RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477216.1

SKIL-208, Transcript of SKI like proto-oncogene, human

TSL 4

Gene SKIL, Length 554 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SKIL-208	ENST00000477216	CRY2	Q49AN0	593 aa		31.94	■■■□□ 2.7
SKIL-208	ENST00000477216	RPGR	Q92834	1020 aa	Known RBP	31.94	■■■□□ 2.7
SKIL-208	ENST00000477216	ZNF428	Q96B54	188 aa		31.93	■■■□□ 2.7
SKIL-208	ENST00000477216	FAM177B	A6PVY3	158 aa		31.92	■■■□□ 2.7
SKIL-208	ENST00000477216	HSPA8	P11142	646 aa	Known RBP	31.92	■■■□□ 2.7
SKIL-208	ENST00000477216	USP50	Q70EL3	339 aa	Predicted RBP	31.91	■■■□□ 2.7
SKIL-208	ENST00000477216	G2E3	Q7L622	706 aa		31.9	■■■□□ 2.7
SKIL-208	ENST00000477216	PLBD2	Q8NHP8	589 aa		31.9	■■■□□ 2.7
SKIL-208	ENST00000477216	ABHD8	Q96I13	439 aa		31.9	■■■□□ 2.7
SKIL-208	ENST00000477216	VPS33B	Q9H267	617 aa		31.9	■■■□□ 2.7
SKIL-208	ENST00000477216	GJA3	Q9Y6H8	435 aa		31.9	■■■□□ 2.7
SKIL-208	ENST00000477216	IBTK	Q9P2D0	1353 aa	Predicted RBP	31.9	■■■□□ 2.7
SKIL-208	ENST00000477216	RIC1	Q4ADV7	1423 aa		31.9	■■■□□ 2.7
SKIL-208	ENST00000477216	GIGYF2	Q6Y7W6	1299 aa	Known RBP	31.89	■■■□□ 2.7
SKIL-208	ENST00000477216	ANKRD13D	Q6ZTN6	518 aa		31.89	■■■□□ 2.7
SKIL-208	ENST00000477216	RBM17	Q96I25	401 aa	Known RBP	31.89	■■■□□ 2.7
SKIL-208	ENST00000477216	HOXA10	P31260	410 aa	Predicted RBP	31.88	■■■□□ 2.69
SKIL-208	ENST00000477216	OLFM4	Q6UX06	510 aa		31.88	■■■□□ 2.69
SKIL-208	ENST00000477216	LARGE2	Q8N3Y3	721 aa		31.88	■■■□□ 2.69
SKIL-208	ENST00000477216	SSH1	Q8WYL5	1049 aa		31.88	■■■□□ 2.69
SKIL-208	ENST00000477216	DDX58	O95786	925 aa	Known RBP	31.87	■■■□□ 2.69
SKIL-208	ENST00000477216	FLII	Q13045	1269 aa		31.87	■■■□□ 2.69
SKIL-208	ENST00000477216	ALDH1L2	Q3SY69	923 aa		31.87	■■■□□ 2.69
SKIL-208	ENST00000477216	CACNA1F	O60840	1977 aa		31.87	■■■□□ 2.69
SKIL-208	ENST00000477216	PAXIP1	Q6ZW49	1069 aa	Predicted RBP	31.86	■■■□□ 2.69
SKIL-208	ENST00000477216	CA12	O43570	354 aa		31.85	■■■□□ 2.69
SKIL-208	ENST00000477216	NIM1K	Q8IY84	436 aa		31.85	■■■□□ 2.69
SKIL-208	ENST00000477216	MRPL50	Q8N5N7	158 aa	Known RBP	31.85	■■■□□ 2.69
SKIL-208	ENST00000477216	CAPNS2	Q96L46	248 aa		31.85	■■■□□ 2.69
SKIL-208	ENST00000477216	CRAMP1	Q96RY5	1269 aa		31.85	■■■□□ 2.69
SKIL-208	ENST00000477216	BCL2L13	Q9BXK5	485 aa		31.85	■■■□□ 2.69
