RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484547.7

RABGEF1-207, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RABGEF1, Length 1,596 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-207ENST00000484547 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa15.43■□□□□ 0.06
RABGEF1-207ENST00000484547 CCDC85CA6NKD9 419 aa15.43■□□□□ 0.06
RABGEF1-207ENST00000484547 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP15.43■□□□□ 0.06
RABGEF1-207ENST00000484547 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP15.43■□□□□ 0.06
RABGEF1-207ENST00000484547 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP15.42■□□□□ 0.06
RABGEF1-207ENST00000484547 RAD17O75943 681 aa15.42■□□□□ 0.06
RABGEF1-207ENST00000484547 MAP2K2P36507 400 aa15.42■□□□□ 0.06
RABGEF1-207ENST00000484547 CIAPIN1Q6FI81 312 aa15.42■□□□□ 0.06
RABGEF1-207ENST00000484547 SAPCD2Q86UD0 394 aa15.42■□□□□ 0.06
RABGEF1-207ENST00000484547 MPNDQ8N594 471 aa15.42■□□□□ 0.06
RABGEF1-207ENST00000484547 BCL2L13Q9BXK5 485 aa15.42■□□□□ 0.06
RABGEF1-207ENST00000484547 ZNF408Q9H9D4 720 aa15.42■□□□□ 0.06
RABGEF1-207ENST00000484547 BBOX1O75936 387 aa15.41■□□□□ 0.06
RABGEF1-207ENST00000484547 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP15.41■□□□□ 0.06
RABGEF1-207ENST00000484547 SP8Q8IXZ3 490 aa15.41■□□□□ 0.06
RABGEF1-207ENST00000484547 NECTIN2Q92692 538 aa15.41■□□□□ 0.06
RABGEF1-207ENST00000484547 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP15.41■□□□□ 0.06
RABGEF1-207ENST00000484547 KIAA2012Q0VF49 1180 aa15.41■□□□□ 0.06
RABGEF1-207ENST00000484547 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP15.41■□□□□ 0.06
RABGEF1-207ENST00000484547 NLRP10Q86W26 655 aa15.41■□□□□ 0.06
RABGEF1-207ENST00000484547 ZNF428Q96B54 188 aa15.41■□□□□ 0.06
RABGEF1-207ENST00000484547 SHTN1A0MZ66 631 aa15.4■□□□□ 0.06
RABGEF1-207ENST00000484547 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP15.4■□□□□ 0.06
RABGEF1-207ENST00000484547 TNIP1Q15025 636 aa15.4■□□□□ 0.06
RABGEF1-207ENST00000484547 COPS6Q7L5N1 327 aa15.4■□□□□ 0.06
RABGEF1-207ENST00000484547 TRPM4Q8TD43 1214 aa15.4■□□□□ 0.06
RABGEF1-207ENST00000484547 XAGE3Q8WTP9 111 aa15.4■□□□□ 0.06
RABGEF1-207ENST00000484547 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP15.4■□□□□ 0.06
RABGEF1-207ENST00000484547 CDHR2Q9BYE9 1310 aa15.39■□□□□ 0.05
RABGEF1-207ENST00000484547 RIPK4P57078 832 aa15.39■□□□□ 0.05
RABGEF1-207ENST00000484547 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa15.39■□□□□ 0.05
RABGEF1-207ENST00000484547 PGAP2Q9UHJ9 254 aa15.39■□□□□ 0.05
RABGEF1-207ENST00000484547 DUOX1Q9NRD9 1551 aa15.39■□□□□ 0.05
RABGEF1-207ENST00000484547 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP15.38■□□□□ 0.05
RABGEF1-207ENST00000484547 YDJCA8MPS7 323 aa15.38■□□□□ 0.05
RABGEF1-207ENST00000484547 GRAPQ13588 217 aa15.38■□□□□ 0.05
RABGEF1-207ENST00000484547 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP15.38■□□□□ 0.05
RABGEF1-207ENST00000484547 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP15.38■□□□□ 0.05
RABGEF1-207ENST00000484547 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP15.38■□□□□ 0.05
RABGEF1-207ENST00000484547 LRRC37AA6NMS7 1700 aa15.38■□□□□ 0.05
RABGEF1-207ENST00000484547 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP15.38■□□□□ 0.05
RABGEF1-207ENST00000484547 SH3TC1Q8TE82 1336 aa15.38■□□□□ 0.05
RABGEF1-207ENST00000484547 CA12O43570 354 aa15.37■□□□□ 0.05
RABGEF1-207ENST00000484547 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP15.37■□□□□ 0.05
RABGEF1-207ENST00000484547 CDC37L1Q7L3B6 337 aa15.37■□□□□ 0.05
RABGEF1-207ENST00000484547 HHIPL1Q96JK4 782 aa15.37■□□□□ 0.05
RABGEF1-207ENST00000484547 H7C1D1 291 aa15.36■□□□□ 0.05
