RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469694.5

GPC1-208, Transcript of glypican 1, humanhuman

TSL 2

Gene GPC1, Length 2,862 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1-208ENST00000469694 STAP2Q9UGK3 403 aa16.6■□□□□ 0.25
GPC1-208ENST00000469694 USP25Q9UHP3 1055 aa16.6■□□□□ 0.25
GPC1-208ENST00000469694 ANKRD7Q92527 254 aa16.59■□□□□ 0.25
GPC1-208ENST00000469694 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa16.59■□□□□ 0.25
GPC1-208ENST00000469694 SASH1O94885 1247 aa16.59■□□□□ 0.25
GPC1-208ENST00000469694 ADCY5O95622 1261 aa16.59■□□□□ 0.25
GPC1-208ENST00000469694 TAF3Q5VWG9 929 aa16.59■□□□□ 0.25
GPC1-208ENST00000469694 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP16.59■□□□□ 0.25
GPC1-208ENST00000469694 PI4K2BQ8TCG2 481 aa16.58■□□□□ 0.25
GPC1-208ENST00000469694 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP16.58■□□□□ 0.24
GPC1-208ENST00000469694 PDE4CQ08493 712 aa16.58■□□□□ 0.24
GPC1-208ENST00000469694 CASC1Q6TDU7 716 aa16.58■□□□□ 0.24
GPC1-208ENST00000469694 TMX3Q96JJ7 454 aa16.58■□□□□ 0.24
GPC1-208ENST00000469694 IL25Q9H293 177 aa16.58■□□□□ 0.24
GPC1-208ENST00000469694 UBR2Q8IWV8 1755 aa16.57■□□□□ 0.24
GPC1-208ENST00000469694 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP16.57■□□□□ 0.24
GPC1-208ENST00000469694 DDB1Q16531 1140 aa16.57■□□□□ 0.24
GPC1-208ENST00000469694 REC8O95072 547 aa16.57■□□□□ 0.24
GPC1-208ENST00000469694 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa16.57■□□□□ 0.24
GPC1-208ENST00000469694 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa16.56■□□□□ 0.24
GPC1-208ENST00000469694 AACSQ86V21 672 aa16.56■□□□□ 0.24
GPC1-208ENST00000469694 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP16.56■□□□□ 0.24
GPC1-208ENST00000469694 C8orf37Q96NL8 207 aa16.56■□□□□ 0.24
GPC1-208ENST00000469694 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP16.56■□□□□ 0.24
GPC1-208ENST00000469694 TMEM51Q9NW97 253 aa16.56■□□□□ 0.24
GPC1-208ENST00000469694 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP16.56■□□□□ 0.24
GPC1-208ENST00000469694 CHMP3Q9Y3E7 222 aa16.56■□□□□ 0.24
GPC1-208ENST00000469694 FEZ1Q99689 392 aa16.56■□□□□ 0.24
GPC1-208ENST00000469694 CTIFO43310 598 aaKnown RBP16.56■□□□□ 0.24
GPC1-208ENST00000469694 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP16.56■□□□□ 0.24
GPC1-208ENST00000469694 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP16.56■□□□□ 0.24
GPC1-208ENST00000469694 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP16.56■□□□□ 0.24
GPC1-208ENST00000469694 HDAC5Q9UQL6 1122 aa16.56■□□□□ 0.24
GPC1-208ENST00000469694 BCL9O00512 1426 aa16.55■□□□□ 0.24
GPC1-208ENST00000469694 PAPPAQ13219 1627 aa16.55■□□□□ 0.24
GPC1-208ENST00000469694 LAMB4A4D0S4 1761 aa16.55■□□□□ 0.24
GPC1-208ENST00000469694 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP16.55■□□□□ 0.24
GPC1-208ENST00000469694 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP16.55■□□□□ 0.24
GPC1-208ENST00000469694 CHMLP26374 656 aa16.55■□□□□ 0.24
GPC1-208ENST00000469694 CASP7P55210 303 aa16.55■□□□□ 0.24
GPC1-208ENST00000469694 LMBR1LQ6UX01 489 aa16.55■□□□□ 0.24
GPC1-208ENST00000469694 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa16.55■□□□□ 0.24
GPC1-208ENST00000469694 ERC2O15083 957 aa16.55■□□□□ 0.24
GPC1-208ENST00000469694 CUL4AQ13619 759 aa16.55■□□□□ 0.24
GPC1-208ENST00000469694 KIAA1524Q8TCG1 905 aa16.55■□□□□ 0.24
GPC1-208ENST00000469694 IGSF3O75054 1194 aa16.54■□□□□ 0.24
GPC1-208ENST00000469694 NEK4P51957 841 aa16.54■□□□□ 0.24
GPC1-208ENST00000469694 PLCH1Q4KWH8 1693 aa16.54■□□□□ 0.24
GPC1-208ENST00000469694 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP16.54■□□□□ 0.24
GPC1-208ENST00000469694 MCM2P49736 904 aa16.54■□□□□ 0.24
