RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484135.1

PTPRC-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRC, Length 612 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-211ENST00000484135 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRC-211ENST00000484135 ZNF417Q8TAU3 575 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRC-211ENST00000484135 ZNF587Q96SQ5 575 aaPredicted RBP8.2□□□□□ -1.1
PTPRC-211ENST00000484135 MDFIQ99750 246 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRC-211ENST00000484135 EFCC1Q9HA90 598 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRC-211ENST00000484135 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP8.2□□□□□ -1.1
PTPRC-211ENST00000484135 LRFN2Q9ULH4 789 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRC-211ENST00000484135 INPP5BP32019 993 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRC-211ENST00000484135 KRT25Q7Z3Z0 450 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRC-211ENST00000484135 IFT43Q96FT9 208 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRC-211ENST00000484135 GSX2Q9BZM3 304 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRC-211ENST00000484135 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP8.19□□□□□ -1.1
PTPRC-211ENST00000484135 ALBP02768 609 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRC-211ENST00000484135 COX20Q5RI15 118 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRC-211ENST00000484135 C16orf46Q6P387 395 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRC-211ENST00000484135 TREML1Q86YW5 311 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRC-211ENST00000484135 TRIM11Q96F44 468 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRC-211ENST00000484135 PLVAPQ9BX97 442 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRC-211ENST00000484135 NCAPD3P42695 1498 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRC-211ENST00000484135 PEG3Q9GZU2 1588 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRC-211ENST00000484135 ITGB7P26010 798 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRC-211ENST00000484135 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP8.17□□□□□ -1.1
PTPRC-211ENST00000484135 SLC6A14Q9UN76 642 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRC-211ENST00000484135 SPDYE3A6NKU9 549 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRC-211ENST00000484135 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP8.16□□□□□ -1.1
PTPRC-211ENST00000484135 GRNP28799 593 aaKnown RBP8.16□□□□□ -1.1
PTPRC-211ENST00000484135 C8orf86Q6ZUL3 223 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRC-211ENST00000484135 RGL4Q8IZJ4 473 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRC-211ENST00000484135 MICALL1Q8N3F8 863 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRC-211ENST00000484135 COL26A1Q96A83 441 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRC-211ENST00000484135 DNAJB12Q9NXW2 375 aaKnown RBP8.16□□□□□ -1.1
PTPRC-211ENST00000484135 USP20Q9Y2K6 914 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRC-211ENST00000484135 STARD13Q9Y3M8 1113 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRC-211ENST00000484135 RARAP10276 462 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRC-211ENST00000484135 BRD2P25440 801 aaKnown RBP8.15□□□□□ -1.1
PTPRC-211ENST00000484135 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP8.15□□□□□ -1.1
PTPRC-211ENST00000484135 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP8.15□□□□□ -1.1
PTPRC-211ENST00000484135 SAP130Q9H0E3 1048 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRC-211ENST00000484135 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP8.15□□□□□ -1.1
PTPRC-211ENST00000484135 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP8.14□□□□□ -1.11
PTPRC-211ENST00000484135 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa8.14□□□□□ -1.11
PTPRC-211ENST00000484135 ATP2B4P23634 1241 aa8.14□□□□□ -1.11
PTPRC-211ENST00000484135 PRRT3Q5FWE3 981 aa8.14□□□□□ -1.11
PTPRC-211ENST00000484135 NBPF11Q86T75 865 aa8.14□□□□□ -1.11
PTPRC-211ENST00000484135 NUDT8Q8WV74 236 aa8.14□□□□□ -1.11
PTPRC-211ENST00000484135 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP8.14□□□□□ -1.11
