RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000320857.7

SSR4-201, Transcript of signal sequence receptor subunit 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene SSR4, Length 1,671 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSR4-201ENST00000320857 CCDC87Q9NVE4 849 aa20.57■□□□□ 0.88
SSR4-201ENST00000320857 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
SSR4-201ENST00000320857 CDHR2Q9BYE9 1310 aa20.56■□□□□ 0.88
SSR4-201ENST00000320857 EYA2O00167 538 aa20.56■□□□□ 0.88
SSR4-201ENST00000320857 EIF5P55010 431 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
SSR4-201ENST00000320857 FBXO3Q9UK99 471 aa20.56■□□□□ 0.88
SSR4-201ENST00000320857 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa20.56■□□□□ 0.88
SSR4-201ENST00000320857 NEK4P51957 841 aa20.55■□□□□ 0.88
SSR4-201ENST00000320857 ITPK1Q13572 414 aa20.55■□□□□ 0.88
SSR4-201ENST00000320857 HLFQ16534 295 aa20.55■□□□□ 0.88
SSR4-201ENST00000320857 CCDC57Q2TAC2 916 aa20.55■□□□□ 0.88
SSR4-201ENST00000320857 ATG9AQ7Z3C6 839 aa20.55■□□□□ 0.88
SSR4-201ENST00000320857 NLRP10Q86W26 655 aa20.55■□□□□ 0.88
SSR4-201ENST00000320857 PALD1Q9ULE6 856 aa20.55■□□□□ 0.88
SSR4-201ENST00000320857 CRKLP46109 303 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
SSR4-201ENST00000320857 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
SSR4-201ENST00000320857 FSD1Q9BTV5 496 aa20.54■□□□□ 0.88
SSR4-201ENST00000320857 NUP98P52948 1817 aa20.54■□□□□ 0.88
SSR4-201ENST00000320857 FAM89AQ96GI7 184 aa20.54■□□□□ 0.88
SSR4-201ENST00000320857 DEKP35659 375 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
SSR4-201ENST00000320857 DBNDD2Q9BQY9 259 aa20.53■□□□□ 0.88
SSR4-201ENST00000320857 FOXD4L1Q9NU39 408 aa20.53■□□□□ 0.88
SSR4-201ENST00000320857 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
SSR4-201ENST00000320857 CSF1RP07333 972 aa20.52■□□□□ 0.88
SSR4-201ENST00000320857 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
SSR4-201ENST00000320857 RFX7Q2KHR2 1363 aa20.52■□□□□ 0.88
SSR4-201ENST00000320857 GPTP24298 496 aa20.51■□□□□ 0.87
SSR4-201ENST00000320857 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa20.51■□□□□ 0.87
SSR4-201ENST00000320857 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
SSR4-201ENST00000320857 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
SSR4-201ENST00000320857 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
SSR4-201ENST00000320857 RAB3GAP1Q15042 981 aa20.51■□□□□ 0.87
SSR4-201ENST00000320857 TAF7LQ5H9L4 462 aa20.51■□□□□ 0.87
SSR4-201ENST00000320857 FAM196AQ6ZSG2 479 aa20.51■□□□□ 0.87
SSR4-201ENST00000320857 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
SSR4-201ENST00000320857 HAUS7Q99871 368 aa20.51■□□□□ 0.87
SSR4-201ENST00000320857 SNRKQ9NRH2 765 aa20.51■□□□□ 0.87
SSR4-201ENST00000320857 CEP126Q9P2H0 1117 aa20.51■□□□□ 0.87
SSR4-201ENST00000320857 NHSQ6T4R5 1651 aa20.51■□□□□ 0.87
SSR4-201ENST00000320857 MCM4P33991 863 aa20.5■□□□□ 0.87
SSR4-201ENST00000320857 LRRC24Q50LG9 513 aa20.5■□□□□ 0.87
SSR4-201ENST00000320857 NEUROD6Q96NK8 337 aa20.5■□□□□ 0.87
SSR4-201ENST00000320857 ZNF609O15014 1411 aa20.49■□□□□ 0.87
SSR4-201ENST00000320857 ZNF34Q8IZ26 560 aa20.49■□□□□ 0.87
SSR4-201ENST00000320857 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
SSR4-201ENST00000320857 SNX14Q9Y5W7 946 aa20.49■□□□□ 0.87
SSR4-201ENST00000320857 CCDC171Q6TFL3 1326 aa20.49■□□□□ 0.87
SSR4-201ENST00000320857 TRIM37O94972 964 aa20.48■□□□□ 0.87
