RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000450873.6

RABGEF1-205, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene RABGEF1, Length 2,281 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-205ENST00000450873 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP13.39□□□□□ -0.27
RABGEF1-205ENST00000450873 H7C1W4 665 aa13.39□□□□□ -0.27
RABGEF1-205ENST00000450873 TRIM27P14373 513 aa13.39□□□□□ -0.27
RABGEF1-205ENST00000450873 ABCC12Q96J65 1359 aa13.39□□□□□ -0.27
RABGEF1-205ENST00000450873 CNKSR1Q969H4 720 aa13.38□□□□□ -0.27
RABGEF1-205ENST00000450873 NLRP3Q96P20 1036 aa13.38□□□□□ -0.27
RABGEF1-205ENST00000450873 LTBP3Q9NS15 1303 aa13.38□□□□□ -0.27
RABGEF1-205ENST00000450873 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP13.38□□□□□ -0.27
RABGEF1-205ENST00000450873 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP13.38□□□□□ -0.27
RABGEF1-205ENST00000450873 IFFO2Q5TF58 517 aa13.38□□□□□ -0.27
RABGEF1-205ENST00000450873 SYNE4Q8N205 404 aa13.38□□□□□ -0.27
RABGEF1-205ENST00000450873 SMC1BQ8NDV3 1235 aa13.38□□□□□ -0.27
RABGEF1-205ENST00000450873 ABCC4O15439 1325 aa13.37□□□□□ -0.27
RABGEF1-205ENST00000450873 CDHR2Q9BYE9 1310 aa13.37□□□□□ -0.27
RABGEF1-205ENST00000450873 C21orf2O43822 256 aa13.37□□□□□ -0.27
RABGEF1-205ENST00000450873 SRGNP10124 158 aa13.37□□□□□ -0.27
RABGEF1-205ENST00000450873 MS4A1P11836 297 aa13.37□□□□□ -0.27
RABGEF1-205ENST00000450873 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP13.37□□□□□ -0.27
RABGEF1-205ENST00000450873 MASTLQ96GX5 879 aa13.37□□□□□ -0.27
RABGEF1-205ENST00000450873 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP13.37□□□□□ -0.27
RABGEF1-205ENST00000450873 SLX4Q8IY92 1834 aa13.37□□□□□ -0.27
RABGEF1-205ENST00000450873 GRM8O00222 908 aa13.37□□□□□ -0.27
RABGEF1-205ENST00000450873 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP13.37□□□□□ -0.27
RABGEF1-205ENST00000450873 SOGA3Q5TF21 947 aa13.37□□□□□ -0.27
RABGEF1-205ENST00000450873 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP13.37□□□□□ -0.27
RABGEF1-205ENST00000450873 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa13.37□□□□□ -0.27
RABGEF1-205ENST00000450873 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP13.37□□□□□ -0.27
RABGEF1-205ENST00000450873 CACNA1SQ13698 1873 aa13.37□□□□□ -0.27
RABGEF1-205ENST00000450873 CEP350Q5VT06 3117 aa13.36□□□□□ -0.27
RABGEF1-205ENST00000450873 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP13.36□□□□□ -0.27
RABGEF1-205ENST00000450873 PDE8AO60658 829 aa13.36□□□□□ -0.27
RABGEF1-205ENST00000450873 NPR1P16066 1061 aa13.36□□□□□ -0.27
RABGEF1-205ENST00000450873 CRY2Q49AN0 593 aa13.36□□□□□ -0.27
RABGEF1-205ENST00000450873 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP13.36□□□□□ -0.27
RABGEF1-205ENST00000450873 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP13.36□□□□□ -0.27
RABGEF1-205ENST00000450873 CLUAP1Q96AJ1 413 aa13.36□□□□□ -0.27
RABGEF1-205ENST00000450873 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa13.36□□□□□ -0.27
RABGEF1-205ENST00000450873 CASP7P55210 303 aa13.35□□□□□ -0.27
RABGEF1-205ENST00000450873 DPY19L2Q6NUT2 758 aa13.35□□□□□ -0.27
RABGEF1-205ENST00000450873 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP13.35□□□□□ -0.27
RABGEF1-205ENST00000450873 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP13.35□□□□□ -0.27
RABGEF1-205ENST00000450873 TAOK3Q9H2K8 898 aa13.35□□□□□ -0.27
RABGEF1-205ENST00000450873 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP13.35□□□□□ -0.27
RABGEF1-205ENST00000450873 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP13.34□□□□□ -0.27
RABGEF1-205ENST00000450873 PLA2G12BQ9BX93 195 aa13.34□□□□□ -0.27
RABGEF1-205ENST00000450873 TNNQ9UQP3 1299 aa13.34□□□□□ -0.27
RABGEF1-205ENST00000450873 UTYO14607 1347 aa13.34□□□□□ -0.27