RABGEF1-207ENST00000484547 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP15.36■□□□□ 0.05
RABGEF1-207ENST00000484547 TCIRG1Q13488 830 aa15.36■□□□□ 0.05
RABGEF1-207ENST00000484547 DLK2Q6UY11 383 aa15.36■□□□□ 0.05
RABGEF1-207ENST00000484547 MICALL2Q8IY33 904 aa15.36■□□□□ 0.05
RABGEF1-207ENST00000484547 CFAP44Q96MT7 982 aa15.36■□□□□ 0.05
RABGEF1-207ENST00000484547 USP48Q86UV5 1035 aa15.36■□□□□ 0.05
RABGEF1-207ENST00000484547 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP15.36■□□□□ 0.05
RABGEF1-207ENST00000484547 MCOLN1Q9GZU1 580 aa15.36■□□□□ 0.05
RABGEF1-207ENST00000484547 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP15.36■□□□□ 0.05
RABGEF1-207ENST00000484547 KRT24Q2M2I5 525 aa15.35■□□□□ 0.05
RABGEF1-207ENST00000484547 ZIC5Q96T25 663 aa15.35■□□□□ 0.05
RABGEF1-207ENST00000484547 BABAM1Q9NWV8 329 aa15.35■□□□□ 0.05
RABGEF1-207ENST00000484547 SLC34A2O95436 690 aa15.34■□□□□ 0.05
RABGEF1-207ENST00000484547 TMPOP42166 694 aaKnown RBP15.34■□□□□ 0.05
RABGEF1-207ENST00000484547 RGS19P49795 217 aa15.34■□□□□ 0.05
RABGEF1-207ENST00000484547 HUNKP57058 714 aa15.34■□□□□ 0.05
RABGEF1-207ENST00000484547 SAMD7Q7Z3H4 446 aa15.34■□□□□ 0.05
RABGEF1-207ENST00000484547 TMC4Q7Z404 712 aa15.34■□□□□ 0.05
RABGEF1-207ENST00000484547 DBNDD1Q9H9R9 158 aa15.34■□□□□ 0.05
RABGEF1-207ENST00000484547 PSMD14O00487 310 aa15.33■□□□□ 0.05
RABGEF1-207ENST00000484547 RIMBP2O15034 1052 aa15.33■□□□□ 0.05
RABGEF1-207ENST00000484547 LMOD3Q0VAK6 560 aa15.33■□□□□ 0.05
RABGEF1-207ENST00000484547 NOGQ13253 232 aa15.33■□□□□ 0.05
RABGEF1-207ENST00000484547 WASHC4Q2M389 1173 aa15.33■□□□□ 0.05
RABGEF1-207ENST00000484547 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP15.33■□□□□ 0.05
RABGEF1-207ENST00000484547 CHPF2Q9P2E5 772 aa15.33■□□□□ 0.05
RABGEF1-207ENST00000484547 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP15.33■□□□□ 0.05
RABGEF1-207ENST00000484547 COL4A1P02462 1669 aa15.33■□□□□ 0.04
RABGEF1-207ENST00000484547 DGKZQ13574 1117 aa15.32■□□□□ 0.04
RABGEF1-207ENST00000484547 NEUROD2Q15784 382 aa15.32■□□□□ 0.04
RABGEF1-207ENST00000484547 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP15.32■□□□□ 0.04
RABGEF1-207ENST00000484547 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP15.32■□□□□ 0.04
RABGEF1-207ENST00000484547 AKAP11Q9UKA4 1901 aa15.32■□□□□ 0.04
RABGEF1-207ENST00000484547 SCN9AQ15858 1988 aa15.32■□□□□ 0.04
RABGEF1-207ENST00000484547 C6orf229H3BNL8 230 aa15.32■□□□□ 0.04
RABGEF1-207ENST00000484547 EGFRP00533 1210 aa15.32■□□□□ 0.04
RABGEF1-207ENST00000484547 KRT26Q7Z3Y9 468 aa15.32■□□□□ 0.04
RABGEF1-207ENST00000484547 DPF2Q92785 391 aa15.32■□□□□ 0.04
RABGEF1-207ENST00000484547 FAM89AQ96GI7 184 aa15.32■□□□□ 0.04
RABGEF1-207ENST00000484547 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP15.32■□□□□ 0.04
RABGEF1-207ENST00000484547 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa15.31■□□□□ 0.04
RABGEF1-207ENST00000484547 GPSM2P81274 684 aa15.31■□□□□ 0.04
RABGEF1-207ENST00000484547 DOK7Q18PE1 504 aa15.31■□□□□ 0.04
RABGEF1-207ENST00000484547 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP15.31■□□□□ 0.04
RABGEF1-207ENST00000484547 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP15.31■□□□□ 0.04
RABGEF1-207ENST00000484547 CCDC146Q8IYE0 955 aa15.31■□□□□ 0.04
RABGEF1-207ENST00000484547 KCNQ5Q9NR82 932 aa15.31■□□□□ 0.04
RABGEF1-207ENST00000484547 POLLQ9UGP5 575 aa15.31■□□□□ 0.04
RABGEF1-207ENST00000484547 ADM5C9JUS6 153 aa15.3■□□□□ 0.04
RABGEF1-207ENST00000484547 CHL1O00533 1208 aa15.3■□□□□ 0.04
RABGEF1-207ENST00000484547 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa15.3■□□□□ 0.04
RABGEF1-207ENST00000484547 PLBD2Q8NHP8 589 aa15.3■□□□□ 0.04
RABGEF1-207ENST00000484547 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 77.7 ms