RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000314126.4

AKAP1-201, Transcript of A-kinase anchoring protein 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene AKAP1, Length 2,380 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AKAP1-201ENST00000314126 CPA1P15085 419 aa18.4■□□□□ 0.54
AKAP1-201ENST00000314126 PSMA5P28066 241 aa18.4■□□□□ 0.54
AKAP1-201ENST00000314126 KCNJ4P48050 445 aa18.4■□□□□ 0.54
AKAP1-201ENST00000314126 TCIRG1Q13488 830 aa18.4■□□□□ 0.54
AKAP1-201ENST00000314126 TSGA10IPQ3SY00 556 aa18.4■□□□□ 0.54
AKAP1-201ENST00000314126 GPT2Q8TD30 523 aa18.4■□□□□ 0.54
AKAP1-201ENST00000314126 PIGBQ92521 554 aa18.4■□□□□ 0.54
AKAP1-201ENST00000314126 HMG20BQ9P0W2 317 aa18.4■□□□□ 0.54
AKAP1-201ENST00000314126 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa18.4■□□□□ 0.54
AKAP1-201ENST00000314126 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa18.39■□□□□ 0.54
AKAP1-201ENST00000314126 USPL1Q5W0Q7 1092 aa18.39■□□□□ 0.53
AKAP1-201ENST00000314126 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP18.39■□□□□ 0.53
AKAP1-201ENST00000314126 CHMP3Q9Y3E7 222 aa18.39■□□□□ 0.53
AKAP1-201ENST00000314126 ZNF609O15014 1411 aa18.39■□□□□ 0.53
AKAP1-201ENST00000314126 EYA2O00167 538 aa18.39■□□□□ 0.53
AKAP1-201ENST00000314126 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP18.39■□□□□ 0.53
AKAP1-201ENST00000314126 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP18.39■□□□□ 0.53
AKAP1-201ENST00000314126 PALLDQ8WX93 1383 aa18.38■□□□□ 0.53
AKAP1-201ENST00000314126 TAF5LO75529 589 aa18.38■□□□□ 0.53
AKAP1-201ENST00000314126 MBD3O95983 291 aa18.38■□□□□ 0.53
AKAP1-201ENST00000314126 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP18.38■□□□□ 0.53
AKAP1-201ENST00000314126 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP18.38■□□□□ 0.53
AKAP1-201ENST00000314126 FAM43AQ8N2R8 423 aa18.38■□□□□ 0.53
AKAP1-201ENST00000314126 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP18.38■□□□□ 0.53
AKAP1-201ENST00000314126 ASAP1Q9ULH1 1129 aa18.38■□□□□ 0.53
AKAP1-201ENST00000314126 BCL9O00512 1426 aa18.38■□□□□ 0.53
AKAP1-201ENST00000314126 LARGE1O95461 756 aa18.38■□□□□ 0.53
AKAP1-201ENST00000314126 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa18.37■□□□□ 0.53
AKAP1-201ENST00000314126 DNAJC10Q8IXB1 793 aa18.37■□□□□ 0.53
AKAP1-201ENST00000314126 CHAMP1Q96JM3 812 aa18.37■□□□□ 0.53
AKAP1-201ENST00000314126 FBXO3Q9UK99 471 aa18.37■□□□□ 0.53
AKAP1-201ENST00000314126 STARD3NLO95772 234 aa18.37■□□□□ 0.53
AKAP1-201ENST00000314126 KBTBD3Q8NAB2 608 aa18.37■□□□□ 0.53
AKAP1-201ENST00000314126 PLA2G12BQ9BX93 195 aa18.37■□□□□ 0.53
AKAP1-201ENST00000314126 SMC3Q9UQE7 1217 aa18.37■□□□□ 0.53
AKAP1-201ENST00000314126 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP18.36■□□□□ 0.53
AKAP1-201ENST00000314126 NCLP19338 710 aaKnown RBP18.36■□□□□ 0.53
AKAP1-201ENST00000314126 KIF6Q6ZMV9 814 aa18.35■□□□□ 0.53
AKAP1-201ENST00000314126 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP18.35■□□□□ 0.53
AKAP1-201ENST00000314126 SH3TC1Q8TE82 1336 aa18.35■□□□□ 0.53
AKAP1-201ENST00000314126 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP18.35■□□□□ 0.53
AKAP1-201ENST00000314126 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP18.35■□□□□ 0.53
AKAP1-201ENST00000314126 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP18.35■□□□□ 0.53
AKAP1-201ENST00000314126 MYH3P11055 1940 aa18.35■□□□□ 0.53
AKAP1-201ENST00000314126 STX6O43752 255 aa18.34■□□□□ 0.53
AKAP1-201ENST00000314126 ANKRD1Q15327 319 aa18.34■□□□□ 0.53
AKAP1-201ENST00000314126 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa18.34■□□□□ 0.53
AKAP1-201ENST00000314126 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa18.34■□□□□ 0.53
AKAP1-201ENST00000314126 SYT1P21579 422 aa18.34■□□□□ 0.53
AKAP1-201ENST00000314126 RPS6KB1P23443 525 aa18.34■□□□□ 0.53
