RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331462.5

HOXD1-201, Transcript of homeobox D1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD1, Length 1,975 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD1-201ENST00000331462 COPS6Q7L5N1 327 aa26.8■■□□□ 1.88
HOXD1-201ENST00000331462 MYD88Q99836 296 aa26.8■■□□□ 1.88
HOXD1-201ENST00000331462 SLC39A6Q13433 755 aa26.8■■□□□ 1.88
HOXD1-201ENST00000331462 KLHDC4Q8TBB5 520 aa26.8■■□□□ 1.88
HOXD1-201ENST00000331462 TAF6LQ9Y6J9 622 aa26.8■■□□□ 1.88
HOXD1-201ENST00000331462 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP26.79■■□□□ 1.88
HOXD1-201ENST00000331462 SPTLC3Q9NUV7 552 aa26.79■■□□□ 1.88
HOXD1-201ENST00000331462 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP26.79■■□□□ 1.88
HOXD1-201ENST00000331462 MEGF6O75095 1541 aa26.79■■□□□ 1.88
HOXD1-201ENST00000331462 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP26.78■■□□□ 1.88
HOXD1-201ENST00000331462 TNNI3KQ59H18 835 aa26.78■■□□□ 1.88
HOXD1-201ENST00000331462 LMOD2Q6P5Q4 547 aa26.78■■□□□ 1.88
HOXD1-201ENST00000331462 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa26.78■■□□□ 1.88
HOXD1-201ENST00000331462 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa26.78■■□□□ 1.88
HOXD1-201ENST00000331462 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa26.78■■□□□ 1.88
HOXD1-201ENST00000331462 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa26.78■■□□□ 1.88
HOXD1-201ENST00000331462 COL18A1P39060 1754 aa26.78■■□□□ 1.88
HOXD1-201ENST00000331462 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP26.77■■□□□ 1.88
HOXD1-201ENST00000331462 MYL6BP14649 208 aa26.77■■□□□ 1.88
HOXD1-201ENST00000331462 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP26.77■■□□□ 1.88
HOXD1-201ENST00000331462 PKD1L3Q7Z443 1732 aa26.77■■□□□ 1.88
HOXD1-201ENST00000331462 GLI3P10071 1580 aa26.77■■□□□ 1.88
HOXD1-201ENST00000331462 TPM3P06753 285 aa26.77■■□□□ 1.88
HOXD1-201ENST00000331462 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP26.77■■□□□ 1.88
HOXD1-201ENST00000331462 TATP17735 454 aaPredicted RBP26.77■■□□□ 1.88
HOXD1-201ENST00000331462 LAMB4A4D0S4 1761 aa26.76■■□□□ 1.87
HOXD1-201ENST00000331462 NUP62CLQ9H1M0 184 aa26.76■■□□□ 1.87
HOXD1-201ENST00000331462 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP26.75■■□□□ 1.87
HOXD1-201ENST00000331462 MAP3K11Q16584 847 aa26.75■■□□□ 1.87
HOXD1-201ENST00000331462 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa26.75■■□□□ 1.87
HOXD1-201ENST00000331462 FAM200AQ8TCP9 573 aa26.75■■□□□ 1.87
HOXD1-201ENST00000331462 GTF3C6Q969F1 213 aa26.75■■□□□ 1.87
HOXD1-201ENST00000331462 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP26.75■■□□□ 1.87
HOXD1-201ENST00000331462 ZNF609O15014 1411 aa26.75■■□□□ 1.87
HOXD1-201ENST00000331462 DTNBO60941 627 aa26.75■■□□□ 1.87
HOXD1-201ENST00000331462 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP26.75■■□□□ 1.87
HOXD1-201ENST00000331462 TICAM2Q86XR7 235 aa26.75■■□□□ 1.87
HOXD1-201ENST00000331462 IFNL2Q8IZJ0 200 aa26.75■■□□□ 1.87
HOXD1-201ENST00000331462 PRIMPOLQ96LW4 560 aa26.75■■□□□ 1.87
HOXD1-201ENST00000331462 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP26.74■■□□□ 1.87
HOXD1-201ENST00000331462 HAUS7Q99871 368 aa26.74■■□□□ 1.87
HOXD1-201ENST00000331462 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP26.74■■□□□ 1.87
HOXD1-201ENST00000331462 AP5Z1O43299 807 aa26.73■■□□□ 1.87
HOXD1-201ENST00000331462 FERMT3Q86UX7 667 aa26.73■■□□□ 1.87
HOXD1-201ENST00000331462 TCEANC2Q96MN5 208 aa26.73■■□□□ 1.87
HOXD1-201ENST00000331462 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP26.73■■□□□ 1.87
HOXD1-201ENST00000331462 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP26.73■■□□□ 1.87
HOXD1-201ENST00000331462 LIG1P18858 919 aa26.73■■□□□ 1.87
