RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000375391.5

TMCO3-201, Transcript of transmembrane and coiled-coil domains 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TMCO3, Length 2,132 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO3-201ENST00000375391 NPHP1O15259 732 aa25.23■■□□□ 1.63
TMCO3-201ENST00000375391 PDE8AO60658 829 aa25.23■■□□□ 1.63
TMCO3-201ENST00000375391 CSF1RP07333 972 aa25.23■■□□□ 1.63
TMCO3-201ENST00000375391 MMP10P09238 476 aa25.23■■□□□ 1.63
TMCO3-201ENST00000375391 PRR5LQ6MZQ0 368 aa25.23■■□□□ 1.63
TMCO3-201ENST00000375391 FLAD1Q8NFF5 587 aa25.23■■□□□ 1.63
TMCO3-201ENST00000375391 PLA2G12BQ9BX93 195 aa25.23■■□□□ 1.63
TMCO3-201ENST00000375391 SEC31BQ9NQW1 1179 aa25.23■■□□□ 1.63
TMCO3-201ENST00000375391 RGS3P49796 1198 aa25.22■■□□□ 1.63
TMCO3-201ENST00000375391 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
TMCO3-201ENST00000375391 TPTE2Q6XPS3 522 aa25.22■■□□□ 1.63
TMCO3-201ENST00000375391 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
TMCO3-201ENST00000375391 RGL2O15211 777 aa25.22■■□□□ 1.63
TMCO3-201ENST00000375391 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
TMCO3-201ENST00000375391 COL4A1P02462 1669 aa25.21■■□□□ 1.63
TMCO3-201ENST00000375391 PDE4AP27815 886 aa25.21■■□□□ 1.63
TMCO3-201ENST00000375391 CNBD1Q8NA66 436 aa25.21■■□□□ 1.63
TMCO3-201ENST00000375391 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
TMCO3-201ENST00000375391 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa25.21■■□□□ 1.63
TMCO3-201ENST00000375391 HDAC5Q9UQL6 1122 aa25.21■■□□□ 1.63
TMCO3-201ENST00000375391 COL24A1Q17RW2 1714 aa25.2■■□□□ 1.63
TMCO3-201ENST00000375391 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.63
TMCO3-201ENST00000375391 ITGA6P23229 1130 aa25.2■■□□□ 1.62
TMCO3-201ENST00000375391 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
TMCO3-201ENST00000375391 SLC51AQ86UW1 340 aa25.2■■□□□ 1.62
TMCO3-201ENST00000375391 NLGN1Q8N2Q7 840 aa25.2■■□□□ 1.62
TMCO3-201ENST00000375391 GCC1Q96CN9 775 aa25.2■■□□□ 1.62
TMCO3-201ENST00000375391 LRRC24Q50LG9 513 aa25.19■■□□□ 1.62
TMCO3-201ENST00000375391 NUCB1Q02818 461 aa25.19■■□□□ 1.62
TMCO3-201ENST00000375391 ZBTB7AO95365 584 aa25.18■■□□□ 1.62
TMCO3-201ENST00000375391 NYXQ9GZU5 481 aa25.18■■□□□ 1.62
TMCO3-201ENST00000375391 TAF1P21675 1872 aa25.17■■□□□ 1.62
TMCO3-201ENST00000375391 CCDC57Q2TAC2 916 aa25.17■■□□□ 1.62
TMCO3-201ENST00000375391 CHD1LQ86WJ1 897 aa25.17■■□□□ 1.62
TMCO3-201ENST00000375391 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa25.17■■□□□ 1.62
TMCO3-201ENST00000375391 SASH1O94885 1247 aa25.16■■□□□ 1.62
TMCO3-201ENST00000375391 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
TMCO3-201ENST00000375391 SLC10A5Q5PT55 438 aa25.16■■□□□ 1.62
TMCO3-201ENST00000375391 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
TMCO3-201ENST00000375391 COPRSQ9NQ92 184 aa25.15■■□□□ 1.62
TMCO3-201ENST00000375391 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
TMCO3-201ENST00000375391 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
TMCO3-201ENST00000375391 RHPN1Q8TCX5 695 aa25.14■■□□□ 1.62
TMCO3-201ENST00000375391 MYH3P11055 1940 aa25.14■■□□□ 1.62
TMCO3-201ENST00000375391 TSHZ3Q63HK5 1081 aa25.13■■□□□ 1.61
TMCO3-201ENST00000375391 ATG9AQ7Z3C6 839 aa25.13■■□□□ 1.61
TMCO3-201ENST00000375391 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
TMCO3-201ENST00000375391 NLRP3Q96P20 1036 aa25.13■■□□□ 1.61
TMCO3-201ENST00000375391 LRRCC1Q9C099 1032 aa25.12■■□□□ 1.61
TMCO3-201ENST00000375391 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP25.12■■□□□ 1.61
