RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000311101.9

PARL-201, Transcript of presenilin associated rhomboid like, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PARL, Length 1,240 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARL-201ENST00000311101 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP25.39■■□□□ 1.66
PARL-201ENST00000311101 COL4A1P02462 1669 aa25.39■■□□□ 1.66
PARL-201ENST00000311101 TAF1P21675 1872 aa25.39■■□□□ 1.66
PARL-201ENST00000311101 F6X3S4 739 aa25.39■■□□□ 1.66
PARL-201ENST00000311101 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP25.39■■□□□ 1.66
PARL-201ENST00000311101 BBOX1O75936 387 aa25.38■■□□□ 1.65
PARL-201ENST00000311101 PSMD1Q99460 953 aa25.38■■□□□ 1.65
PARL-201ENST00000311101 CDHR2Q9BYE9 1310 aa25.37■■□□□ 1.65
PARL-201ENST00000311101 GLTPD2A6NH11 291 aa25.36■■□□□ 1.65
PARL-201ENST00000311101 PDE8AO60658 829 aa25.36■■□□□ 1.65
PARL-201ENST00000311101 GCKRQ14397 625 aa25.36■■□□□ 1.65
PARL-201ENST00000311101 LINS1Q8NG48 757 aa25.36■■□□□ 1.65
PARL-201ENST00000311101 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP25.36■■□□□ 1.65
PARL-201ENST00000311101 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP25.36■■□□□ 1.65
PARL-201ENST00000311101 H7C1W4 665 aa25.35■■□□□ 1.65
PARL-201ENST00000311101 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP25.35■■□□□ 1.65
PARL-201ENST00000311101 IARSP41252 1262 aaKnown RBP25.35■■□□□ 1.65
PARL-201ENST00000311101 GRIPAP1Q4V328 841 aa25.35■■□□□ 1.65
PARL-201ENST00000311101 SP8Q8IXZ3 490 aa25.35■■□□□ 1.65
PARL-201ENST00000311101 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP25.35■■□□□ 1.65
PARL-201ENST00000311101 BEND3Q5T5X7 828 aa25.34■■□□□ 1.65
PARL-201ENST00000311101 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa25.34■■□□□ 1.65
PARL-201ENST00000311101 SSH1Q8WYL5 1049 aa25.34■■□□□ 1.65
PARL-201ENST00000311101 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP25.34■■□□□ 1.65
PARL-201ENST00000311101 SEC31BQ9NQW1 1179 aa25.34■■□□□ 1.65
PARL-201ENST00000311101 WDR90Q96KV7 1748 aa25.33■■□□□ 1.65
PARL-201ENST00000311101 APLP1P51693 650 aa25.32■■□□□ 1.64
PARL-201ENST00000311101 CASP7P55210 303 aa25.32■■□□□ 1.64
PARL-201ENST00000311101 BCL2L13Q9BXK5 485 aa25.32■■□□□ 1.64
PARL-201ENST00000311101 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP25.32■■□□□ 1.64
PARL-201ENST00000311101 COL4A5P29400 1685 aa25.32■■□□□ 1.64
PARL-201ENST00000311101 CTSWP56202 376 aa25.31■■□□□ 1.64
PARL-201ENST00000311101 CCDC152Q4G0S7 254 aa25.31■■□□□ 1.64
PARL-201ENST00000311101 RPS8P62241 208 aaKnown RBP25.3■■□□□ 1.64
PARL-201ENST00000311101 DPY19L2Q6NUT2 758 aa25.3■■□□□ 1.64
PARL-201ENST00000311101 TMC4Q7Z404 712 aa25.3■■□□□ 1.64
PARL-201ENST00000311101 LRRC37AA6NMS7 1700 aa25.29■■□□□ 1.64
PARL-201ENST00000311101 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP25.29■■□□□ 1.64
PARL-201ENST00000311101 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP25.29■■□□□ 1.64
PARL-201ENST00000311101 MPNDQ8N594 471 aa25.29■■□□□ 1.64
PARL-201ENST00000311101 TTLL11Q8NHH1 800 aa25.29■■□□□ 1.64
PARL-201ENST00000311101 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP25.29■■□□□ 1.64
PARL-201ENST00000311101 ZNF541Q9H0D2 1346 aa25.29■■□□□ 1.64
PARL-201ENST00000311101 DDNO94850 711 aaPredicted RBP25.28■■□□□ 1.64
PARL-201ENST00000311101 SLC4A10Q6U841 1118 aa25.28■■□□□ 1.64
PARL-201ENST00000311101 POTECB2RU33 542 aa25.27■■□□□ 1.64
PARL-201ENST00000311101 FZD9O00144 591 aa25.27■■□□□ 1.64
PARL-201ENST00000311101 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP25.27■■□□□ 1.64
