RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442481.5

PRAME-210, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 3

Gene PRAME, Length 581 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-210ENST00000442481 BCL2L13Q9BXK5 485 aa15.23■□□□□ 0.03
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PRAME-210ENST00000442481 TSPYL4Q9UJ04 414 aa15.23■□□□□ 0.03
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PRAME-210ENST00000442481 C2orf69Q8N8R5 385 aa15.12■□□□□ 0.01
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PRAME-210ENST00000442481 LRRC37AA6NMS7 1700 aa15.12■□□□□ 0.01
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PRAME-210ENST00000442481 KRT26Q7Z3Y9 468 aa15.11■□□□□ 0.01
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PRAME-210ENST00000442481 USP48Q86UV5 1035 aa15.1■□□□□ 0.01
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PRAME-210ENST00000442481 TAF1P21675 1872 aa15.1■□□□□ 0.01
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PRAME-210ENST00000442481 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP15.09■□□□□ 0.01
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PRAME-210ENST00000442481 SULF1Q8IWU6 871 aa15.09■□□□□ 0.01
PRAME-210ENST00000442481 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP15.09■□□□□ 0.01
PRAME-210ENST00000442481 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP15.09■□□□□ 0.01
PRAME-210ENST00000442481 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP15.08■□□□□ 0
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PRAME-210ENST00000442481 SAMD7Q7Z3H4 446 aa15.08■□□□□ 0
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