SKIL-208	ENST00000477216	SNED1	Q8TER0	1413 aa		31.84	■■■□□ 2.69
SKIL-208	ENST00000477216	NUP98	P52948	1817 aa		31.84	■■■□□ 2.69
SKIL-208	ENST00000477216	MAP2K2	P36507	400 aa		31.84	■■■□□ 2.69
SKIL-208	ENST00000477216	RIC3	Q7Z5B4	369 aa		31.84	■■■□□ 2.69
SKIL-208	ENST00000477216	SMC4	Q9NTJ3	1288 aa		31.84	■■■□□ 2.69
SKIL-208	ENST00000477216	HSP90AB3P	Q58FF7	597 aa		31.83	■■■□□ 2.69
SKIL-208	ENST00000477216	GPR101	Q96P66	508 aa	Predicted RBP	31.83	■■■□□ 2.69
SKIL-208	ENST00000477216	RARS	P54136	660 aa	Known RBP	31.82	■■■□□ 2.68
SKIL-208	ENST00000477216	FKBP5	Q13451	457 aa	Predicted RBP	31.82	■■■□□ 2.68
SKIL-208	ENST00000477216	SUPT20H	Q8NEM7	779 aa		31.82	■■■□□ 2.68
SKIL-208	ENST00000477216	GPT	P24298	496 aa		31.81	■■■□□ 2.68
SKIL-208	ENST00000477216	TCIRG1	Q13488	830 aa		31.81	■■■□□ 2.68
SKIL-208	ENST00000477216	KSR2	Q6VAB6	950 aa		31.81	■■■□□ 2.68
SKIL-208	ENST00000477216	PPP1R42	Q7Z4L9	355 aa		31.81	■■■□□ 2.68
SKIL-208	ENST00000477216	ZNF34	Q8IZ26	560 aa		31.81	■■■□□ 2.68
SKIL-208	ENST00000477216	THSD7B	Q9C0I4	1608 aa		31.81	■■■□□ 2.68
SKIL-208	ENST00000477216	PI4KAP2	A4QPH2	592 aa		31.8	■■■□□ 2.68
SKIL-208	ENST00000477216	PPEF1	O14829	653 aa	Predicted RBP	31.8	■■■□□ 2.68
SKIL-208	ENST00000477216	SCNN1D	P51172	638 aa		31.8	■■■□□ 2.68
SKIL-208	ENST00000477216	NUTM1	Q86Y26	1132 aa		31.8	■■■□□ 2.68
SKIL-208	ENST00000477216	PI4KAP1	Q8N8J0	262 aa		31.8	■■■□□ 2.68
SKIL-208	ENST00000477216	MAP3K2	Q9Y2U5	619 aa		31.8	■■■□□ 2.68
SKIL-208	ENST00000477216	TRPM7	Q96QT4	1865 aa		31.79	■■■□□ 2.68
SKIL-208	ENST00000477216	ADARB2	Q9NS39	739 aa	Known RBP	31.79	■■■□□ 2.68
SKIL-208	ENST00000477216	TLL2	Q9Y6L7	1015 aa		31.79	■■■□□ 2.68
SKIL-208	ENST00000477216	UBN2	Q6ZU65	1347 aa		31.78	■■■□□ 2.68
SKIL-208	ENST00000477216	SLC34A2	O95436	690 aa		31.78	■■■□□ 2.68
SKIL-208	ENST00000477216	HHIPL1	Q96JK4	782 aa		31.78	■■■□□ 2.68
SKIL-208	ENST00000477216	ABCC12	Q96J65	1359 aa		31.78	■■■□□ 2.68
SKIL-208	ENST00000477216	EPS15	P42566	896 aa		31.77	■■■□□ 2.68
SKIL-208	ENST00000477216	PARP10	Q53GL7	1025 aa		31.77	■■■□□ 2.68
SKIL-208	ENST00000477216	NLRP3	Q96P20	1036 aa		31.77	■■■□□ 2.68
SKIL-208	ENST00000477216	CDHR2	Q9BYE9	1310 aa		31.76	■■■□□ 2.68
SKIL-208	ENST00000477216	PPIP5K2	O43314	1243 aa		31.76	■■■□□ 2.67
SKIL-208	ENST00000477216	MLLT1	Q03111	559 aa	Predicted RBP	31.76	■■■□□ 2.67
