RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477552.1

PTPRD-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 4

Gene PTPRD, Length 551 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-209ENST00000477552 GJB2P29033 226 aa9.94□□□□□ -0.82
PTPRD-209ENST00000477552 KIAA2012Q0VF49 1180 aa9.94□□□□□ -0.82
PTPRD-209ENST00000477552 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
PTPRD-209ENST00000477552 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
PTPRD-209ENST00000477552 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
PTPRD-209ENST00000477552 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
PTPRD-209ENST00000477552 PROSER3Q2NL68 480 aa9.94□□□□□ -0.82
PTPRD-209ENST00000477552 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
PTPRD-209ENST00000477552 RASEFQ8IZ41 740 aa9.94□□□□□ -0.82
PTPRD-209ENST00000477552 VSIG10Q8N0Z9 540 aa9.94□□□□□ -0.82
PTPRD-209ENST00000477552 FBXL16Q8N461 479 aa9.94□□□□□ -0.82
PTPRD-209ENST00000477552 KAZALD1Q96I82 304 aa9.94□□□□□ -0.82
PTPRD-209ENST00000477552 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
PTPRD-209ENST00000477552 DSCC1Q9BVC3 393 aa9.94□□□□□ -0.82
PTPRD-209ENST00000477552 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
PTPRD-209ENST00000477552 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
PTPRD-209ENST00000477552 A0A087WZG4 1122 aa9.93□□□□□ -0.82
PTPRD-209ENST00000477552 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa9.93□□□□□ -0.82
PTPRD-209ENST00000477552 CTAGE5O15320 804 aa9.93□□□□□ -0.82
PTPRD-209ENST00000477552 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
PTPRD-209ENST00000477552 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa9.93□□□□□ -0.82
PTPRD-209ENST00000477552 LRP10Q7Z4F1 713 aa9.93□□□□□ -0.82
PTPRD-209ENST00000477552 KBTBD3Q8NAB2 608 aa9.93□□□□□ -0.82
PTPRD-209ENST00000477552 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
PTPRD-209ENST00000477552 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
PTPRD-209ENST00000477552 NEK1Q96PY6 1258 aa9.93□□□□□ -0.82
PTPRD-209ENST00000477552 RRP9O43818 475 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
PTPRD-209ENST00000477552 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
PTPRD-209ENST00000477552 TAF5LO75529 589 aa9.92□□□□□ -0.82
PTPRD-209ENST00000477552 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
PTPRD-209ENST00000477552 ANXA1P04083 346 aa9.92□□□□□ -0.82
PTPRD-209ENST00000477552 PTMAP06454 111 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
PTPRD-209ENST00000477552 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
PTPRD-209ENST00000477552 MYL6BP14649 208 aa9.92□□□□□ -0.82
PTPRD-209ENST00000477552 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
PTPRD-209ENST00000477552 PTH1RQ03431 593 aa9.92□□□□□ -0.82
PTPRD-209ENST00000477552 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
PTPRD-209ENST00000477552 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa9.92□□□□□ -0.82
PTPRD-209ENST00000477552 CARD10Q9BWT7 1032 aa9.92□□□□□ -0.82
PTPRD-209ENST00000477552 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
PTPRD-209ENST00000477552 MTMR6Q9Y217 621 aa9.92□□□□□ -0.82
PTPRD-209ENST00000477552 WDR19Q8NEZ3 1342 aa9.91□□□□□ -0.82
PTPRD-209ENST00000477552 CYP27B1O15528 508 aa9.91□□□□□ -0.82
PTPRD-209ENST00000477552 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
PTPRD-209ENST00000477552 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa9.91□□□□□ -0.82
PTPRD-209ENST00000477552 CCDC83Q8IWF9 413 aa9.91□□□□□ -0.82
PTPRD-209ENST00000477552 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
PTPRD-209ENST00000477552 BOLA2Q9H3K6 86 aa9.91□□□□□ -0.82
PTPRD-209ENST00000477552 TNS2Q63HR2 1409 aa9.9□□□□□ -0.82
