RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000500394.6

CPEB2-AS1-201, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CPEB2-AS1, Length 1,630 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPEB2-AS1-201ENST00000500394 PLA2G12BQ9BX93 195 aa21.47■■□□□ 1.03
CPEB2-AS1-201ENST00000500394 RIC1Q4ADV7 1423 aa21.47■■□□□ 1.03
CPEB2-AS1-201ENST00000500394 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
CPEB2-AS1-201ENST00000500394 MS4A1P11836 297 aa21.47■■□□□ 1.03
CPEB2-AS1-201ENST00000500394 PDE6BP35913 854 aa21.47■■□□□ 1.03
CPEB2-AS1-201ENST00000500394 SEC31BQ9NQW1 1179 aa21.47■■□□□ 1.03
CPEB2-AS1-201ENST00000500394 MYH3P11055 1940 aa21.46■■□□□ 1.03
CPEB2-AS1-201ENST00000500394 CTSWP56202 376 aa21.46■■□□□ 1.03
CPEB2-AS1-201ENST00000500394 GREM2Q9H772 168 aa21.46■■□□□ 1.03
CPEB2-AS1-201ENST00000500394 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
CPEB2-AS1-201ENST00000500394 LMBR1LQ6UX01 489 aa21.45■■□□□ 1.02
CPEB2-AS1-201ENST00000500394 CSF1RP07333 972 aa21.44■■□□□ 1.02
CPEB2-AS1-201ENST00000500394 FAM161AQ3B820 660 aa21.44■■□□□ 1.02
CPEB2-AS1-201ENST00000500394 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP21.44■■□□□ 1.02
CPEB2-AS1-201ENST00000500394 H0YIN7 160 aa21.44■■□□□ 1.02
CPEB2-AS1-201ENST00000500394 TGFB2P61812 414 aa21.44■■□□□ 1.02
CPEB2-AS1-201ENST00000500394 EXOC6Q8TAG9 804 aa21.44■■□□□ 1.02
CPEB2-AS1-201ENST00000500394 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa21.44■■□□□ 1.02
CPEB2-AS1-201ENST00000500394 CACNA1SQ13698 1873 aa21.43■■□□□ 1.02
CPEB2-AS1-201ENST00000500394 DLEC1Q9Y238 1755 aa21.43■■□□□ 1.02
CPEB2-AS1-201ENST00000500394 GNAI3P08754 354 aa21.43■■□□□ 1.02
CPEB2-AS1-201ENST00000500394 DDX19BQ9UMR2 479 aa21.43■■□□□ 1.02
CPEB2-AS1-201ENST00000500394 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
CPEB2-AS1-201ENST00000500394 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
CPEB2-AS1-201ENST00000500394 OLFM4Q6UX06 510 aa21.42■■□□□ 1.02
CPEB2-AS1-201ENST00000500394 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
CPEB2-AS1-201ENST00000500394 UTRNP46939 3433 aa21.41■■□□□ 1.02
CPEB2-AS1-201ENST00000500394 MASTLQ96GX5 879 aa21.41■■□□□ 1.02
CPEB2-AS1-201ENST00000500394 CHMP3Q9Y3E7 222 aa21.41■■□□□ 1.02
CPEB2-AS1-201ENST00000500394 SLX4Q8IY92 1834 aa21.41■■□□□ 1.02
CPEB2-AS1-201ENST00000500394 GNAI2P04899 355 aa21.4■■□□□ 1.02
CPEB2-AS1-201ENST00000500394 NPR1P16066 1061 aa21.4■■□□□ 1.02
CPEB2-AS1-201ENST00000500394 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
CPEB2-AS1-201ENST00000500394 KLHDC4Q8TBB5 520 aa21.4■■□□□ 1.02
CPEB2-AS1-201ENST00000500394 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
CPEB2-AS1-201ENST00000500394 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
CPEB2-AS1-201ENST00000500394 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa21.39■■□□□ 1.01
CPEB2-AS1-201ENST00000500394 ITGA6P23229 1130 aa21.39■■□□□ 1.01
CPEB2-AS1-201ENST00000500394 CCDC152Q4G0S7 254 aa21.39■■□□□ 1.01
CPEB2-AS1-201ENST00000500394 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
CPEB2-AS1-201ENST00000500394 STYK1Q6J9G0 422 aa21.38■■□□□ 1.01
CPEB2-AS1-201ENST00000500394 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
CPEB2-AS1-201ENST00000500394 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
CPEB2-AS1-201ENST00000500394 SPEF2Q9C093 1822 aa21.37■■□□□ 1.01
CPEB2-AS1-201ENST00000500394 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP21.37■■□□□ 1.01
CPEB2-AS1-201ENST00000500394 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
CPEB2-AS1-201ENST00000500394 SIRT2Q8IXJ6 389 aa21.37■■□□□ 1.01
CPEB2-AS1-201ENST00000500394 CRAMP1Q96RY5 1269 aa21.37■■□□□ 1.01
CPEB2-AS1-201ENST00000500394 PIM2Q9P1W9 311 aa21.37■■□□□ 1.01
CPEB2-AS1-201ENST00000500394 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
CPEB2-AS1-201ENST00000500394 CEP85Q6P2H3 762 aa21.36■■□□□ 1.01