SSR4-201ENST00000320857 TICAM2Q86XR7 235 aa20.48■□□□□ 0.87
SSR4-201ENST00000320857 AKAP2Q9Y2D5 859 aa20.48■□□□□ 0.87
SSR4-201ENST00000320857 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
SSR4-201ENST00000320857 PTF1AQ7RTS3 328 aa20.48■□□□□ 0.87
SSR4-201ENST00000320857 FAM227BQ96M60 508 aa20.48■□□□□ 0.87
SSR4-201ENST00000320857 GBP4Q96PP9 640 aa20.48■□□□□ 0.87
SSR4-201ENST00000320857 BTAF1O14981 1849 aa20.47■□□□□ 0.87
SSR4-201ENST00000320857 CTSWP56202 376 aa20.47■□□□□ 0.87
SSR4-201ENST00000320857 NUCB2P80303 420 aa20.47■□□□□ 0.87
SSR4-201ENST00000320857 PTH1RQ03431 593 aa20.47■□□□□ 0.87
SSR4-201ENST00000320857 KCNB2Q92953 911 aa20.47■□□□□ 0.87
SSR4-201ENST00000320857 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
SSR4-201ENST00000320857 TMX3Q96JJ7 454 aa20.47■□□□□ 0.87
SSR4-201ENST00000320857 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
SSR4-201ENST00000320857 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
SSR4-201ENST00000320857 EP400Q96L91 3159 aa20.47■□□□□ 0.87
SSR4-201ENST00000320857 DDX11L8A8MPP1 907 aa20.46■□□□□ 0.87
SSR4-201ENST00000320857 PDE8AO60658 829 aa20.46■□□□□ 0.87
SSR4-201ENST00000320857 TTLL11Q8NHH1 800 aa20.46■□□□□ 0.87
SSR4-201ENST00000320857 AK7Q96M32 723 aa20.46■□□□□ 0.87
SSR4-201ENST00000320857 A0A0D9SFI3 127 aa20.45■□□□□ 0.86
SSR4-201ENST00000320857 A0A1B0GUL7 405 aa20.45■□□□□ 0.86
SSR4-201ENST00000320857 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa20.45■□□□□ 0.86
SSR4-201ENST00000320857 CAMTA2O94983 1202 aa20.45■□□□□ 0.86
SSR4-201ENST00000320857 TIMM10P62072 90 aa20.45■□□□□ 0.86
SSR4-201ENST00000320857 LINC00116Q8NCU8 138 aa20.45■□□□□ 0.86
SSR4-201ENST00000320857 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP20.45■□□□□ 0.86
SSR4-201ENST00000320857 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
SSR4-201ENST00000320857 MED23Q9ULK4 1368 aa20.45■□□□□ 0.86
SSR4-201ENST00000320857 GSE1Q14687 1217 aa20.45■□□□□ 0.86
SSR4-201ENST00000320857 MAP4K1Q92918 833 aa20.45■□□□□ 0.86
SSR4-201ENST00000320857 UBN2Q6ZU65 1347 aa20.44■□□□□ 0.86
SSR4-201ENST00000320857 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa20.44■□□□□ 0.86
SSR4-201ENST00000320857 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
SSR4-201ENST00000320857 ITGA6P23229 1130 aa20.44■□□□□ 0.86
SSR4-201ENST00000320857 KCNJ4P48050 445 aa20.44■□□□□ 0.86
SSR4-201ENST00000320857 CUL4AQ13619 759 aa20.44■□□□□ 0.86
SSR4-201ENST00000320857 PARP10Q53GL7 1025 aa20.44■□□□□ 0.86
SSR4-201ENST00000320857 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
SSR4-201ENST00000320857 RASEFQ8IZ41 740 aa20.44■□□□□ 0.86
SSR4-201ENST00000320857 SYNE4Q8N205 404 aa20.44■□□□□ 0.86
SSR4-201ENST00000320857 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
SSR4-201ENST00000320857 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
SSR4-201ENST00000320857 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
SSR4-201ENST00000320857 SBF2Q86WG5 1849 aa20.44■□□□□ 0.86
SSR4-201ENST00000320857 PTMSP20962 102 aa20.43■□□□□ 0.86
SSR4-201ENST00000320857 NECTIN1Q15223 517 aa20.43■□□□□ 0.86
SSR4-201ENST00000320857 KBTBD3Q8NAB2 608 aa20.43■□□□□ 0.86
SSR4-201ENST00000320857 TM6SF1Q9BZW5 370 aa20.43■□□□□ 0.86
SSR4-201ENST00000320857 MYH3P11055 1940 aa20.42■□□□□ 0.86
SSR4-201ENST00000320857 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
SSR4-201ENST00000320857 CCDC158Q5M9N0 1113 aa20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.9 ms