RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468371.5

SHQ1-205, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SHQ1, Length 4,024 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SHQ1-205ENST00000468371 RNF123Q5XPI4 1314 aa7.3□□□□□ -1.24
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SHQ1-205ENST00000468371 CCDC27Q2M243 656 aa7.28□□□□□ -1.24
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SHQ1-205ENST00000468371 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
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SHQ1-205ENST00000468371 ATP10DQ9P241 1426 aa7.25□□□□□ -1.25
SHQ1-205ENST00000468371 CTSWP56202 376 aa7.25□□□□□ -1.25
SHQ1-205ENST00000468371 SLF2Q8IX21 1173 aa7.25□□□□□ -1.25
SHQ1-205ENST00000468371 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
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SHQ1-205ENST00000468371 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
SHQ1-205ENST00000468371 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
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