HOXD1-201ENST00000331462 TFCP2Q12800 502 aa26.73■■□□□ 1.87
HOXD1-201ENST00000331462 TPRNQ4KMQ1 711 aa26.73■■□□□ 1.87
HOXD1-201ENST00000331462 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP26.73■■□□□ 1.87
HOXD1-201ENST00000331462 DCAF5Q96JK2 942 aa26.73■■□□□ 1.87
HOXD1-201ENST00000331462 NEK1Q96PY6 1258 aa26.73■■□□□ 1.87
HOXD1-201ENST00000331462 CASP7P55210 303 aa26.72■■□□□ 1.87
HOXD1-201ENST00000331462 MYRIPQ8NFW9 859 aa26.72■■□□□ 1.87
HOXD1-201ENST00000331462 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP26.71■■□□□ 1.87
HOXD1-201ENST00000331462 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP26.71■■□□□ 1.87
HOXD1-201ENST00000331462 NLRP2Q9NX02 1062 aa26.71■■□□□ 1.87
HOXD1-201ENST00000331462 SH3TC1Q8TE82 1336 aa26.71■■□□□ 1.87
HOXD1-201ENST00000331462 SPATA32Q96LK8 384 aa26.71■■□□□ 1.87
HOXD1-201ENST00000331462 FMNL2Q96PY5 1086 aa26.71■■□□□ 1.87
HOXD1-201ENST00000331462 MRVI1Q9Y6F6 885 aa26.71■■□□□ 1.87
HOXD1-201ENST00000331462 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP26.7■■□□□ 1.86
HOXD1-201ENST00000331462 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP26.7■■□□□ 1.86
HOXD1-201ENST00000331462 TYRO3Q06418 890 aa26.7■■□□□ 1.86
HOXD1-201ENST00000331462 TTC5Q8N0Z6 440 aa26.7■■□□□ 1.86
HOXD1-201ENST00000331462 USP16Q9Y5T5 823 aa26.7■■□□□ 1.86
HOXD1-201ENST00000331462 PALLDQ8WX93 1383 aa26.7■■□□□ 1.86
HOXD1-201ENST00000331462 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa26.69■■□□□ 1.86
HOXD1-201ENST00000331462 FAM173BQ6P4H8 233 aa26.69■■□□□ 1.86
HOXD1-201ENST00000331462 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa26.69■■□□□ 1.86
HOXD1-201ENST00000331462 TMEM94Q12767 1356 aa26.69■■□□□ 1.86
HOXD1-201ENST00000331462 RESTQ13127 1097 aa26.69■■□□□ 1.86
HOXD1-201ENST00000331462 CLSTN2Q9H4D0 955 aa26.69■■□□□ 1.86
HOXD1-201ENST00000331462 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP26.68■■□□□ 1.86
HOXD1-201ENST00000331462 RBM10P98175 930 aaKnown RBP26.68■■□□□ 1.86
HOXD1-201ENST00000331462 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa26.67■■□□□ 1.86
HOXD1-201ENST00000331462 PLBD2Q8NHP8 589 aa26.67■■□□□ 1.86
HOXD1-201ENST00000331462 DBNDD2Q9BQY9 259 aa26.67■■□□□ 1.86
HOXD1-201ENST00000331462 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP26.67■■□□□ 1.86
HOXD1-201ENST00000331462 C19orf44Q9H6X5 657 aa26.67■■□□□ 1.86
HOXD1-201ENST00000331462 DACT1Q9NYF0 836 aa26.67■■□□□ 1.86
HOXD1-201ENST00000331462 FAM13BQ9NYF5 915 aa26.67■■□□□ 1.86
HOXD1-201ENST00000331462 CYP21A2P08686 494 aa26.67■■□□□ 1.86
HOXD1-201ENST00000331462 KBTBD3Q8NAB2 608 aa26.67■■□□□ 1.86
HOXD1-201ENST00000331462 KIAA1524Q8TCG1 905 aa26.67■■□□□ 1.86
HOXD1-201ENST00000331462 TNMDQ9H2S6 317 aa26.67■■□□□ 1.86
HOXD1-201ENST00000331462 MPNDQ8N594 471 aa26.66■■□□□ 1.86
HOXD1-201ENST00000331462 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa26.66■■□□□ 1.86
HOXD1-201ENST00000331462 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP26.66■■□□□ 1.86
HOXD1-201ENST00000331462 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa26.66■■□□□ 1.86
HOXD1-201ENST00000331462 CYP27B1O15528 508 aa26.66■■□□□ 1.86
HOXD1-201ENST00000331462 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP26.66■■□□□ 1.86
HOXD1-201ENST00000331462 STK3Q13188 491 aa26.66■■□□□ 1.86
HOXD1-201ENST00000331462 Q6ZUG5 572 aa26.66■■□□□ 1.86
HOXD1-201ENST00000331462 KCNF1Q9H3M0 494 aa26.66■■□□□ 1.86
HOXD1-201ENST00000331462 GPR108Q9NPR9 543 aa26.66■■□□□ 1.86
HOXD1-201ENST00000331462 A0A087WZG4 1122 aa26.65■■□□□ 1.86
HOXD1-201ENST00000331462 JAK2O60674 1132 aa26.65■■□□□ 1.86
HOXD1-201ENST00000331462 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP26.65■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.4 ms