PTPRC-211ENST00000484135 OPLAHO14841 1288 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRC-211ENST00000484135 LILRB5O75023 590 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRC-211ENST00000484135 SASH3O75995 380 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRC-211ENST00000484135 CAPN12Q6ZSI9 719 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRC-211ENST00000484135 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP8.13□□□□□ -1.11
PTPRC-211ENST00000484135 ZFP64Q9NPA5 681 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRC-211ENST00000484135 PRDM6Q9NQX0 595 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRC-211ENST00000484135 HMGXB3Q12766 1538 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRC-211ENST00000484135 XYLBO75191 536 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRC-211ENST00000484135 TARSP26639 723 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
PTPRC-211ENST00000484135 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP8.12□□□□□ -1.11
PTPRC-211ENST00000484135 PCSK7Q16549 785 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRC-211ENST00000484135 LCE3BQ5TA77 95 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRC-211ENST00000484135 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRC-211ENST00000484135 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRC-211ENST00000484135 C1orf115Q9H7X2 142 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRC-211ENST00000484135 C11orf16Q9NQ32 467 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRC-211ENST00000484135 ZFATQ9P243 1243 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRC-211ENST00000484135 NAGPAQ9UK23 515 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRC-211ENST00000484135 FAM229AH3BQW9 127 aa8.11□□□□□ -1.11
PTPRC-211ENST00000484135 MAP3K6O95382 1288 aa8.11□□□□□ -1.11
PTPRC-211ENST00000484135 NID1P14543 1247 aa8.11□□□□□ -1.11
PTPRC-211ENST00000484135 CPB1P15086 417 aa8.11□□□□□ -1.11
PTPRC-211ENST00000484135 C20orf204Q6ZNR8 217 aa8.11□□□□□ -1.11
PTPRC-211ENST00000484135 FAM35AQ86V20 835 aa8.11□□□□□ -1.11
PTPRC-211ENST00000484135 SLAIN2Q9P270 581 aa8.11□□□□□ -1.11
PTPRC-211ENST00000484135 TNFRSF10BO14763 440 aa8.1□□□□□ -1.11
PTPRC-211ENST00000484135 RGS9O75916 674 aaPredicted RBP8.1□□□□□ -1.11
PTPRC-211ENST00000484135 APBA3O96018 575 aa8.1□□□□□ -1.11
PTPRC-211ENST00000484135 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP8.1□□□□□ -1.11
PTPRC-211ENST00000484135 TRAPPC3LQ5T215 181 aa8.1□□□□□ -1.11
PTPRC-211ENST00000484135 ABTB2Q8N961 1025 aa8.1□□□□□ -1.11
PTPRC-211ENST00000484135 FAM13BQ9NYF5 915 aa8.1□□□□□ -1.11
PTPRC-211ENST00000484135 CCDC88BA6NC98 1476 aa8.1□□□□□ -1.11
PTPRC-211ENST00000484135 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
PTPRC-211ENST00000484135 GPLD1P80108 840 aa8.09□□□□□ -1.11
PTPRC-211ENST00000484135 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
PTPRC-211ENST00000484135 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
PTPRC-211ENST00000484135 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
PTPRC-211ENST00000484135 ARTNQ5T4W7 220 aa8.09□□□□□ -1.11
PTPRC-211ENST00000484135 BTBD11A6QL63 1104 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRC-211ENST00000484135 EGFRP00533 1210 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRC-211ENST00000484135 ZAP70P43403 619 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRC-211ENST00000484135 FAM26DQ5JW98 314 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRC-211ENST00000484135 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRC-211ENST00000484135 PIK3R5Q8WYR1 880 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRC-211ENST00000484135 STIM2Q9P246 746 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRC-211ENST00000484135 KCNMB2Q9Y691 235 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRC-211ENST00000484135 PSAPP07602 524 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRC-211ENST00000484135 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP8.07□□□□□ -1.12
PTPRC-211ENST00000484135 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP8.07□□□□□ -1.12
PTPRC-211ENST00000484135 HFE2Q6ZVN8 426 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRC-211ENST00000484135 TRPM4Q8TD43 1214 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRC-211ENST00000484135 SEPT3Q9UH03 358 aa8.07□□□□□ -1.12
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