SKIL-208	ENST00000477216	METTL22	Q9BUU2	404 aa	Predicted RBP	31.76	■■■□□ 2.67
SKIL-208	ENST00000477216	ANKRD36C	Q5JPF3	1778 aa		31.76	■■■□□ 2.67
SKIL-208	ENST00000477216	FAM161A	Q3B820	660 aa		31.75	■■■□□ 2.67
SKIL-208	ENST00000477216	MYD88	Q99836	296 aa		31.75	■■■□□ 2.67
SKIL-208	ENST00000477216	ISCA1	Q9BUE6	129 aa		31.75	■■■□□ 2.67
SKIL-208	ENST00000477216	ATP5J2-PTCD1	G3V325	749 aa		31.74	■■■□□ 2.67
SKIL-208	ENST00000477216	BRPF1	P55201	1214 aa	Predicted RBP	31.74	■■■□□ 2.67
SKIL-208	ENST00000477216	GPRC5D	Q9NZD1	345 aa		31.74	■■■□□ 2.67
SKIL-208	ENST00000477216	CCDC85C	A6NKD9	419 aa		31.73	■■■□□ 2.67
SKIL-208	ENST00000477216	SUSD4	Q5VX71	490 aa		31.73	■■■□□ 2.67
SKIL-208	ENST00000477216	CYP4F22	Q6NT55	531 aa		31.73	■■■□□ 2.67
SKIL-208	ENST00000477216	NLRP10	Q86W26	655 aa		31.73	■■■□□ 2.67
SKIL-208	ENST00000477216	DNAAF4	Q8WXU2	420 aa		31.73	■■■□□ 2.67
SKIL-208	ENST00000477216	PTPRC	P08575	1304 aa		31.73	■■■□□ 2.67
SKIL-208	ENST00000477216	RGS19	P49795	217 aa		31.72	■■■□□ 2.67
SKIL-208	ENST00000477216	GRM1	Q13255	1194 aa		31.72	■■■□□ 2.67
SKIL-208	ENST00000477216	ZC3H15	Q8WU90	426 aa	Known RBP	31.72	■■■□□ 2.67
SKIL-208	ENST00000477216	ZNRF3	Q9ULT6	936 aa		31.72	■■■□□ 2.67
SKIL-208	ENST00000477216	ATP6V0A2	Q9Y487	856 aa		31.72	■■■□□ 2.67
SKIL-208	ENST00000477216		F6X3S4	739 aa		31.71	■■■□□ 2.67
SKIL-208	ENST00000477216	TRIM28	Q13263	835 aa	Known RBP	31.71	■■■□□ 2.67
SKIL-208	ENST00000477216	CST9	Q5W186	159 aa		31.71	■■■□□ 2.67
SKIL-208	ENST00000477216	LTBP1	Q14766	1721 aa		31.7	■■■□□ 2.67
SKIL-208	ENST00000477216	BCAR3	O75815	825 aa		31.7	■■■□□ 2.67
SKIL-208	ENST00000477216	NEXN	Q0ZGT2	675 aa		31.7	■■■□□ 2.67
SKIL-208	ENST00000477216	KIF16B	Q96L93	1317 aa		31.7	■■■□□ 2.66
SKIL-208	ENST00000477216	NTSR2	O95665	410 aa		31.69	■■■□□ 2.66
SKIL-208	ENST00000477216	TNIP1	Q15025	636 aa		31.69	■■■□□ 2.66
SKIL-208	ENST00000477216	NOB1	Q9ULX3	412 aa	Known RBP	31.69	■■■□□ 2.66
SKIL-208	ENST00000477216	BBOX1	O75936	387 aa		31.68	■■■□□ 2.66
SKIL-208	ENST00000477216	SAPCD2	Q86UD0	394 aa		31.68	■■■□□ 2.66
SKIL-208	ENST00000477216	UTP14A	Q9BVJ6	771 aa	Known RBP	31.68	■■■□□ 2.66
SKIL-208	ENST00000477216	RTFDC1	Q9BY42	306 aa	Predicted RBP	31.68	■■■□□ 2.66
SKIL-208	ENST00000477216	COL4A5	P29400	1685 aa		31.67	■■■□□ 2.66

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