RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368205.7

PTPRK-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRK, Length 662 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-202ENST00000368205 TRPM4Q8TD43 1214 aa8.89□□□□□ -0.99
PTPRK-202ENST00000368205 TTC9Q92623 222 aa8.89□□□□□ -0.99
PTPRK-202ENST00000368205 LPIN3Q9BQK8 851 aa8.89□□□□□ -0.99
PTPRK-202ENST00000368205 ZFATQ9P243 1243 aa8.89□□□□□ -0.99
PTPRK-202ENST00000368205 MICAL2O94851 1124 aa8.88□□□□□ -0.99
PTPRK-202ENST00000368205 GPLD1P80108 840 aa8.88□□□□□ -0.99
PTPRK-202ENST00000368205 GRIK5Q16478 980 aa8.88□□□□□ -0.99
PTPRK-202ENST00000368205 C11orf91Q3C1V1 193 aa8.88□□□□□ -0.99
PTPRK-202ENST00000368205 SHISA2Q6UWI4 295 aa8.88□□□□□ -0.99
PTPRK-202ENST00000368205 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP8.88□□□□□ -0.99
PTPRK-202ENST00000368205 DMRTC2Q8IXT2 367 aaPredicted RBP8.88□□□□□ -0.99
PTPRK-202ENST00000368205 PRSS36Q5K4E3 855 aa8.87□□□□□ -0.99
PTPRK-202ENST00000368205 MSL1Q68DK7 614 aa8.87□□□□□ -0.99
PTPRK-202ENST00000368205 IFT43Q96FT9 208 aa8.87□□□□□ -0.99
PTPRK-202ENST00000368205 ZBTB42B2RXF5 422 aa8.86□□□□□ -0.99
PTPRK-202ENST00000368205 CPB1P15086 417 aa8.86□□□□□ -0.99
PTPRK-202ENST00000368205 PERM1Q5SV97 790 aa8.86□□□□□ -0.99
PTPRK-202ENST00000368205 CFAP70Q5T0N1 1121 aa8.86□□□□□ -0.99
PTPRK-202ENST00000368205 VTI1AQ96AJ9 217 aa8.86□□□□□ -0.99
PTPRK-202ENST00000368205 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP8.86□□□□□ -0.99
PTPRK-202ENST00000368205 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa8.86□□□□□ -0.99
PTPRK-202ENST00000368205 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP8.86□□□□□ -0.99
PTPRK-202ENST00000368205 EGFRP00533 1210 aa8.85□□□□□ -0.99
PTPRK-202ENST00000368205 TARSP26639 723 aaKnown RBP8.85□□□□□ -0.99
PTPRK-202ENST00000368205 FBXO11Q86XK2 927 aa8.85□□□□□ -0.99
PTPRK-202ENST00000368205 FAM200AQ8TCP9 573 aa8.85□□□□□ -0.99
PTPRK-202ENST00000368205 OPLAHO14841 1288 aa8.84□□□□□ -0.99
PTPRK-202ENST00000368205 RARAP10276 462 aa8.84□□□□□ -0.99
PTPRK-202ENST00000368205 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP8.84□□□□□ -0.99
PTPRK-202ENST00000368205 NRLP54845 237 aa8.84□□□□□ -0.99
PTPRK-202ENST00000368205 KRT25Q7Z3Z0 450 aa8.84□□□□□ -0.99
PTPRK-202ENST00000368205 SCO2A0A1W2PP80 73 aa8.83□□□□□ -1
PTPRK-202ENST00000368205 SASH3O75995 380 aa8.83□□□□□ -1
PTPRK-202ENST00000368205 ARTNQ5T4W7 220 aa8.83□□□□□ -1
PTPRK-202ENST00000368205 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa8.83□□□□□ -1
PTPRK-202ENST00000368205 USP21Q9UK80 565 aa8.83□□□□□ -1
PTPRK-202ENST00000368205 LRFN2Q9ULH4 789 aa8.83□□□□□ -1
PTPRK-202ENST00000368205 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP8.83□□□□□ -1
PTPRK-202ENST00000368205 WFDC8Q8IUA0 241 aa8.82□□□□□ -1
PTPRK-202ENST00000368205 TP53INP1Q96A56 240 aa8.82□□□□□ -1
PTPRK-202ENST00000368205 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP8.82□□□□□ -1
PTPRK-202ENST00000368205 PLAURQ03405 335 aa8.81□□□□□ -1
PTPRK-202ENST00000368205 ZFP64Q9NPA5 681 aa8.81□□□□□ -1
PTPRK-202ENST00000368205 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP8.8□□□□□ -1
PTPRK-202ENST00000368205 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP8.8□□□□□ -1
PTPRK-202ENST00000368205 SWI5Q1ZZU3 235 aa8.8□□□□□ -1
PTPRK-202ENST00000368205 IGF2-ASQ6U949 168 aa8.8□□□□□ -1
PTPRK-202ENST00000368205 XYLBO75191 536 aa8.79□□□□□ -1
PTPRK-202ENST00000368205 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP8.79□□□□□ -1
PTPRK-202ENST00000368205 TREML1Q86YW5 311 aa8.79□□□□□ -1
PTPRK-202ENST00000368205 WFDC12Q8WWY7 111 aa8.79□□□□□ -1
