RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331789.9

ACTB-201, Transcript of actin beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ACTB, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-201ENST00000331789 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP21.69■■□□□ 1.06
ACTB-201ENST00000331789 NEUROD6Q96NK8 337 aa21.69■■□□□ 1.06
ACTB-201ENST00000331789 FOXD4L1Q9NU39 408 aa21.69■■□□□ 1.06
ACTB-201ENST00000331789 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP21.68■■□□□ 1.06
ACTB-201ENST00000331789 TTLL11Q8NHH1 800 aa21.68■■□□□ 1.06
ACTB-201ENST00000331789 RUFY2Q8WXA3 655 aa21.68■■□□□ 1.06
ACTB-201ENST00000331789 GPR108Q9NPR9 543 aa21.68■■□□□ 1.06
ACTB-201ENST00000331789 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP21.68■■□□□ 1.06
ACTB-201ENST00000331789 CAMTA2O94983 1202 aa21.68■■□□□ 1.06
ACTB-201ENST00000331789 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP21.68■■□□□ 1.06
ACTB-201ENST00000331789 LINC00116Q8NCU8 138 aa21.68■■□□□ 1.06
ACTB-201ENST00000331789 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa21.68■■□□□ 1.06
ACTB-201ENST00000331789 HSPA4P34932 840 aa21.67■■□□□ 1.06
ACTB-201ENST00000331789 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa21.67■■□□□ 1.06
ACTB-201ENST00000331789 FSD1Q9BTV5 496 aa21.67■■□□□ 1.06
ACTB-201ENST00000331789 CHMP5Q9NZZ3 219 aa21.67■■□□□ 1.06
ACTB-201ENST00000331789 AFF2P51816 1311 aa21.67■■□□□ 1.06
ACTB-201ENST00000331789 ZNF831Q5JPB2 1677 aa21.67■■□□□ 1.06
ACTB-201ENST00000331789 DDIT3P35638 169 aa21.67■■□□□ 1.06
ACTB-201ENST00000331789 CTSWP56202 376 aa21.67■■□□□ 1.06
ACTB-201ENST00000331789 ANAPC15P60006 121 aa21.67■■□□□ 1.06
ACTB-201ENST00000331789 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP21.67■■□□□ 1.06
ACTB-201ENST00000331789 TAF7LQ5H9L4 462 aa21.67■■□□□ 1.06
ACTB-201ENST00000331789 SUSD4Q5VX71 490 aa21.67■■□□□ 1.06
ACTB-201ENST00000331789 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP21.67■■□□□ 1.06
ACTB-201ENST00000331789 FAM227BQ96M60 508 aa21.67■■□□□ 1.06
ACTB-201ENST00000331789 RAD50Q92878 1312 aa21.66■■□□□ 1.06
ACTB-201ENST00000331789 ST18O60284 1047 aa21.66■■□□□ 1.06
ACTB-201ENST00000331789 GREM2Q9H772 168 aa21.66■■□□□ 1.06
ACTB-201ENST00000331789 CEP126Q9P2H0 1117 aa21.66■■□□□ 1.06
ACTB-201ENST00000331789 BTAF1O14981 1849 aa21.66■■□□□ 1.06
ACTB-201ENST00000331789 ZNF609O15014 1411 aa21.65■■□□□ 1.06
ACTB-201ENST00000331789 FAM177BA6PVY3 158 aa21.65■■□□□ 1.06
ACTB-201ENST00000331789 HIP1O00291 1037 aa21.65■■□□□ 1.06
ACTB-201ENST00000331789 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP21.65■■□□□ 1.06
ACTB-201ENST00000331789 PDE8AO60658 829 aa21.65■■□□□ 1.06
ACTB-201ENST00000331789 ITGA6P23229 1130 aa21.65■■□□□ 1.06
ACTB-201ENST00000331789 NEK4P51957 841 aa21.65■■□□□ 1.06
ACTB-201ENST00000331789 PTH1RQ03431 593 aa21.65■■□□□ 1.06
ACTB-201ENST00000331789 IL17RAQ96F46 866 aa21.65■■□□□ 1.06
ACTB-201ENST00000331789 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP21.65■■□□□ 1.06
ACTB-201ENST00000331789 A0A1B0GUL7 405 aa21.64■■□□□ 1.05
ACTB-201ENST00000331789 HAUS7Q99871 368 aa21.64■■□□□ 1.05
ACTB-201ENST00000331789 FBXO3Q9UK99 471 aa21.64■■□□□ 1.05
ACTB-201ENST00000331789 A0A0D9SFI3 127 aa21.63■■□□□ 1.05
ACTB-201ENST00000331789 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa21.63■■□□□ 1.05
ACTB-201ENST00000331789 NHSQ6T4R5 1651 aa21.62■■□□□ 1.05
ACTB-201ENST00000331789 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
