RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384354.1

RNU6-171P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 171, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-171P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-171P-201ENST00000384354 HUNKP57058 714 aa7.28□□□□□ -1.24
RNU6-171P-201ENST00000384354 ZNF34Q8IZ26 560 aa7.28□□□□□ -1.24
RNU6-171P-201ENST00000384354 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
RNU6-171P-201ENST00000384354 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
RNU6-171P-201ENST00000384354 RTL9Q8NET4 1388 aa7.28□□□□□ -1.24
RNU6-171P-201ENST00000384354 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
RNU6-171P-201ENST00000384354 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
RNU6-171P-201ENST00000384354 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
RNU6-171P-201ENST00000384354 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
RNU6-171P-201ENST00000384354 MICALL2Q8IY33 904 aa7.27□□□□□ -1.25
RNU6-171P-201ENST00000384354 CRAMP1Q96RY5 1269 aa7.27□□□□□ -1.25
RNU6-171P-201ENST00000384354 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
RNU6-171P-201ENST00000384354 PCGF6Q9BYE7 350 aa7.27□□□□□ -1.25
RNU6-171P-201ENST00000384354 ZNRF3Q9ULT6 936 aa7.27□□□□□ -1.25
RNU6-171P-201ENST00000384354 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa7.27□□□□□ -1.25
RNU6-171P-201ENST00000384354 CEP290O15078 2479 aa7.27□□□□□ -1.25
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RNU6-171P-201ENST00000384354 A0A1B0GUL6 1792 aa7.25□□□□□ -1.25
RNU6-171P-201ENST00000384354 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa7.25□□□□□ -1.25
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RNU6-171P-201ENST00000384354 CA12O43570 354 aa7.25□□□□□ -1.25
RNU6-171P-201ENST00000384354 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
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RNU6-171P-201ENST00000384354 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa7.25□□□□□ -1.25
RNU6-171P-201ENST00000384354 DBNDD1Q9H9R9 158 aa7.25□□□□□ -1.25
RNU6-171P-201ENST00000384354 HPS5Q9UPZ3 1129 aa7.25□□□□□ -1.25
RNU6-171P-201ENST00000384354 SLC10A3P09131 477 aa7.24□□□□□ -1.25
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RNU6-171P-201ENST00000384354 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP7.24□□□□□ -1.25
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RNU6-171P-201ENST00000384354 A0A0C4DFX4 3053 aa7.22□□□□□ -1.25
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RNU6-171P-201ENST00000384354 TBC1D8O95759 1140 aa7.21□□□□□ -1.26
RNU6-171P-201ENST00000384354 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
RNU6-171P-201ENST00000384354 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
RNU6-171P-201ENST00000384354 GRAPQ13588 217 aa7.21□□□□□ -1.26
RNU6-171P-201ENST00000384354 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa7.21□□□□□ -1.26
RNU6-171P-201ENST00000384354 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
RNU6-171P-201ENST00000384354 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
RNU6-171P-201ENST00000384354 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
RNU6-171P-201ENST00000384354 NLRP3Q96P20 1036 aa7.21□□□□□ -1.26
RNU6-171P-201ENST00000384354 PLEKHF1Q96S99 279 aa7.21□□□□□ -1.26
RNU6-171P-201ENST00000384354 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
RNU6-171P-201ENST00000384354 FZD1Q9UP38 647 aa7.21□□□□□ -1.26
RNU6-171P-201ENST00000384354 POTEFA5A3E0 1075 aa7.2□□□□□ -1.26
RNU6-171P-201ENST00000384354 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
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