PTPRK-202ENST00000368205 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa8.79□□□□□ -1
PTPRK-202ENST00000368205 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP8.79□□□□□ -1
PTPRK-202ENST00000368205 RFX1P22670 979 aa8.78□□□□□ -1
PTPRK-202ENST00000368205 SOX18P35713 384 aa8.78□□□□□ -1
PTPRK-202ENST00000368205 COX20Q5RI15 118 aa8.78□□□□□ -1
PTPRK-202ENST00000368205 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP8.78□□□□□ -1
PTPRK-202ENST00000368205 KCNMB2Q9Y691 235 aa8.78□□□□□ -1
PTPRK-202ENST00000368205 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP8.78□□□□□ -1
PTPRK-202ENST00000368205 DEAF1O75398 565 aaPredicted RBP8.77□□□□□ -1.01
PTPRK-202ENST00000368205 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP8.77□□□□□ -1.01
PTPRK-202ENST00000368205 LRP8Q14114 963 aa8.77□□□□□ -1.01
PTPRK-202ENST00000368205 ELOAQ14241 798 aaKnown RBP8.77□□□□□ -1.01
PTPRK-202ENST00000368205 RGL4Q8IZJ4 473 aa8.77□□□□□ -1.01
PTPRK-202ENST00000368205 USP20Q9Y2K6 914 aa8.77□□□□□ -1.01
PTPRK-202ENST00000368205 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa8.76□□□□□ -1.01
PTPRK-202ENST00000368205 DLL1O00548 723 aa8.76□□□□□ -1.01
PTPRK-202ENST00000368205 PSAPP07602 524 aa8.76□□□□□ -1.01
PTPRK-202ENST00000368205 NOS3P29474 1203 aa8.76□□□□□ -1.01
PTPRK-202ENST00000368205 IREB2P48200 963 aaKnown RBP8.76□□□□□ -1.01
PTPRK-202ENST00000368205 SIK1P57059 783 aa8.76□□□□□ -1.01
PTPRK-202ENST00000368205 HFE2Q6ZVN8 426 aa8.76□□□□□ -1.01
PTPRK-202ENST00000368205 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP8.76□□□□□ -1.01
PTPRK-202ENST00000368205 COL26A1Q96A83 441 aa8.76□□□□□ -1.01
PTPRK-202ENST00000368205 PLD4Q96BZ4 506 aa8.76□□□□□ -1.01
PTPRK-202ENST00000368205 SRA1Q9HD15 236 aaKnown RBP8.76□□□□□ -1.01
PTPRK-202ENST00000368205 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP8.76□□□□□ -1.01
PTPRK-202ENST00000368205 MMP20O60882 483 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRK-202ENST00000368205 OCLNQ16625 522 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRK-202ENST00000368205 CDCA8Q53HL2 280 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRK-202ENST00000368205 MEGF10Q96KG7 1140 aa8.74□□□□□ -1.01
PTPRK-202ENST00000368205 PRIMPOLQ96LW4 560 aa8.74□□□□□ -1.01
PTPRK-202ENST00000368205 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa8.74□□□□□ -1.01
PTPRK-202ENST00000368205 GHRHP01286 108 aa8.73□□□□□ -1.01
PTPRK-202ENST00000368205 BRD2P25440 801 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
PTPRK-202ENST00000368205 FAM69CQ0P6D2 419 aa8.73□□□□□ -1.01
PTPRK-202ENST00000368205 C16orf46Q6P387 395 aa8.73□□□□□ -1.01
PTPRK-202ENST00000368205 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa8.73□□□□□ -1.01
PTPRK-202ENST00000368205 TMEM130Q8N3G9 435 aa8.73□□□□□ -1.01
PTPRK-202ENST00000368205 J3QW42 95 aa8.72□□□□□ -1.01
PTPRK-202ENST00000368205 PRMT3O60678 531 aa8.72□□□□□ -1.01
PTPRK-202ENST00000368205 NLRP13Q86W25 1043 aa8.72□□□□□ -1.01
PTPRK-202ENST00000368205 MAP4K3Q8IVH8 894 aa8.72□□□□□ -1.01
PTPRK-202ENST00000368205 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
PTPRK-202ENST00000368205 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa8.72□□□□□ -1.01
PTPRK-202ENST00000368205 DCAF11Q8TEB1 546 aa8.72□□□□□ -1.01
PTPRK-202ENST00000368205 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
PTPRK-202ENST00000368205 RBSNQ9H1K0 784 aa8.72□□□□□ -1.01
PTPRK-202ENST00000368205 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
PTPRK-202ENST00000368205 NBPF11Q86T75 865 aa8.71□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.5 ms