RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467748.1

RABGGTB-206, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTB, Length 468 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-206ENST00000467748 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP8.15□□□□□ -1.1
RABGGTB-206ENST00000467748 EPB42P16452 691 aa8.14□□□□□ -1.11
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RABGGTB-206ENST00000467748 NEUROD1Q13562 356 aa8.14□□□□□ -1.11
RABGGTB-206ENST00000467748 PNMA5Q96PV4 448 aa8.14□□□□□ -1.11
RABGGTB-206ENST00000467748 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP8.14□□□□□ -1.11
RABGGTB-206ENST00000467748 MKL2Q9ULH7 1088 aa8.14□□□□□ -1.11
RABGGTB-206ENST00000467748 KCNMB2Q9Y691 235 aa8.14□□□□□ -1.11
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RABGGTB-206ENST00000467748 COL8A1P27658 744 aa8.13□□□□□ -1.11
RABGGTB-206ENST00000467748 MTMR3Q13615 1198 aa8.13□□□□□ -1.11
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RABGGTB-206ENST00000467748 DNAJB12Q9NXW2 375 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
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RABGGTB-206ENST00000467748 ZNF587Q96SQ5 575 aaPredicted RBP8.11□□□□□ -1.11
RABGGTB-206ENST00000467748 NAGPAQ9UK23 515 aa8.11□□□□□ -1.11
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RABGGTB-206ENST00000467748 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP8.1□□□□□ -1.11
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RABGGTB-206ENST00000467748 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
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RABGGTB-206ENST00000467748 HELQQ8TDG4 1101 aa8.09□□□□□ -1.11
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RABGGTB-206ENST00000467748 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa8.09□□□□□ -1.11
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RABGGTB-206ENST00000467748 KRBA1A5PL33 1030 aa8.07□□□□□ -1.12
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RABGGTB-206ENST00000467748 J3QW42 95 aa8.04□□□□□ -1.12
RABGGTB-206ENST00000467748 NID1P14543 1247 aa8.04□□□□□ -1.12
RABGGTB-206ENST00000467748 EIF1AXP47813 144 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
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RABGGTB-206ENST00000467748 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
RABGGTB-206ENST00000467748 SERPINB4P48594 390 aa8.03□□□□□ -1.12
RABGGTB-206ENST00000467748 GPLD1P80108 840 aa8.03□□□□□ -1.12
RABGGTB-206ENST00000467748 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP8.03□□□□□ -1.12
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RABGGTB-206ENST00000467748 PERM1Q5SV97 790 aa8.03□□□□□ -1.12
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RABGGTB-206ENST00000467748 LPIN3Q9BQK8 851 aa8.03□□□□□ -1.12
RABGGTB-206ENST00000467748 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa8.03□□□□□ -1.12
RABGGTB-206ENST00000467748 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa8.03□□□□□ -1.12
RABGGTB-206ENST00000467748 LILRB5O75023 590 aa8.02□□□□□ -1.13
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RABGGTB-206ENST00000467748 PRDM6Q9NQX0 595 aa8.02□□□□□ -1.13
RABGGTB-206ENST00000467748 FAM13BQ9NYF5 915 aa8.02□□□□□ -1.13
RABGGTB-206ENST00000467748 RGS9O75916 674 aaPredicted RBP8.01□□□□□ -1.13
RABGGTB-206ENST00000467748 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP8.01□□□□□ -1.13
RABGGTB-206ENST00000467748 PSAPP07602 524 aa8.01□□□□□ -1.13
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RABGGTB-206ENST00000467748 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP8.01□□□□□ -1.13
RABGGTB-206ENST00000467748 NRLP54845 237 aa8.01□□□□□ -1.13
RABGGTB-206ENST00000467748 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP8.01□□□□□ -1.13
RABGGTB-206ENST00000467748 BTBD11A6QL63 1104 aa8□□□□□ -1.13
RABGGTB-206ENST00000467748 PDGFAP04085 211 aa8□□□□□ -1.13
RABGGTB-206ENST00000467748 GRIK5Q16478 980 aa8□□□□□ -1.13
RABGGTB-206ENST00000467748 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa8□□□□□ -1.13
RABGGTB-206ENST00000467748 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
RABGGTB-206ENST00000467748 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
RABGGTB-206ENST00000467748 TMEM63CQ9P1W3 806 aa8□□□□□ -1.13
RABGGTB-206ENST00000467748 POLIQ9UNA4 740 aa8□□□□□ -1.13
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