66 631 aa22.73■■□□□ 1.23
FGFR4-210ENST00000508139 CA12O43570 354 aa22.73■■□□□ 1.23
FGFR4-210ENST00000508139 ANXA1P04083 346 aa22.73■■□□□ 1.23
FGFR4-210ENST00000508139 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
FGFR4-210ENST00000508139 NFE2L2Q16236 605 aa22.73■■□□□ 1.23
FGFR4-210ENST00000508139 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
FGFR4-210ENST00000508139 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
FGFR4-210ENST00000508139 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
FGFR4-210ENST00000508139 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
FGFR4-210ENST00000508139 MPNDQ8N594 471 aa22.72■■□□□ 1.23
FGFR4-210ENST00000508139 CDHR2Q9BYE9 1310 aa22.72■■□□□ 1.23
FGFR4-210ENST00000508139 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
FGFR4-210ENST00000508139 KIAA2012Q0VF49 1180 aa22.71■■□□□ 1.23
FGFR4-210ENST00000508139 DGKZQ13574 1117 aa22.71■■□□□ 1.23
FGFR4-210ENST00000508139 PROSER3Q2NL68 480 aa22.71■■□□□ 1.23
FGFR4-210ENST00000508139 HHIPL1Q96JK4 782 aa22.71■■□□□ 1.23
FGFR4-210ENST00000508139 TNIP1Q15025 636 aa22.7■■□□□ 1.22
FGFR4-210ENST00000508139 SLC10A5Q5PT55 438 aa22.7■■□□□ 1.22
FGFR4-210ENST00000508139 LRP10Q7Z4F1 713 aa22.7■■□□□ 1.22
FGFR4-210ENST00000508139 SP8Q8IXZ3 490 aa22.7■■□□□ 1.22
FGFR4-210ENST00000508139 PLEKHF1Q96S99 279 aa22.7■■□□□ 1.22
FGFR4-210ENST00000508139 PGAP2Q9UHJ9 254 aa22.7■■□□□ 1.22
FGFR4-210ENST00000508139 TSPYL4Q9UJ04 414 aa22.7■■□□□ 1.22
FGFR4-210ENST00000508139 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa22.69■■□□□ 1.22
FGFR4-210ENST00000508139 PDIA6Q15084 440 aa22.69■■□□□ 1.22
FGFR4-210ENST00000508139 DLK2Q6UY11 383 aa22.69■■□□□ 1.22
FGFR4-210ENST00000508139 ZNF428Q96B54 188 aa22.69■■□□□ 1.22
FGFR4-210ENST00000508139 ZIC5Q96T25 663 aa22.69■■□□□ 1.22
FGFR4-210ENST00000508139 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
FGFR4-210ENST00000508139 SCN9AQ15858 1988 aa22.69■■□□□ 1.22
FGFR4-210ENST00000508139 YDJCA8MPS7 323 aa22.68■■□□□ 1.22
FGFR4-210ENST00000508139 BBOX1O75936 387 aa22.68■■□□□ 1.22
FGFR4-210ENST00000508139 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
FGFR4-210ENST00000508139 CDC37L1Q7L3B6 337 aa22.68■■□□□ 1.22
FGFR4-210ENST00000508139 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
FGFR4-210ENST00000508139 COL4A1P02462 1669 aa22.68■■□□□ 1.22
FGFR4-210ENST00000508139 HUNKP57058 714 aa22.67■■□□□ 1.22
FGFR4-210ENST00000508139 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
FGFR4-210ENST00000508139 USP48Q86UV5 1035 aa22.67■■□□□ 1.22
FGFR4-210ENST00000508139 MICALL2Q8IY33 904 aa22.67■■□□□ 1.22
FGFR4-210ENST00000508139 NECTIN2Q92692 538 aa22.67■■□□□ 1.22
FGFR4-210ENST00000508139 NOGQ13253 232 aa22.66■■□□□ 1.22
FGFR4-210ENST00000508139 NLRP10Q86W26 655 aa22.66■■□□□ 1.22
FGFR4-210ENST00000508139 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
FGFR4-210ENST00000508139 H7C1D1 291 aa22.65■■□□□ 1.22
FGFR4-210ENST00000508139 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
FGFR4-210ENST00000508139 GRAPQ13588 217 aa22.65■■□□□ 1.22
FGFR4-210ENST00000508139 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
FGFR4-210ENST00000508139 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
