RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366607.4

TOMM20-201, Transcript of translocase of outer mitochondrial membrane 20, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TOMM20, Length 3,387 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOMM20-201ENST00000366607 PDCP20941 246 aa13.45□□□□□ -0.26
TOMM20-201ENST00000366607 NECTIN1Q15223 517 aa13.45□□□□□ -0.26
TOMM20-201ENST00000366607 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP13.45□□□□□ -0.26
TOMM20-201ENST00000366607 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP13.45□□□□□ -0.26
TOMM20-201ENST00000366607 LMTK2Q8IWU2 1503 aa13.44□□□□□ -0.26
TOMM20-201ENST00000366607 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP13.44□□□□□ -0.26
TOMM20-201ENST00000366607 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP13.44□□□□□ -0.26
TOMM20-201ENST00000366607 ME1P48163 572 aa13.44□□□□□ -0.26
TOMM20-201ENST00000366607 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP13.44□□□□□ -0.26
TOMM20-201ENST00000366607 CHST3Q7LGC8 479 aa13.44□□□□□ -0.26
TOMM20-201ENST00000366607 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP13.44□□□□□ -0.26
TOMM20-201ENST00000366607 SDF4Q9BRK5 362 aa13.44□□□□□ -0.26
TOMM20-201ENST00000366607 LGR6Q9HBX8 967 aa13.44□□□□□ -0.26
TOMM20-201ENST00000366607 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP13.44□□□□□ -0.26
TOMM20-201ENST00000366607 ATP7BP35670 1465 aa13.43□□□□□ -0.26
TOMM20-201ENST00000366607 DNAAF4Q8WXU2 420 aa13.43□□□□□ -0.26
TOMM20-201ENST00000366607 AATKQ6ZMQ8 1374 aa13.43□□□□□ -0.26
TOMM20-201ENST00000366607 MYL6BP14649 208 aa13.43□□□□□ -0.26
TOMM20-201ENST00000366607 GOLGA8FQ08AF8 430 aa13.43□□□□□ -0.26
TOMM20-201ENST00000366607 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa13.43□□□□□ -0.26
TOMM20-201ENST00000366607 SLFNL1Q499Z3 407 aa13.43□□□□□ -0.26
TOMM20-201ENST00000366607 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa13.43□□□□□ -0.26
TOMM20-201ENST00000366607 PDE4CQ08493 712 aa13.43□□□□□ -0.26
TOMM20-201ENST00000366607 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa13.43□□□□□ -0.26
TOMM20-201ENST00000366607 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP13.43□□□□□ -0.26
TOMM20-201ENST00000366607 ZNF446Q9NWS9 450 aa13.43□□□□□ -0.26
TOMM20-201ENST00000366607 SLU7O95391 586 aaKnown RBP13.42□□□□□ -0.26
TOMM20-201ENST00000366607 SLC39A6Q13433 755 aa13.42□□□□□ -0.26
TOMM20-201ENST00000366607 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP13.42□□□□□ -0.26
TOMM20-201ENST00000366607 TMC6Q7Z403 805 aa13.42□□□□□ -0.26
TOMM20-201ENST00000366607 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP13.42□□□□□ -0.26
TOMM20-201ENST00000366607 PIK3C2BO00750 1634 aa13.42□□□□□ -0.26
TOMM20-201ENST00000366607 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP13.42□□□□□ -0.26
TOMM20-201ENST00000366607 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa13.42□□□□□ -0.26
TOMM20-201ENST00000366607 NEK11Q8NG66 645 aa13.42□□□□□ -0.26
TOMM20-201ENST00000366607 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP13.42□□□□□ -0.26
TOMM20-201ENST00000366607 GPATCH3Q96I76 525 aa13.42□□□□□ -0.26
TOMM20-201ENST00000366607 TIGD1Q96MW7 591 aa13.42□□□□□ -0.26
TOMM20-201ENST00000366607 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP13.42□□□□□ -0.26
TOMM20-201ENST00000366607 MYO5BQ9ULV0 1848 aa13.42□□□□□ -0.26
TOMM20-201ENST00000366607 PSMA5P28066 241 aa13.41□□□□□ -0.26
TOMM20-201ENST00000366607 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP13.41□□□□□ -0.26
TOMM20-201ENST00000366607 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa13.41□□□□□ -0.26
TOMM20-201ENST00000366607 CERS3Q8IU89 383 aa13.41□□□□□ -0.26
TOMM20-201ENST00000366607 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa13.41□□□□□ -0.26
TOMM20-201ENST00000366607 PHF8Q9UPP1 1060 aa13.41□□□□□ -0.26
TOMM20-201ENST00000366607 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa13.41□□□□□ -0.26