CPEB2-AS1-201ENST00000500394 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa21.36■■□□□ 1.01
CPEB2-AS1-201ENST00000500394 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP21.35■■□□□ 1.01
CPEB2-AS1-201ENST00000500394 GRAPQ13588 217 aa21.35■■□□□ 1.01
CPEB2-AS1-201ENST00000500394 TTLL6Q8N841 843 aa21.35■■□□□ 1.01
CPEB2-AS1-201ENST00000500394 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP21.35■■□□□ 1.01
CPEB2-AS1-201ENST00000500394 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
CPEB2-AS1-201ENST00000500394 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
CPEB2-AS1-201ENST00000500394 BCS1LQ9Y276 419 aa21.35■■□□□ 1.01
CPEB2-AS1-201ENST00000500394 RTL9Q8NET4 1388 aa21.35■■□□□ 1.01
CPEB2-AS1-201ENST00000500394 C7orf43Q8WVR3 580 aa21.34■■□□□ 1.01
CPEB2-AS1-201ENST00000500394 SRGAP3O43295 1099 aa21.33■■□□□ 1.01
CPEB2-AS1-201ENST00000500394 C21orf2O43822 256 aa21.33■■□□□ 1.01
CPEB2-AS1-201ENST00000500394 RPS8P62241 208 aaKnown RBP21.33■■□□□ 1.01
CPEB2-AS1-201ENST00000500394 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP21.33■■□□□ 1.01
CPEB2-AS1-201ENST00000500394 CNKSR1Q969H4 720 aa21.33■■□□□ 1.01
CPEB2-AS1-201ENST00000500394 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa21.33■■□□□ 1.01
CPEB2-AS1-201ENST00000500394 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa21.33■■□□□ 1
CPEB2-AS1-201ENST00000500394 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP21.33■■□□□ 1
CPEB2-AS1-201ENST00000500394 ALDH1B1P30837 517 aa21.33■■□□□ 1
CPEB2-AS1-201ENST00000500394 ATP8B2P98198 1209 aa21.33■■□□□ 1
CPEB2-AS1-201ENST00000500394 MTX1Q13505 466 aa21.33■■□□□ 1
CPEB2-AS1-201ENST00000500394 CCDC57Q2TAC2 916 aa21.33■■□□□ 1
CPEB2-AS1-201ENST00000500394 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP21.33■■□□□ 1
CPEB2-AS1-201ENST00000500394 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP21.33■■□□□ 1
CPEB2-AS1-201ENST00000500394 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP21.32■■□□□ 1
CPEB2-AS1-201ENST00000500394 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP21.31■■□□□ 1
CPEB2-AS1-201ENST00000500394 LRRC24Q50LG9 513 aa21.31■■□□□ 1
CPEB2-AS1-201ENST00000500394 POLA2Q14181 598 aa21.3■■□□□ 1
CPEB2-AS1-201ENST00000500394 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa21.3■■□□□ 1
CPEB2-AS1-201ENST00000500394 SIL1Q9H173 461 aa21.3■■□□□ 1
CPEB2-AS1-201ENST00000500394 SSH3Q8TE77 659 aa21.29■■□□□ 1
CPEB2-AS1-201ENST00000500394 BBOX1O75936 387 aa21.29■■□□□ 1
CPEB2-AS1-201ENST00000500394 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP21.29■■□□□ 1
CPEB2-AS1-201ENST00000500394 HDAC5Q9UQL6 1122 aa21.29■■□□□ 1
CPEB2-AS1-201ENST00000500394 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP21.29■■□□□ 1
CPEB2-AS1-201ENST00000500394 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa21.28■■□□□ 1
CPEB2-AS1-201ENST00000500394 SNED1Q8TER0 1413 aa21.27■■□□□ 1
CPEB2-AS1-201ENST00000500394 SNAP23O00161 211 aa21.27■■□□□ 1
CPEB2-AS1-201ENST00000500394 TAF7LQ5H9L4 462 aa21.27■■□□□ 1
CPEB2-AS1-201ENST00000500394 ATG9AQ7Z3C6 839 aa21.27■■□□□ 1
CPEB2-AS1-201ENST00000500394 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP21.27■■□□□ 1
CPEB2-AS1-201ENST00000500394 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP21.27■■□□□ 1
CPEB2-AS1-201ENST00000500394 MINPP1Q9UNW1 487 aa21.27■■□□□ 1
CPEB2-AS1-201ENST00000500394 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa21.27■■□□□ 1
CPEB2-AS1-201ENST00000500394 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP21.26■□□□□ 0.99
CPEB2-AS1-201ENST00000500394 GPSM2P81274 684 aa21.26■□□□□ 0.99
CPEB2-AS1-201ENST00000500394 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa21.26■□□□□ 0.99
CPEB2-AS1-201ENST00000500394 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP21.26■□□□□ 0.99
CPEB2-AS1-201ENST00000500394 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.4 ms