TMCO3-201ENST00000375391 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
TMCO3-201ENST00000375391 PARP3Q9Y6F1 533 aa25.12■■□□□ 1.61
TMCO3-201ENST00000375391 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa25.11■■□□□ 1.61
TMCO3-201ENST00000375391 CCDC152Q4G0S7 254 aa25.11■■□□□ 1.61
TMCO3-201ENST00000375391 TAF7LQ5H9L4 462 aa25.11■■□□□ 1.61
TMCO3-201ENST00000375391 TFCP2Q12800 502 aa25.1■■□□□ 1.61
TMCO3-201ENST00000375391 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP25.1■■□□□ 1.61
TMCO3-201ENST00000375391 SNAP23O00161 211 aa25.09■■□□□ 1.61
TMCO3-201ENST00000375391 LAMB2P55268 1798 aa25.09■■□□□ 1.61
TMCO3-201ENST00000375391 CASZ1Q86V15 1759 aa25.09■■□□□ 1.61
TMCO3-201ENST00000375391 ST5P78524 1137 aa25.09■■□□□ 1.61
TMCO3-201ENST00000375391 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa25.09■■□□□ 1.61
TMCO3-201ENST00000375391 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
TMCO3-201ENST00000375391 QSER1Q2KHR3 1735 aa25.08■■□□□ 1.61
TMCO3-201ENST00000375391 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.61
TMCO3-201ENST00000375391 EYA2O00167 538 aa25.08■■□□□ 1.61
TMCO3-201ENST00000375391 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
TMCO3-201ENST00000375391 KIF1BPQ96EK5 621 aa25.07■■□□□ 1.6
TMCO3-201ENST00000375391 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP25.06■■□□□ 1.6
TMCO3-201ENST00000375391 RAB11FIP3O75154 756 aa25.06■■□□□ 1.6
TMCO3-201ENST00000375391 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP25.06■■□□□ 1.6
TMCO3-201ENST00000375391 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa25.06■■□□□ 1.6
TMCO3-201ENST00000375391 CNNM1Q9NRU3 951 aa25.05■■□□□ 1.6
TMCO3-201ENST00000375391 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa25.04■■□□□ 1.6
TMCO3-201ENST00000375391 TAF5LO75529 589 aa25.04■■□□□ 1.6
TMCO3-201ENST00000375391 TIMM10P62072 90 aa25.03■■□□□ 1.6
TMCO3-201ENST00000375391 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa25.03■■□□□ 1.6
TMCO3-201ENST00000375391 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP25.03■■□□□ 1.6
TMCO3-201ENST00000375391 CRY2Q49AN0 593 aa25.03■■□□□ 1.6
TMCO3-201ENST00000375391 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa25.03■■□□□ 1.6
TMCO3-201ENST00000375391 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP25.03■■□□□ 1.6
TMCO3-201ENST00000375391 AACSQ86V21 672 aa25.02■■□□□ 1.6
TMCO3-201ENST00000375391 MPHOSPH8Q99549 860 aa25.02■■□□□ 1.6
TMCO3-201ENST00000375391 NRXN2Q9P2S2 1712 aa25.02■■□□□ 1.6
TMCO3-201ENST00000375391 SPEF2Q9C093 1822 aa25.02■■□□□ 1.6
TMCO3-201ENST00000375391 CHRNA5P30532 468 aa25.01■■□□□ 1.59
TMCO3-201ENST00000375391 IL15P40933 162 aaPredicted RBP25.01■■□□□ 1.59
TMCO3-201ENST00000375391 BRIP1Q9BX63 1249 aa25.01■■□□□ 1.59
TMCO3-201ENST00000375391 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP25.01■■□□□ 1.59
TMCO3-201ENST00000375391 RIC1Q4ADV7 1423 aa25.01■■□□□ 1.59
TMCO3-201ENST00000375391 RTL9Q8NET4 1388 aa25■■□□□ 1.59
TMCO3-201ENST00000375391 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa25■■□□□ 1.59
TMCO3-201ENST00000375391 SLC16A10Q8TF71 515 aa25■■□□□ 1.59
TMCO3-201ENST00000375391 WWC3Q9ULE0 1092 aa25■■□□□ 1.59
TMCO3-201ENST00000375391 CIAO1O76071 339 aa25■■□□□ 1.59
TMCO3-201ENST00000375391 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP25■■□□□ 1.59
TMCO3-201ENST00000375391 RPS8P62241 208 aaKnown RBP25■■□□□ 1.59
TMCO3-201ENST00000375391 METTL24Q5JXM2 366 aa25■■□□□ 1.59
TMCO3-201ENST00000375391 OLFM4Q6UX06 510 aa25■■□□□ 1.59
TMCO3-201ENST00000375391 ERC1Q8IUD2 1116 aa25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 90.4 ms