TOMM20-201ENST00000366607 KIF20BQ96Q89 1820 aa13.41□□□□□ -0.26
TOMM20-201ENST00000366607 CCDC66A2RUB6 948 aa13.41□□□□□ -0.26
TOMM20-201ENST00000366607 KINO60870 393 aaKnown RBP13.41□□□□□ -0.26
TOMM20-201ENST00000366607 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP13.41□□□□□ -0.26
TOMM20-201ENST00000366607 POLA2Q14181 598 aa13.41□□□□□ -0.26
TOMM20-201ENST00000366607 IQCB1Q15051 598 aa13.41□□□□□ -0.26
TOMM20-201ENST00000366607 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP13.41□□□□□ -0.26
TOMM20-201ENST00000366607 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa13.41□□□□□ -0.26
TOMM20-201ENST00000366607 Q6ZUG5 572 aa13.41□□□□□ -0.26
TOMM20-201ENST00000366607 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP13.41□□□□□ -0.26
TOMM20-201ENST00000366607 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP13.41□□□□□ -0.26
TOMM20-201ENST00000366607 A0A1B0GVL5 298 aa13.41□□□□□ -0.26
TOMM20-201ENST00000366607 FSIP1Q8NA03 581 aa13.41□□□□□ -0.26
TOMM20-201ENST00000366607 ALKQ9UM73 1620 aa13.4□□□□□ -0.26
TOMM20-201ENST00000366607 RPS6KB1P23443 525 aa13.4□□□□□ -0.26
TOMM20-201ENST00000366607 DNAI1Q9UI46 699 aa13.4□□□□□ -0.26
TOMM20-201ENST00000366607 TMEM2Q9UHN6 1383 aa13.4□□□□□ -0.26
TOMM20-201ENST00000366607 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa13.4□□□□□ -0.26
TOMM20-201ENST00000366607 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa13.4□□□□□ -0.26
TOMM20-201ENST00000366607 GYS2P54840 703 aa13.4□□□□□ -0.26
TOMM20-201ENST00000366607 CCZ1BP86790 482 aa13.4□□□□□ -0.26
TOMM20-201ENST00000366607 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP13.4□□□□□ -0.26
TOMM20-201ENST00000366607 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP13.4□□□□□ -0.26
TOMM20-201ENST00000366607 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP13.4□□□□□ -0.26
TOMM20-201ENST00000366607 ANKLE2Q86XL3 938 aa13.4□□□□□ -0.26
TOMM20-201ENST00000366607 EVI5LQ96CN4 794 aa13.4□□□□□ -0.26
TOMM20-201ENST00000366607 IFNKQ9P0W0 207 aa13.4□□□□□ -0.26
TOMM20-201ENST00000366607 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa13.4□□□□□ -0.26
TOMM20-201ENST00000366607 AOX1Q06278 1338 aa13.4□□□□□ -0.26
TOMM20-201ENST00000366607 RNF20Q5VTR2 975 aa13.4□□□□□ -0.26
TOMM20-201ENST00000366607 MAP4K1Q92918 833 aa13.4□□□□□ -0.26
TOMM20-201ENST00000366607 TTC21AQ8NDW8 1320 aa13.4□□□□□ -0.26
TOMM20-201ENST00000366607 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP13.39□□□□□ -0.27
TOMM20-201ENST00000366607 PROSER3Q2NL68 480 aa13.39□□□□□ -0.27
TOMM20-201ENST00000366607 ERO1AQ96HE7 468 aa13.39□□□□□ -0.27
TOMM20-201ENST00000366607 CCDC34Q96HJ3 373 aa13.39□□□□□ -0.27
TOMM20-201ENST00000366607 USP28Q96RU2 1077 aa13.39□□□□□ -0.27
TOMM20-201ENST00000366607 A2ML1A8K2U0 1454 aa13.39□□□□□ -0.27
TOMM20-201ENST00000366607 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa13.39□□□□□ -0.27
TOMM20-201ENST00000366607 URI1O94763 535 aaPredicted RBP13.39□□□□□ -0.27
TOMM20-201ENST00000366607 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP13.39□□□□□ -0.27
TOMM20-201ENST00000366607 BEND3Q5T5X7 828 aa13.39□□□□□ -0.27
TOMM20-201ENST00000366607 STK11IPQ8N1F8 1099 aa13.39□□□□□ -0.27
TOMM20-201ENST00000366607 TRIM34Q9BYJ4 488 aa13.39□□□□□ -0.27
TOMM20-201ENST00000366607 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP13.38□□□□□ -0.27
TOMM20-201ENST00000366607 CLCN6P51797 869 aa13.38□□□□□ -0.27
TOMM20-201ENST00000366607 STX1AQ16623 288 aa13.38□□□□□ -0.27
TOMM20-201ENST00000366607 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP13.38□□□□□ -0.27
TOMM20-201ENST00000366607 ELP1O95163 1332 aa13.38□□□□□ -0.27
TOMM20-201ENST00000366607 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP13.38□□□□□ -0.27
TOMM20-201ENST00000366607 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa13.38□□□□□ -0.27
TOMM20-201ENST00000366607 TAF3Q5VWG9 929 aa13.38□□□□□ -0.27
TOMM20-201ENST00000366607 TM6SF1Q9BZW5 370 aa13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.5 ms