GPC1-208ENST00000469694 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP16.54■□□□□ 0.24
GPC1-208ENST00000469694 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP16.53■□□□□ 0.24
GPC1-208ENST00000469694 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP16.53■□□□□ 0.24
GPC1-208ENST00000469694 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP16.53■□□□□ 0.24
GPC1-208ENST00000469694 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa16.53■□□□□ 0.24
GPC1-208ENST00000469694 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa16.53■□□□□ 0.24
GPC1-208ENST00000469694 STARD3NLO95772 234 aa16.53■□□□□ 0.24
GPC1-208ENST00000469694 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP16.53■□□□□ 0.24
GPC1-208ENST00000469694 USP48Q86UV5 1035 aa16.53■□□□□ 0.24
GPC1-208ENST00000469694 KDM4AO75164 1064 aa16.52■□□□□ 0.24
GPC1-208ENST00000469694 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP16.52■□□□□ 0.24
GPC1-208ENST00000469694 SYNE4Q8N205 404 aa16.52■□□□□ 0.24
GPC1-208ENST00000469694 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP16.52■□□□□ 0.24
GPC1-208ENST00000469694 NGLY1Q96IV0 654 aa16.52■□□□□ 0.24
GPC1-208ENST00000469694 OGFRQ9NZT2 677 aa16.52■□□□□ 0.24
GPC1-208ENST00000469694 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa16.52■□□□□ 0.24
GPC1-208ENST00000469694 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa16.52■□□□□ 0.24
GPC1-208ENST00000469694 ITGB4P16144 1822 aa16.52■□□□□ 0.24
GPC1-208ENST00000469694 GPTP24298 496 aa16.52■□□□□ 0.24
GPC1-208ENST00000469694 HLFQ16534 295 aa16.52■□□□□ 0.24
GPC1-208ENST00000469694 GDPD2Q9HCC8 539 aa16.52■□□□□ 0.24
GPC1-208ENST00000469694 ANO2Q9NQ90 1003 aa16.52■□□□□ 0.24
GPC1-208ENST00000469694 H7C1W4 665 aa16.52■□□□□ 0.23
GPC1-208ENST00000469694 KCNQ2O43526 872 aa16.52■□□□□ 0.23
GPC1-208ENST00000469694 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP16.52■□□□□ 0.23
GPC1-208ENST00000469694 FOXO4P98177 505 aa16.52■□□□□ 0.23
GPC1-208ENST00000469694 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP16.52■□□□□ 0.23
GPC1-208ENST00000469694 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP16.52■□□□□ 0.23
GPC1-208ENST00000469694 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP16.51■□□□□ 0.23
GPC1-208ENST00000469694 ERC1Q8IUD2 1116 aa16.51■□□□□ 0.23
GPC1-208ENST00000469694 PALD1Q9ULE6 856 aa16.51■□□□□ 0.23
GPC1-208ENST00000469694 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP16.51■□□□□ 0.23
GPC1-208ENST00000469694 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP16.51■□□□□ 0.23
GPC1-208ENST00000469694 CCDC183Q5T5S1 534 aa16.51■□□□□ 0.23
GPC1-208ENST00000469694 FAM89AQ96GI7 184 aa16.51■□□□□ 0.23
GPC1-208ENST00000469694 ECHDC1Q9NTX5 307 aa16.51■□□□□ 0.23
GPC1-208ENST00000469694 TFCP2Q12800 502 aa16.5■□□□□ 0.23
GPC1-208ENST00000469694 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP16.5■□□□□ 0.23
GPC1-208ENST00000469694 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP16.5■□□□□ 0.23
GPC1-208ENST00000469694 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa16.5■□□□□ 0.23
GPC1-208ENST00000469694 AOX1Q06278 1338 aa16.5■□□□□ 0.23
GPC1-208ENST00000469694 KCNF1Q9H3M0 494 aa16.5■□□□□ 0.23
GPC1-208ENST00000469694 PYCARDQ9ULZ3 195 aa16.5■□□□□ 0.23
GPC1-208ENST00000469694 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa16.5■□□□□ 0.23
GPC1-208ENST00000469694 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP16.49■□□□□ 0.23
GPC1-208ENST00000469694 KCNQ4P56696 695 aa16.49■□□□□ 0.23
GPC1-208ENST00000469694 TCIRG1Q13488 830 aa16.49■□□□□ 0.23
GPC1-208ENST00000469694 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP16.49■□□□□ 0.23
GPC1-208ENST00000469694 KIF6Q6ZMV9 814 aa16.49■□□□□ 0.23
GPC1-208ENST00000469694 CCDC191Q8NCU4 936 aa16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.4 ms