FGFR4-210ENST00000508139 PSME4Q14997 1843 aa22.64■■□□□ 1.22
FGFR4-210ENST00000508139 SAMD7Q7Z3H4 446 aa22.64■■□□□ 1.21
FGFR4-210ENST00000508139 XAGE3Q8WTP9 111 aa22.64■■□□□ 1.21
FGFR4-210ENST00000508139 RALBP1Q15311 655 aa22.63■■□□□ 1.21
FGFR4-210ENST00000508139 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
FGFR4-210ENST00000508139 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa22.63■■□□□ 1.21
FGFR4-210ENST00000508139 COPS6Q7L5N1 327 aa22.63■■□□□ 1.21
FGFR4-210ENST00000508139 DBNDD1Q9H9R9 158 aa22.63■■□□□ 1.21
FGFR4-210ENST00000508139 SH3TC1Q8TE82 1336 aa22.62■■□□□ 1.21
FGFR4-210ENST00000508139 PSMD14O00487 310 aa22.62■■□□□ 1.21
FGFR4-210ENST00000508139 EGFRP00533 1210 aa22.61■■□□□ 1.21
FGFR4-210ENST00000508139 KRT26Q7Z3Y9 468 aa22.61■■□□□ 1.21
FGFR4-210ENST00000508139 ADM5C9JUS6 153 aa22.6■■□□□ 1.21
FGFR4-210ENST00000508139 RIMBP2O15034 1052 aa22.6■■□□□ 1.21
FGFR4-210ENST00000508139 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
FGFR4-210ENST00000508139 TCIRG1Q13488 830 aa22.59■■□□□ 1.21
FGFR4-210ENST00000508139 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
FGFR4-210ENST00000508139 RGMBQ6NW40 437 aa22.59■■□□□ 1.21
FGFR4-210ENST00000508139 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.21
FGFR4-210ENST00000508139 WASHC4Q2M389 1173 aa22.58■■□□□ 1.21
FGFR4-210ENST00000508139 TMC4Q7Z404 712 aa22.58■■□□□ 1.21
FGFR4-210ENST00000508139 DPF2Q92785 391 aa22.58■■□□□ 1.21
FGFR4-210ENST00000508139 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
FGFR4-210ENST00000508139 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
FGFR4-210ENST00000508139 SPEF2Q9C093 1822 aa22.58■■□□□ 1.21
FGFR4-210ENST00000508139 SOX10P56693 466 aa22.57■■□□□ 1.2
FGFR4-210ENST00000508139 RIPK4P57078 832 aa22.57■■□□□ 1.2
FGFR4-210ENST00000508139 C2orf69Q8N8R5 385 aa22.57■■□□□ 1.2
FGFR4-210ENST00000508139 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
FGFR4-210ENST00000508139 RTL9Q8NET4 1388 aa22.56■■□□□ 1.2
FGFR4-210ENST00000508139 C6orf229H3BNL8 230 aa22.56■■□□□ 1.2
FGFR4-210ENST00000508139 ECE2O60344 883 aa22.56■■□□□ 1.2
FGFR4-210ENST00000508139 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
FGFR4-210ENST00000508139 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
FGFR4-210ENST00000508139 DOK7Q18PE1 504 aa22.56■■□□□ 1.2
FGFR4-210ENST00000508139 KRT24Q2M2I5 525 aa22.56■■□□□ 1.2
FGFR4-210ENST00000508139 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
FGFR4-210ENST00000508139 KCNQ5Q9NR82 932 aa22.56■■□□□ 1.2
FGFR4-210ENST00000508139 GPSM2P81274 684 aa22.55■■□□□ 1.2
FGFR4-210ENST00000508139 TRPA1O75762 1119 aa22.54■■□□□ 1.2
FGFR4-210ENST00000508139 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa22.54■■□□□ 1.2
FGFR4-210ENST00000508139 SAGE1Q9NXZ1 904 aa22.54■■□□□ 1.2
FGFR4-210ENST00000508139 CHPF2Q9P2E5 772 aa22.54■■□□□ 1.2
FGFR4-210ENST00000508139 POLLQ9UGP5 575 aa22.54■■□□□ 1.2
FGFR4-210ENST00000508139 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
FGFR4-210ENST00000508139 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
FGFR4-210ENST00000508139 CCDC102AQ96A19 550 aa22.53■■□□□ 1.2
FGFR4-210ENST00000508139 FAM89AQ96GI7 184 aa22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.7 ms