RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466222.6

CAPN3-209, Transcript of calpain 3, humanhuman

TSL 2

Gene CAPN3, Length 1,934 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN3-209ENST00000466222 RGL2O15211 777 aa22.92■■□□□ 1.26
CAPN3-209ENST00000466222 PDE8AO60658 829 aa22.92■■□□□ 1.26
CAPN3-209ENST00000466222 NFKBIBQ15653 356 aa22.92■■□□□ 1.26
CAPN3-209ENST00000466222 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
CAPN3-209ENST00000466222 NUP98P52948 1817 aa22.91■■□□□ 1.26
CAPN3-209ENST00000466222 SASH1O94885 1247 aa22.91■■□□□ 1.26
CAPN3-209ENST00000466222 COPRSQ9NQ92 184 aa22.91■■□□□ 1.26
CAPN3-209ENST00000466222 BECN1Q14457 450 aa22.9■■□□□ 1.26
CAPN3-209ENST00000466222 SLC15A2Q16348 729 aa22.9■■□□□ 1.26
CAPN3-209ENST00000466222 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
CAPN3-209ENST00000466222 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
CAPN3-209ENST00000466222 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
CAPN3-209ENST00000466222 RAB11FIP3O75154 756 aa22.89■■□□□ 1.25
CAPN3-209ENST00000466222 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP22.89■■□□□ 1.25
CAPN3-209ENST00000466222 CCDC57Q2TAC2 916 aa22.89■■□□□ 1.25
CAPN3-209ENST00000466222 LRRC24Q50LG9 513 aa22.89■■□□□ 1.25
CAPN3-209ENST00000466222 TSHZ3Q63HK5 1081 aa22.89■■□□□ 1.25
CAPN3-209ENST00000466222 ABCC12Q96J65 1359 aa22.89■■□□□ 1.25
CAPN3-209ENST00000466222 ITGA6P23229 1130 aa22.88■■□□□ 1.25
CAPN3-209ENST00000466222 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa22.88■■□□□ 1.25
CAPN3-209ENST00000466222 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
CAPN3-209ENST00000466222 TM4SF1P30408 202 aa22.88■■□□□ 1.25
CAPN3-209ENST00000466222 SLC4A3P48751 1232 aa22.88■■□□□ 1.25
CAPN3-209ENST00000466222 KIF1BPQ96EK5 621 aa22.88■■□□□ 1.25
CAPN3-209ENST00000466222 SEC31BQ9NQW1 1179 aa22.88■■□□□ 1.25
CAPN3-209ENST00000466222 BCORQ6W2J9 1755 aa22.87■■□□□ 1.25
CAPN3-209ENST00000466222 SCN7AQ01118 1682 aa22.87■■□□□ 1.25
CAPN3-209ENST00000466222 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
CAPN3-209ENST00000466222 MSL1Q68DK7 614 aa22.87■■□□□ 1.25
CAPN3-209ENST00000466222 DDR1Q08345 913 aa22.86■■□□□ 1.25
CAPN3-209ENST00000466222 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa22.86■■□□□ 1.25
CAPN3-209ENST00000466222 TPTE2Q6XPS3 522 aa22.86■■□□□ 1.25
CAPN3-209ENST00000466222 ATG9AQ7Z3C6 839 aa22.86■■□□□ 1.25
CAPN3-209ENST00000466222 UBR3Q6ZT12 1888 aa22.86■■□□□ 1.25
CAPN3-209ENST00000466222 C4AP0C0L4 1744 aa22.86■■□□□ 1.25
CAPN3-209ENST00000466222 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
CAPN3-209ENST00000466222 STK32BQ9NY57 414 aa22.86■■□□□ 1.25
CAPN3-209ENST00000466222 TFCP2Q12800 502 aa22.85■■□□□ 1.25
CAPN3-209ENST00000466222 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa22.85■■□□□ 1.25
CAPN3-209ENST00000466222 NPHP1O15259 732 aa22.84■■□□□ 1.25
CAPN3-209ENST00000466222 NYXQ9GZU5 481 aa22.84■■□□□ 1.25
CAPN3-209ENST00000466222 CARMIL3Q8ND23 1372 aa22.84■■□□□ 1.25
CAPN3-209ENST00000466222 SERPINB2P05120 415 aa22.84■■□□□ 1.25
CAPN3-209ENST00000466222 SLC10A5Q5PT55 438 aa22.83■■□□□ 1.25
CAPN3-209ENST00000466222 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa22.82■■□□□ 1.24
CAPN3-209ENST00000466222 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
CAPN3-209ENST00000466222 TAF7LQ5H9L4 462 aa22.82■■□□□ 1.24
CAPN3-209ENST00000466222 PRR5LQ6MZQ0 368 aa22.82■■□□□ 1.24
CAPN3-209ENST00000466222 FLAD1Q8NFF5 587 aa22.82■■□□□ 1.24
CAPN3-209ENST00000466222 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