RABGEF1-205ENST00000450873 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP13.34□□□□□ -0.27
RABGEF1-205ENST00000450873 C3orf67Q6ZVT6 689 aa13.34□□□□□ -0.27
RABGEF1-205ENST00000450873 KLRG1Q96E93 195 aa13.34□□□□□ -0.27
RABGEF1-205ENST00000450873 ALDH1B1P30837 517 aa13.33□□□□□ -0.28
RABGEF1-205ENST00000450873 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP13.33□□□□□ -0.28
RABGEF1-205ENST00000450873 USP44Q9H0E7 712 aa13.33□□□□□ -0.28
RABGEF1-205ENST00000450873 HDAC5Q9UQL6 1122 aa13.33□□□□□ -0.28
RABGEF1-205ENST00000450873 TMEM57Q8N5G2 664 aa13.33□□□□□ -0.28
RABGEF1-205ENST00000450873 C7orf43Q8WVR3 580 aa13.33□□□□□ -0.28
RABGEF1-205ENST00000450873 POTECB2RU33 542 aa13.32□□□□□ -0.28
RABGEF1-205ENST00000450873 PLIN1O60240 522 aa13.32□□□□□ -0.28
RABGEF1-205ENST00000450873 CCDC152Q4G0S7 254 aa13.32□□□□□ -0.28
RABGEF1-205ENST00000450873 CRAMP1Q96RY5 1269 aa13.32□□□□□ -0.28
RABGEF1-205ENST00000450873 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP13.32□□□□□ -0.28
RABGEF1-205ENST00000450873 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP13.32□□□□□ -0.28
RABGEF1-205ENST00000450873 CTSWP56202 376 aa13.32□□□□□ -0.28
RABGEF1-205ENST00000450873 PDE3AQ14432 1141 aa13.32□□□□□ -0.28
RABGEF1-205ENST00000450873 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP13.32□□□□□ -0.28
RABGEF1-205ENST00000450873 JMYQ8N9B5 988 aa13.32□□□□□ -0.28
RABGEF1-205ENST00000450873 LAMB2P55268 1798 aa13.31□□□□□ -0.28
RABGEF1-205ENST00000450873 GNAI3P08754 354 aa13.31□□□□□ -0.28
RABGEF1-205ENST00000450873 RLBP1P12271 317 aa13.31□□□□□ -0.28
RABGEF1-205ENST00000450873 HTRA3P83110 453 aa13.31□□□□□ -0.28
RABGEF1-205ENST00000450873 CCDC93Q567U6 631 aa13.31□□□□□ -0.28
RABGEF1-205ENST00000450873 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP13.3□□□□□ -0.28
RABGEF1-205ENST00000450873 TTLL11Q8NHH1 800 aa13.3□□□□□ -0.28
RABGEF1-205ENST00000450873 PANK1Q8TE04 598 aa13.3□□□□□ -0.28
RABGEF1-205ENST00000450873 CSF1RP07333 972 aa13.3□□□□□ -0.28
RABGEF1-205ENST00000450873 FOXO4P98177 505 aa13.3□□□□□ -0.28
RABGEF1-205ENST00000450873 ITPRIPQ8IWB1 547 aa13.3□□□□□ -0.28
RABGEF1-205ENST00000450873 SUCLG2Q96I99 432 aa13.3□□□□□ -0.28
RABGEF1-205ENST00000450873 RRP1P56182 461 aaKnown RBP13.29□□□□□ -0.28
RABGEF1-205ENST00000450873 RTL9Q8NET4 1388 aa13.29□□□□□ -0.28
RABGEF1-205ENST00000450873 BBOX1O75936 387 aa13.29□□□□□ -0.28
RABGEF1-205ENST00000450873 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP13.29□□□□□ -0.28
RABGEF1-205ENST00000450873 GRAPQ13588 217 aa13.29□□□□□ -0.28
RABGEF1-205ENST00000450873 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP13.29□□□□□ -0.28
RABGEF1-205ENST00000450873 MEIS3Q99687 375 aa13.29□□□□□ -0.28
RABGEF1-205ENST00000450873 RTKN2Q8IZC4 609 aa13.28□□□□□ -0.28
RABGEF1-205ENST00000450873 EPHA10Q5JZY3 1008 aa13.28□□□□□ -0.28
RABGEF1-205ENST00000450873 LMBR1LQ6UX01 489 aa13.28□□□□□ -0.28
RABGEF1-205ENST00000450873 KAZALD1Q96I82 304 aa13.28□□□□□ -0.28
RABGEF1-205ENST00000450873 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP13.28□□□□□ -0.28
RABGEF1-205ENST00000450873 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP13.28□□□□□ -0.28
RABGEF1-205ENST00000450873 SCN4AP35499 1836 aa13.27□□□□□ -0.28
RABGEF1-205ENST00000450873 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP13.27□□□□□ -0.28
RABGEF1-205ENST00000450873 DDNO94850 711 aaPredicted RBP13.27□□□□□ -0.28
RABGEF1-205ENST00000450873 MVPQ14764 893 aaKnown RBP13.27□□□□□ -0.28
RABGEF1-205ENST00000450873 TMC4Q7Z404 712 aa13.27□□□□□ -0.28
RABGEF1-205ENST00000450873 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP13.27□□□□□ -0.28
RABGEF1-205ENST00000450873 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP13.27□□□□□ -0.28
RABGEF1-205ENST00000450873 GREM2Q9H772 168 aa13.27□□□□□ -0.28
RABGEF1-205ENST00000450873 MYH3P11055 1940 aa13.27□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.6 ms