RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000369214.2

PRDM13-201, Transcript of PR/SET domain 13, humanhuman

TSL 5

Gene PRDM13, Length 3,232 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM13-201ENST00000369214 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
PRDM13-201ENST00000369214 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
PRDM13-201ENST00000369214 PSME1Q06323 249 aa22.02■■□□□ 1.12
PRDM13-201ENST00000369214 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
PRDM13-201ENST00000369214 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
PRDM13-201ENST00000369214 CBX8Q9HC52 389 aa22.02■■□□□ 1.12
PRDM13-201ENST00000369214 ANO6Q4KMQ2 910 aa22.02■■□□□ 1.12
PRDM13-201ENST00000369214 CLSTN2Q9H4D0 955 aa22.02■■□□□ 1.12
PRDM13-201ENST00000369214 MRC1P22897 1456 aa22.02■■□□□ 1.11
PRDM13-201ENST00000369214 PTGS1P23219 599 aa22.01■■□□□ 1.11
PRDM13-201ENST00000369214 STK3Q13188 491 aa22.01■■□□□ 1.11
PRDM13-201ENST00000369214 TAF5LO75529 589 aa22.01■■□□□ 1.11
PRDM13-201ENST00000369214 IGKV5-2P06315 115 aa22.01■■□□□ 1.11
PRDM13-201ENST00000369214 BCL2L12Q9HB09 334 aa22.01■■□□□ 1.11
PRDM13-201ENST00000369214 USPL1Q5W0Q7 1092 aa22■■□□□ 1.11
PRDM13-201ENST00000369214 KRT32Q14532 448 aa22■■□□□ 1.11
PRDM13-201ENST00000369214 PDIA6Q15084 440 aa22■■□□□ 1.11
PRDM13-201ENST00000369214 KLHDC4Q8TBB5 520 aa22■■□□□ 1.11
PRDM13-201ENST00000369214 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa21.99■■□□□ 1.11
PRDM13-201ENST00000369214 FAM177BA6PVY3 158 aa21.99■■□□□ 1.11
PRDM13-201ENST00000369214 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
PRDM13-201ENST00000369214 RIC3Q7Z5B4 369 aa21.99■■□□□ 1.11
PRDM13-201ENST00000369214 GTF3C6Q969F1 213 aa21.98■■□□□ 1.11
PRDM13-201ENST00000369214 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
PRDM13-201ENST00000369214 PGBD1Q96JS3 809 aa21.98■■□□□ 1.11
PRDM13-201ENST00000369214 CCDC186Q7Z3E2 898 aa21.97■■□□□ 1.11
PRDM13-201ENST00000369214 ARHGEF25Q86VW2 580 aa21.97■■□□□ 1.11
PRDM13-201ENST00000369214 PRDM4Q9UKN5 801 aa21.97■■□□□ 1.11
PRDM13-201ENST00000369214 NR1I2O75469 434 aa21.97■■□□□ 1.11
PRDM13-201ENST00000369214 ESCO1Q5FWF5 840 aa21.97■■□□□ 1.11
PRDM13-201ENST00000369214 PLA2G4DQ86XP0 818 aa21.97■■□□□ 1.11
PRDM13-201ENST00000369214 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
PRDM13-201ENST00000369214 NEURL1BA8MQ27 555 aa21.97■■□□□ 1.11
PRDM13-201ENST00000369214 JAK2O60674 1132 aa21.97■■□□□ 1.11
PRDM13-201ENST00000369214 ZNF75DP51815 510 aa21.97■■□□□ 1.11
PRDM13-201ENST00000369214 RESTQ13127 1097 aa21.97■■□□□ 1.11
PRDM13-201ENST00000369214 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
PRDM13-201ENST00000369214 BICD2Q8TD16 824 aa21.97■■□□□ 1.11
PRDM13-201ENST00000369214 ANKRD24Q8TF21 1146 aa21.97■■□□□ 1.11
PRDM13-201ENST00000369214 NEXNQ0ZGT2 675 aa21.96■■□□□ 1.11
PRDM13-201ENST00000369214 NEK1Q96PY6 1258 aa21.96■■□□□ 1.11
PRDM13-201ENST00000369214 GCP02774 474 aa21.96■■□□□ 1.11
PRDM13-201ENST00000369214 ATP5JP18859 108 aa21.96■■□□□ 1.11
PRDM13-201ENST00000369214 GCKRQ14397 625 aa21.95■■□□□ 1.1
PRDM13-201ENST00000369214 EPHA10Q5JZY3 1008 aa21.95■■□□□ 1.1
PRDM13-201ENST00000369214 DRC7Q8IY82 874 aa21.95■■□□□ 1.1
PRDM13-201ENST00000369214 BRF1Q92994 677 aa21.95■■□□□ 1.1
PRDM13-201ENST00000369214 TRIM5Q9C035 493 aa21.95■■□□□ 1.1
PRDM13-201ENST00000369214 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa21.95■■□□□ 1.1
PRDM13-201ENST00000369214 COL15A1P39059 1388 aa21.95■■□□□ 1.1
PRDM13-201ENST00000369214 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa21.94■■□□□ 1.1