PTPRD-209ENST00000477552 IL2RBP14784 551 aa9.9□□□□□ -0.82
PTPRD-209ENST00000477552 CASP7P55210 303 aa9.9□□□□□ -0.82
PTPRD-209ENST00000477552 ME3Q16798 604 aa9.9□□□□□ -0.82
PTPRD-209ENST00000477552 CCDC158Q5M9N0 1113 aa9.9□□□□□ -0.82
PTPRD-209ENST00000477552 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa9.9□□□□□ -0.82
PTPRD-209ENST00000477552 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
PTPRD-209ENST00000477552 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
PTPRD-209ENST00000477552 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa9.9□□□□□ -0.82
PTPRD-209ENST00000477552 GTF3C6Q969F1 213 aa9.9□□□□□ -0.82
PTPRD-209ENST00000477552 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
PTPRD-209ENST00000477552 AK7Q96M32 723 aa9.9□□□□□ -0.82
PTPRD-209ENST00000477552 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
PTPRD-209ENST00000477552 PLA2G12BQ9BX93 195 aa9.9□□□□□ -0.82
PTPRD-209ENST00000477552 IL25Q9H293 177 aa9.9□□□□□ -0.82
PTPRD-209ENST00000477552 CEP126Q9P2H0 1117 aa9.9□□□□□ -0.82
PTPRD-209ENST00000477552 MYH15Q9Y2K3 1946 aa9.9□□□□□ -0.83
PTPRD-209ENST00000477552 A0A0D9SFI3 127 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRD-209ENST00000477552 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
PTPRD-209ENST00000477552 EYA2O00167 538 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRD-209ENST00000477552 STARD3NLO95772 234 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRD-209ENST00000477552 FGD1P98174 961 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRD-209ENST00000477552 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
PTPRD-209ENST00000477552 SLC39A6Q13433 755 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRD-209ENST00000477552 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
PTPRD-209ENST00000477552 MAP3K11Q16584 847 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRD-209ENST00000477552 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
PTPRD-209ENST00000477552 FAM227BQ96M60 508 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRD-209ENST00000477552 AGXT2Q9BYV1 514 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRD-209ENST00000477552 PAG1Q9NWQ8 432 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRD-209ENST00000477552 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
PTPRD-209ENST00000477552 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
PTPRD-209ENST00000477552 CNPY2Q9Y2B0 182 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRD-209ENST00000477552 USP16Q9Y5T5 823 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRD-209ENST00000477552 LRP6O75581 1613 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRD-209ENST00000477552 GLI3P10071 1580 aa9.88□□□□□ -0.83
PTPRD-209ENST00000477552 STRCP1A6NGW2 1772 aa9.88□□□□□ -0.83
PTPRD-209ENST00000477552 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
PTPRD-209ENST00000477552 MYH7P12883 1935 aa9.88□□□□□ -0.83
PTPRD-209ENST00000477552 H3BQV1 296 aa9.88□□□□□ -0.83
PTPRD-209ENST00000477552 PFKFB2O60825 505 aa9.88□□□□□ -0.83
PTPRD-209ENST00000477552 KDM4AO75164 1064 aa9.88□□□□□ -0.83
PTPRD-209ENST00000477552 TFCP2Q12800 502 aa9.88□□□□□ -0.83
PTPRD-209ENST00000477552 CCDC57Q2TAC2 916 aa9.88□□□□□ -0.83
PTPRD-209ENST00000477552 ADCK5Q3MIX3 580 aa9.88□□□□□ -0.83
PTPRD-209ENST00000477552 IFFO2Q5TF58 517 aa9.88□□□□□ -0.83
PTPRD-209ENST00000477552 LMBR1LQ6UX01 489 aa9.88□□□□□ -0.83
PTPRD-209ENST00000477552 KIF6Q6ZMV9 814 aa9.88□□□□□ -0.83
PTPRD-209ENST00000477552 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
PTPRD-209ENST00000477552 SPATA32Q96LK8 384 aa9.88□□□□□ -0.83
PTPRD-209ENST00000477552 PRIMPOLQ96LW4 560 aa9.88□□□□□ -0.83
PTPRD-209ENST00000477552 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33 ms