PARL-201ENST00000311101 HTRA3P83110 453 aa25.27■■□□□ 1.64
PARL-201ENST00000311101 FSTL1Q12841 308 aa25.27■■□□□ 1.64
PARL-201ENST00000311101 AOC3Q16853 763 aa25.27■■□□□ 1.64
PARL-201ENST00000311101 ALDH1L2Q3SY69 923 aa25.27■■□□□ 1.64
PARL-201ENST00000311101 LARGE2Q8N3Y3 721 aa25.27■■□□□ 1.64
PARL-201ENST00000311101 PLA2G12BQ9BX93 195 aa25.27■■□□□ 1.64
PARL-201ENST00000311101 DUOX1Q9NRD9 1551 aa25.27■■□□□ 1.64
PARL-201ENST00000311101 GREM2Q9H772 168 aa25.26■■□□□ 1.63
PARL-201ENST00000311101 PPIP5K2O43314 1243 aa25.25■■□□□ 1.63
PARL-201ENST00000311101 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP25.25■■□□□ 1.63
PARL-201ENST00000311101 GPSM2P81274 684 aa25.25■■□□□ 1.63
PARL-201ENST00000311101 SUPT20HQ8NEM7 779 aa25.25■■□□□ 1.63
PARL-201ENST00000311101 JDP2Q8WYK2 163 aa25.25■■□□□ 1.63
PARL-201ENST00000311101 SMC4Q9NTJ3 1288 aa25.25■■□□□ 1.63
PARL-201ENST00000311101 PTPRCP08575 1304 aa25.25■■□□□ 1.63
PARL-201ENST00000311101 SMC1BQ8NDV3 1235 aa25.24■■□□□ 1.63
PARL-201ENST00000311101 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
PARL-201ENST00000311101 ALDH1L1O75891 902 aa25.23■■□□□ 1.63
PARL-201ENST00000311101 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa25.23■■□□□ 1.63
PARL-201ENST00000311101 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa25.23■■□□□ 1.63
PARL-201ENST00000311101 MYH3P11055 1940 aa25.23■■□□□ 1.63
PARL-201ENST00000311101 RTL9Q8NET4 1388 aa25.22■■□□□ 1.63
PARL-201ENST00000311101 GRM8O00222 908 aa25.22■■□□□ 1.63
PARL-201ENST00000311101 NIM1KQ8IY84 436 aa25.22■■□□□ 1.63
PARL-201ENST00000311101 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa25.22■■□□□ 1.63
PARL-201ENST00000311101 VPS33BQ9H267 617 aa25.22■■□□□ 1.63
PARL-201ENST00000311101 LTBP1Q14766 1721 aa25.21■■□□□ 1.63
PARL-201ENST00000311101 CSF1RP07333 972 aa25.21■■□□□ 1.63
PARL-201ENST00000311101 KIAA2012Q0VF49 1180 aa25.21■■□□□ 1.63
PARL-201ENST00000311101 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
PARL-201ENST00000311101 POLLQ9UGP5 575 aa25.21■■□□□ 1.63
PARL-201ENST00000311101 FOXO4P98177 505 aa25.2■■□□□ 1.62
PARL-201ENST00000311101 FAM161AQ3B820 660 aa25.2■■□□□ 1.62
PARL-201ENST00000311101 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.62
PARL-201ENST00000311101 RARSP54136 660 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
PARL-201ENST00000311101 EPHA10Q5JZY3 1008 aa25.19■■□□□ 1.62
PARL-201ENST00000311101 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
PARL-201ENST00000311101 C6orf229H3BNL8 230 aa25.18■■□□□ 1.62
PARL-201ENST00000311101 ITGA6P23229 1130 aa25.18■■□□□ 1.62
PARL-201ENST00000311101 EIF6P56537 245 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
PARL-201ENST00000311101 TBC1D16Q8TBP0 767 aa25.18■■□□□ 1.62
PARL-201ENST00000311101 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
PARL-201ENST00000311101 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
PARL-201ENST00000311101 WASHC4Q2M389 1173 aa25.17■■□□□ 1.62
PARL-201ENST00000311101 GPC2Q8N158 579 aa25.17■■□□□ 1.62
PARL-201ENST00000311101 PODXL2Q9NZ53 605 aa25.17■■□□□ 1.62
PARL-201ENST00000311101 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
PARL-201ENST00000311101 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
PARL-201ENST00000311101 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
PARL-201ENST00000311101 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa25.16■■□□□ 1.62
PARL-201ENST00000311101 ZNRF3Q9ULT6 936 aa25.16■■□□□ 1.62
PARL-201ENST00000311101 GJA3Q9Y6H8 435 aa25.16■■□□□ 1.62
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