RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485621.1

TRAPPC10-211, Transcript of trafficking protein particle complex 10, humanhuman

TSL 2

Gene TRAPPC10, Length 537 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC10-211ENST00000485621 PCSK7Q16549 785 aa11.28□□□□□ -0.6
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TRAPPC10-211ENST00000485621 TREML1Q86YW5 311 aa11.28□□□□□ -0.6
TRAPPC10-211ENST00000485621 RGL4Q8IZJ4 473 aa11.28□□□□□ -0.6
TRAPPC10-211ENST00000485621 SEMA6BQ9H3T3 888 aa11.28□□□□□ -0.6
TRAPPC10-211ENST00000485621 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
TRAPPC10-211ENST00000485621 OPLAHO14841 1288 aa11.27□□□□□ -0.61
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TRAPPC10-211ENST00000485621 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP11.27□□□□□ -0.61
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TRAPPC10-211ENST00000485621 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa11.24□□□□□ -0.61
TRAPPC10-211ENST00000485621 TRPM4Q8TD43 1214 aa11.24□□□□□ -0.61
TRAPPC10-211ENST00000485621 MKNK1Q9BUB5 465 aa11.24□□□□□ -0.61
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TRAPPC10-211ENST00000485621 HFE2Q6ZVN8 426 aa11.23□□□□□ -0.61
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TRAPPC10-211ENST00000485621 ZMYND15Q9H091 742 aa11.23□□□□□ -0.61
TRAPPC10-211ENST00000485621 SAP130Q9H0E3 1048 aa11.23□□□□□ -0.61
TRAPPC10-211ENST00000485621 SELPP16109 830 aa11.22□□□□□ -0.61
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TRAPPC10-211ENST00000485621 C16orf46Q6P387 395 aa11.21□□□□□ -0.61
TRAPPC10-211ENST00000485621 ATG7O95352 703 aa11.2□□□□□ -0.62
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TRAPPC10-211ENST00000485621 PLAURQ03405 335 aa11.2□□□□□ -0.62
TRAPPC10-211ENST00000485621 TMEM164Q5U3C3 297 aa11.2□□□□□ -0.62
TRAPPC10-211ENST00000485621 MSL1Q68DK7 614 aa11.2□□□□□ -0.62
TRAPPC10-211ENST00000485621 CAPN12Q6ZSI9 719 aa11.2□□□□□ -0.62
TRAPPC10-211ENST00000485621 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa11.2□□□□□ -0.62
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TRAPPC10-211ENST00000485621 FRRS1LQ9P0K9 344 aa11.2□□□□□ -0.62
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TRAPPC10-211ENST00000485621 MBTPS1Q14703 1052 aa11.19□□□□□ -0.62
TRAPPC10-211ENST00000485621 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP11.19□□□□□ -0.62
TRAPPC10-211ENST00000485621 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP11.19□□□□□ -0.62
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TRAPPC10-211ENST00000485621 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
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TRAPPC10-211ENST00000485621 KCNMB2Q9Y691 235 aa11.18□□□□□ -0.62
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TRAPPC10-211ENST00000485621 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP11.17□□□□□ -0.62
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TRAPPC10-211ENST00000485621 FAM26DQ5JW98 314 aa11.16□□□□□ -0.62
TRAPPC10-211ENST00000485621 COL26A1Q96A83 441 aa11.16□□□□□ -0.62
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TRAPPC10-211ENST00000485621 TXNRD3Q86VQ6 643 aa11.15□□□□□ -0.62
TRAPPC10-211ENST00000485621 Q8N3U1 123 aa11.15□□□□□ -0.62
TRAPPC10-211ENST00000485621 PBXIP1Q96AQ6 731 aa11.15□□□□□ -0.62
TRAPPC10-211ENST00000485621 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa11.14□□□□□ -0.63
TRAPPC10-211ENST00000485621 DYRK3O43781 588 aa11.14□□□□□ -0.63
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TRAPPC10-211ENST00000485621 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa11.12□□□□□ -0.63
TRAPPC10-211ENST00000485621 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
TRAPPC10-211ENST00000485621 NLRP13Q86W25 1043 aa11.12□□□□□ -0.63
TRAPPC10-211ENST00000485621 FBXO11Q86XK2 927 aa11.12□□□□□ -0.63
TRAPPC10-211ENST00000485621 PIK3R5Q8WYR1 880 aa11.12□□□□□ -0.63
TRAPPC10-211ENST00000485621 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
TRAPPC10-211ENST00000485621 SERPINA10Q9UK55 444 aa11.12□□□□□ -0.63
TRAPPC10-211ENST00000485621 UBAP1LF5GYI3 381 aa11.11□□□□□ -0.63
TRAPPC10-211ENST00000485621 RBSNQ9H1K0 784 aa11.11□□□□□ -0.63
TRAPPC10-211ENST00000485621 FAM13BQ9NYF5 915 aa11.11□□□□□ -0.63
TRAPPC10-211ENST00000485621 ZAP70P43403 619 aa11.1□□□□□ -0.63
TRAPPC10-211ENST00000485621 ATP2B4P23634 1241 aa11.09□□□□□ -0.63
TRAPPC10-211ENST00000485621 SOX18P35713 384 aa11.09□□□□□ -0.63
TRAPPC10-211ENST00000485621 GPR152Q8TDT2 470 aa11.09□□□□□ -0.63
TRAPPC10-211ENST00000485621 TP53INP1Q96A56 240 aa11.09□□□□□ -0.63
TRAPPC10-211ENST00000485621 STIM2Q9P246 746 aa11.09□□□□□ -0.63
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