PRDM13-201ENST00000369214 ZNF165P49910 485 aa21.94■■□□□ 1.1
PRDM13-201ENST00000369214 COPRSQ9NQ92 184 aa21.94■■□□□ 1.1
PRDM13-201ENST00000369214 CTIFO43310 598 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
PRDM13-201ENST00000369214 Q6ZUG5 572 aa21.93■■□□□ 1.1
PRDM13-201ENST00000369214 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
PRDM13-201ENST00000369214 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP21.93■■□□□ 1.1
PRDM13-201ENST00000369214 NRBP1Q9UHY1 535 aa21.93■■□□□ 1.1
PRDM13-201ENST00000369214 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
PRDM13-201ENST00000369214 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP21.93■■□□□ 1.1
PRDM13-201ENST00000369214 LMTK3Q96Q04 1460 aa21.93■■□□□ 1.1
PRDM13-201ENST00000369214 LRMPQ12912 555 aa21.93■■□□□ 1.1
PRDM13-201ENST00000369214 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa21.93■■□□□ 1.1
PRDM13-201ENST00000369214 DNAJC25Q9H1X3 360 aa21.93■■□□□ 1.1
PRDM13-201ENST00000369214 RFX7Q2KHR2 1363 aa21.93■■□□□ 1.1
PRDM13-201ENST00000369214 SLIT3O75094 1523 aa21.92■■□□□ 1.1
PRDM13-201ENST00000369214 C5P01031 1676 aa21.92■■□□□ 1.1
PRDM13-201ENST00000369214 H3BQV1 296 aa21.92■■□□□ 1.1
PRDM13-201ENST00000369214 TNNI3KQ59H18 835 aa21.92■■□□□ 1.1
PRDM13-201ENST00000369214 IFFO2Q5TF58 517 aa21.92■■□□□ 1.1
PRDM13-201ENST00000369214 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa21.92■■□□□ 1.1
PRDM13-201ENST00000369214 MYD88Q99836 296 aa21.92■■□□□ 1.1
PRDM13-201ENST00000369214 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
PRDM13-201ENST00000369214 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa21.92■■□□□ 1.1
PRDM13-201ENST00000369214 CAVIN2O95810 425 aa21.92■■□□□ 1.1
PRDM13-201ENST00000369214 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
PRDM13-201ENST00000369214 MYL6BP14649 208 aa21.92■■□□□ 1.1
PRDM13-201ENST00000369214 ANKRD7Q92527 254 aa21.92■■□□□ 1.1
PRDM13-201ENST00000369214 CFAP45Q9UL16 551 aa21.92■■□□□ 1.1
PRDM13-201ENST00000369214 XAGE3Q8WTP9 111 aa21.91■■□□□ 1.1
PRDM13-201ENST00000369214 ZNF609O15014 1411 aa21.91■■□□□ 1.1
PRDM13-201ENST00000369214 ZNF790Q6PG37 636 aa21.91■■□□□ 1.1
PRDM13-201ENST00000369214 PDCL2Q8N4E4 241 aa21.91■■□□□ 1.1
PRDM13-201ENST00000369214 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP21.91■■□□□ 1.1
PRDM13-201ENST00000369214 DDX11Q96FC9 970 aa21.91■■□□□ 1.1
PRDM13-201ENST00000369214 TFCP2Q12800 502 aa21.9■■□□□ 1.1
PRDM13-201ENST00000369214 COPS6Q7L5N1 327 aa21.9■■□□□ 1.1
PRDM13-201ENST00000369214 PRDM10Q9NQV6 1147 aa21.9■■□□□ 1.1
PRDM13-201ENST00000369214 CYP21A2P08686 494 aa21.9■■□□□ 1.1
PRDM13-201ENST00000369214 SLC39A6Q13433 755 aa21.9■■□□□ 1.1
PRDM13-201ENST00000369214 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa21.9■■□□□ 1.1
PRDM13-201ENST00000369214 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.1
PRDM13-201ENST00000369214 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa21.89■■□□□ 1.1
PRDM13-201ENST00000369214 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa21.89■■□□□ 1.09
PRDM13-201ENST00000369214 CLIP2Q9UDT6 1046 aa21.89■■□□□ 1.09
PRDM13-201ENST00000369214 MYH15Q9Y2K3 1946 aa21.89■■□□□ 1.09
PRDM13-201ENST00000369214 CDC25BP30305 580 aa21.89■■□□□ 1.09
PRDM13-201ENST00000369214 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa21.89■■□□□ 1.09
PRDM13-201ENST00000369214 SCRN1Q12765 414 aa21.88■■□□□ 1.09
PRDM13-201ENST00000369214 ATP2B3Q16720 1220 aa21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.7 ms