ACTB-201ENST00000331789 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP21.61■■□□□ 1.05
ACTB-201ENST00000331789 SNX14Q9Y5W7 946 aa21.61■■□□□ 1.05
ACTB-201ENST00000331789 SH3TC1Q8TE82 1336 aa21.61■■□□□ 1.05
ACTB-201ENST00000331789 SMIM5Q71RC9 77 aa21.61■■□□□ 1.05
ACTB-201ENST00000331789 RASEFQ8IZ41 740 aa21.61■■□□□ 1.05
ACTB-201ENST00000331789 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP21.61■■□□□ 1.05
ACTB-201ENST00000331789 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa21.61■■□□□ 1.05
ACTB-201ENST00000331789 BCORQ6W2J9 1755 aa21.6■■□□□ 1.05
ACTB-201ENST00000331789 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa21.6■■□□□ 1.05
ACTB-201ENST00000331789 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
ACTB-201ENST00000331789 ATRNO75882 1429 aa21.6■■□□□ 1.05
ACTB-201ENST00000331789 ADORA1P30542 326 aa21.59■■□□□ 1.05
ACTB-201ENST00000331789 PARP10Q53GL7 1025 aa21.59■■□□□ 1.05
ACTB-201ENST00000331789 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
ACTB-201ENST00000331789 SNRKQ9NRH2 765 aa21.59■■□□□ 1.05
ACTB-201ENST00000331789 AKAP2Q9Y2D5 859 aa21.59■■□□□ 1.05
ACTB-201ENST00000331789 SBF2Q86WG5 1849 aa21.59■■□□□ 1.05
ACTB-201ENST00000331789 CCDC171Q6TFL3 1326 aa21.59■■□□□ 1.05
ACTB-201ENST00000331789 CHGBP05060 677 aa21.59■■□□□ 1.05
ACTB-201ENST00000331789 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.05
ACTB-201ENST00000331789 RIC1Q4ADV7 1423 aa21.58■■□□□ 1.05
ACTB-201ENST00000331789 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa21.58■■□□□ 1.05
ACTB-201ENST00000331789 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.04
ACTB-201ENST00000331789 METTL24Q5JXM2 366 aa21.58■■□□□ 1.04
ACTB-201ENST00000331789 XAGE2Q96GT9 111 aa21.58■■□□□ 1.04
ACTB-201ENST00000331789 AK7Q96M32 723 aa21.58■■□□□ 1.04
ACTB-201ENST00000331789 CNNM1Q9NRU3 951 aa21.58■■□□□ 1.04
ACTB-201ENST00000331789 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.04
ACTB-201ENST00000331789 NTSR2O95665 410 aa21.57■■□□□ 1.04
ACTB-201ENST00000331789 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
ACTB-201ENST00000331789 SEPT12Q8IYM1 358 aa21.57■■□□□ 1.04
ACTB-201ENST00000331789 PAG1Q9NWQ8 432 aa21.57■■□□□ 1.04
ACTB-201ENST00000331789 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
ACTB-201ENST00000331789 GOLIM4O00461 696 aa21.57■■□□□ 1.04
ACTB-201ENST00000331789 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
ACTB-201ENST00000331789 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
ACTB-201ENST00000331789 MED23Q9ULK4 1368 aa21.56■■□□□ 1.04
ACTB-201ENST00000331789 KBTBD3Q8NAB2 608 aa21.56■■□□□ 1.04
ACTB-201ENST00000331789 ZNF652Q9Y2D9 606 aa21.56■■□□□ 1.04
ACTB-201ENST00000331789 NECTIN1Q15223 517 aa21.55■■□□□ 1.04
ACTB-201ENST00000331789 GORABQ5T7V8 394 aa21.55■■□□□ 1.04
ACTB-201ENST00000331789 MAP4K1Q92918 833 aa21.55■■□□□ 1.04
ACTB-201ENST00000331789 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
ACTB-201ENST00000331789 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
ACTB-201ENST00000331789 ATP2B3Q16720 1220 aa21.55■■□□□ 1.04
ACTB-201ENST00000331789 CLEC4GQ6UXB4 293 aa21.55■■□□□ 1.04
ACTB-201ENST00000331789 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
ACTB-201ENST00000331789 KCNB2Q92953 911 aa21.55■■□□□ 1.04
ACTB-201ENST00000331789 RFX7Q2KHR2 1363 aa21.55■■□□□ 1.04
ACTB-201ENST00000331789 MCM2P49736 904 aa21.54■■□□□ 1.04
ACTB-201ENST00000331789 CCDC158Q5M9N0 1113 aa21.54■■□□□ 1.04
ACTB-201ENST00000331789 TTC39AQ5SRH9 613 aa21.54■■□□□ 1.04
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