CAPN3-209ENST00000466222 SALL3Q9BXA9 1300 aa22.82■■□□□ 1.24
CAPN3-209ENST00000466222 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
CAPN3-209ENST00000466222 EYA2O00167 538 aa22.82■■□□□ 1.24
CAPN3-209ENST00000466222 ERC1Q8IUD2 1116 aa22.82■■□□□ 1.24
CAPN3-209ENST00000466222 CNBD1Q8NA66 436 aa22.82■■□□□ 1.24
CAPN3-209ENST00000466222 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
CAPN3-209ENST00000466222 SEC24BO95487 1268 aa22.81■■□□□ 1.24
CAPN3-209ENST00000466222 TBC1D32Q96NH3 1257 aa22.81■■□□□ 1.24
CAPN3-209ENST00000466222 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
CAPN3-209ENST00000466222 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
CAPN3-209ENST00000466222 PDE1AP54750 535 aa22.8■■□□□ 1.24
CAPN3-209ENST00000466222 GSE1Q14687 1217 aa22.8■■□□□ 1.24
CAPN3-209ENST00000466222 CCDC152Q4G0S7 254 aa22.8■■□□□ 1.24
CAPN3-209ENST00000466222 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa22.8■■□□□ 1.24
CAPN3-209ENST00000466222 CCDC125Q86Z20 511 aa22.8■■□□□ 1.24
CAPN3-209ENST00000466222 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
CAPN3-209ENST00000466222 NLGN1Q8N2Q7 840 aa22.8■■□□□ 1.24
CAPN3-209ENST00000466222 AACSQ86V21 672 aa22.8■■□□□ 1.24
CAPN3-209ENST00000466222 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP22.79■■□□□ 1.24
CAPN3-209ENST00000466222 NLRP3Q96P20 1036 aa22.79■■□□□ 1.24
CAPN3-209ENST00000466222 MMP10P09238 476 aa22.78■■□□□ 1.24
CAPN3-209ENST00000466222 MX1P20591 662 aa22.78■■□□□ 1.24
CAPN3-209ENST00000466222 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
CAPN3-209ENST00000466222 IL15P40933 162 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
CAPN3-209ENST00000466222 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa22.78■■□□□ 1.24
CAPN3-209ENST00000466222 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
CAPN3-209ENST00000466222 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
CAPN3-209ENST00000466222 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa22.77■■□□□ 1.24
CAPN3-209ENST00000466222 CIAO1O76071 339 aa22.76■■□□□ 1.23
CAPN3-209ENST00000466222 TNNI3KQ59H18 835 aa22.76■■□□□ 1.23
CAPN3-209ENST00000466222 CNNM1Q9NRU3 951 aa22.76■■□□□ 1.23
CAPN3-209ENST00000466222 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa22.76■■□□□ 1.23
CAPN3-209ENST00000466222 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
CAPN3-209ENST00000466222 TIMM10P62072 90 aa22.76■■□□□ 1.23
CAPN3-209ENST00000466222 SLC51AQ86UW1 340 aa22.76■■□□□ 1.23
CAPN3-209ENST00000466222 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
CAPN3-209ENST00000466222 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
CAPN3-209ENST00000466222 COL4A1P02462 1669 aa22.75■■□□□ 1.23
CAPN3-209ENST00000466222 TTC22Q5TAA0 569 aa22.75■■□□□ 1.23
CAPN3-209ENST00000466222 SNAP23O00161 211 aa22.74■■□□□ 1.23
CAPN3-209ENST00000466222 OSBPL3Q9H4L5 887 aa22.74■■□□□ 1.23
CAPN3-209ENST00000466222 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa22.74■■□□□ 1.23
CAPN3-209ENST00000466222 STAP2Q9UGK3 403 aa22.74■■□□□ 1.23
CAPN3-209ENST00000466222 BMP2KLQ5H9B9 411 aa22.73■■□□□ 1.23
CAPN3-209ENST00000466222 METTL24Q5JXM2 366 aa22.73■■□□□ 1.23
CAPN3-209ENST00000466222 MPHOSPH8Q99549 860 aa22.73■■□□□ 1.23
CAPN3-209ENST00000466222 CEP126Q9P2H0 1117 aa22.73■■□□□ 1.23
CAPN3-209ENST00000466222 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
CAPN3-209ENST00000466222 COL24A1Q17RW2 1714 aa22.73■■□□□ 1.23
CAPN3-209ENST00000466222 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
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