AKAP1-201ENST00000314126 KRT32Q14532 448 aa18.34■□□□□ 0.53
AKAP1-201ENST00000314126 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa18.34■□□□□ 0.53
AKAP1-201ENST00000314126 LRRC24Q50LG9 513 aa18.34■□□□□ 0.53
AKAP1-201ENST00000314126 CCDC83Q8IWF9 413 aa18.34■□□□□ 0.53
AKAP1-201ENST00000314126 TMEM87AQ8NBN3 555 aa18.34■□□□□ 0.53
AKAP1-201ENST00000314126 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP18.34■□□□□ 0.53
AKAP1-201ENST00000314126 ST3GAL1Q11201 340 aa18.33■□□□□ 0.53
AKAP1-201ENST00000314126 ME3Q16798 604 aa18.33■□□□□ 0.53
AKAP1-201ENST00000314126 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa18.33■□□□□ 0.53
AKAP1-201ENST00000314126 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP18.33■□□□□ 0.53
AKAP1-201ENST00000314126 NUP98P52948 1817 aa18.33■□□□□ 0.52
AKAP1-201ENST00000314126 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP18.33■□□□□ 0.52
AKAP1-201ENST00000314126 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP18.33■□□□□ 0.52
AKAP1-201ENST00000314126 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP18.33■□□□□ 0.52
AKAP1-201ENST00000314126 NEUROD6Q96NK8 337 aa18.33■□□□□ 0.52
AKAP1-201ENST00000314126 PAG1Q9NWQ8 432 aa18.33■□□□□ 0.52
AKAP1-201ENST00000314126 DOT1LQ8TEK3 1739 aa18.32■□□□□ 0.52
AKAP1-201ENST00000314126 CDHR2Q9BYE9 1310 aa18.32■□□□□ 0.52
AKAP1-201ENST00000314126 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP18.32■□□□□ 0.52
AKAP1-201ENST00000314126 TMEM63CQ9P1W3 806 aa18.32■□□□□ 0.52
AKAP1-201ENST00000314126 TPCN1Q9ULQ1 816 aa18.32■□□□□ 0.52
AKAP1-201ENST00000314126 LAMA4Q16363 1823 aa18.32■□□□□ 0.52
AKAP1-201ENST00000314126 KAT6BQ8WYB5 2073 aa18.32■□□□□ 0.52
AKAP1-201ENST00000314126 A0A1B0GUL7 405 aa18.32■□□□□ 0.52
AKAP1-201ENST00000314126 CSF1RP07333 972 aa18.32■□□□□ 0.52
AKAP1-201ENST00000314126 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP18.32■□□□□ 0.52
AKAP1-201ENST00000314126 GJB2P29033 226 aa18.32■□□□□ 0.52
AKAP1-201ENST00000314126 TIMM10P62072 90 aa18.32■□□□□ 0.52
AKAP1-201ENST00000314126 CCDC57Q2TAC2 916 aa18.32■□□□□ 0.52
AKAP1-201ENST00000314126 HELLSQ9NRZ9 838 aa18.32■□□□□ 0.52
AKAP1-201ENST00000314126 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP18.32■□□□□ 0.52
AKAP1-201ENST00000314126 F13A1P00488 732 aa18.31■□□□□ 0.52
AKAP1-201ENST00000314126 TAF6LQ9Y6J9 622 aa18.31■□□□□ 0.52
AKAP1-201ENST00000314126 NRAPQ86VF7 1730 aa18.31■□□□□ 0.52
AKAP1-201ENST00000314126 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP18.31■□□□□ 0.52
AKAP1-201ENST00000314126 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa18.31■□□□□ 0.52
AKAP1-201ENST00000314126 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP18.31■□□□□ 0.52
AKAP1-201ENST00000314126 CEP126Q9P2H0 1117 aa18.31■□□□□ 0.52
AKAP1-201ENST00000314126 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP18.31■□□□□ 0.52
AKAP1-201ENST00000314126 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa18.31■□□□□ 0.52
AKAP1-201ENST00000314126 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP18.3■□□□□ 0.52
AKAP1-201ENST00000314126 SLC4A9Q96Q91 983 aa18.3■□□□□ 0.52
AKAP1-201ENST00000314126 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP18.3■□□□□ 0.52
AKAP1-201ENST00000314126 GOLIM4O00461 696 aa18.3■□□□□ 0.52
AKAP1-201ENST00000314126 EXOC5O00471 708 aa18.3■□□□□ 0.52
AKAP1-201ENST00000314126 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP18.3■□□□□ 0.52
AKAP1-201ENST00000314126 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP18.3■□□□□ 0.52
AKAP1-201ENST00000314126 NASPP49321 788 aaPredicted RBP18.29■□□□□ 0.52
AKAP1-201ENST00000314126 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa18.29■□□□□ 0.52
AKAP1-201ENST00000314126 AKAP2Q9Y2D5 859 aa18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14 ms