RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000311008.15

SPNS1-201, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SPNS1, Length 2,208 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-201ENST00000311008 FAM184AQ8NB25 1140 aa23.35■■□□□ 1.33
SPNS1-201ENST00000311008 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP23.35■■□□□ 1.33
SPNS1-201ENST00000311008 CNPY2Q9Y2B0 182 aa23.35■■□□□ 1.33
SPNS1-201ENST00000311008 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa23.35■■□□□ 1.33
SPNS1-201ENST00000311008 H7C1W4 665 aa23.35■■□□□ 1.33
SPNS1-201ENST00000311008 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
SPNS1-201ENST00000311008 RPS6KB1P23443 525 aa23.35■■□□□ 1.33
SPNS1-201ENST00000311008 MSNP26038 577 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
SPNS1-201ENST00000311008 MTMR6Q9Y217 621 aa23.35■■□□□ 1.33
SPNS1-201ENST00000311008 TAF5LO75529 589 aa23.34■■□□□ 1.33
SPNS1-201ENST00000311008 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP23.34■■□□□ 1.33
SPNS1-201ENST00000311008 HAUS7Q99871 368 aa23.34■■□□□ 1.33
SPNS1-201ENST00000311008 TPCN1Q9ULQ1 816 aa23.33■■□□□ 1.33
SPNS1-201ENST00000311008 GPR108Q9NPR9 543 aa23.33■■□□□ 1.33
SPNS1-201ENST00000311008 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP23.32■■□□□ 1.32
SPNS1-201ENST00000311008 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP23.32■■□□□ 1.32
SPNS1-201ENST00000311008 LMBR1LQ6UX01 489 aa23.32■■□□□ 1.32
SPNS1-201ENST00000311008 PRDM11Q9NQV5 511 aa23.32■■□□□ 1.32
SPNS1-201ENST00000311008 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP23.32■■□□□ 1.32
SPNS1-201ENST00000311008 UVSSAQ2YD98 709 aa23.31■■□□□ 1.32
SPNS1-201ENST00000311008 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa23.31■■□□□ 1.32
SPNS1-201ENST00000311008 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP23.31■■□□□ 1.32
SPNS1-201ENST00000311008 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP23.31■■□□□ 1.32
SPNS1-201ENST00000311008 NBPF26B4DH59 902 aa23.31■■□□□ 1.32
SPNS1-201ENST00000311008 FOXO4P98177 505 aa23.31■■□□□ 1.32
SPNS1-201ENST00000311008 ST3GAL1Q11201 340 aa23.31■■□□□ 1.32
SPNS1-201ENST00000311008 NBPF14Q5TI25 921 aa23.31■■□□□ 1.32
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SPNS1-201ENST00000311008 NBPF15Q8N660 670 aa23.31■■□□□ 1.32
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SPNS1-201ENST00000311008 MCM5P33992 734 aa23.29■■□□□ 1.32
SPNS1-201ENST00000311008 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa23.29■■□□□ 1.32
SPNS1-201ENST00000311008 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
SPNS1-201ENST00000311008 CCDC191Q8NCU4 936 aa23.29■■□□□ 1.32
SPNS1-201ENST00000311008 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP23.29■■□□□ 1.32
SPNS1-201ENST00000311008 DBNDD2Q9BQY9 259 aa23.29■■□□□ 1.32
SPNS1-201ENST00000311008 TCHHQ07283 1943 aa23.29■■□□□ 1.32
SPNS1-201ENST00000311008 UBR2Q8IWV8 1755 aa23.29■■□□□ 1.32
SPNS1-201ENST00000311008 ATG3Q9NT62 314 aa23.29■■□□□ 1.32
SPNS1-201ENST00000311008 IL15P40933 162 aaPredicted RBP23.28■■□□□ 1.32
SPNS1-201ENST00000311008 NECAB1Q8N987 351 aa23.28■■□□□ 1.32
SPNS1-201ENST00000311008 CCDC39Q9UFE4 941 aa23.28■■□□□ 1.32
SPNS1-201ENST00000311008 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP23.28■■□□□ 1.32
SPNS1-201ENST00000311008 FIBPO43427 364 aa23.28■■□□□ 1.32
SPNS1-201ENST00000311008 KBTBD3Q8NAB2 608 aa23.28■■□□□ 1.32
SPNS1-201ENST00000311008 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
SPNS1-201ENST00000311008 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
SPNS1-201ENST00000311008 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
SPNS1-201ENST00000311008 CARD10Q9BWT7 1032 aa23.27■■□□□ 1.32
SPNS1-201ENST00000311008 SH3TC1Q8TE82 1336 aa23.27■■□□□ 1.32
SPNS1-201ENST00000311008 IL2RBP14784 551 aa23.27■■□□□ 1.31
SPNS1-201ENST00000311008 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.31
SPNS1-201ENST00000311008 RNF214Q8ND24 703 aa23.27■■□□□ 1.31
SPNS1-201ENST00000311008 NEK1Q96PY6 1258 aa23.27■■□□□ 1.31
SPNS1-201ENST00000311008 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP23.26■■□□□ 1.31
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SPNS1-201ENST00000311008 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP23.26■■□□□ 1.31
SPNS1-201ENST00000311008 CHMP3Q9Y3E7 222 aa23.26■■□□□ 1.31
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SPNS1-201ENST00000311008 KRT85P78386 507 aa23.25■■□□□ 1.31
SPNS1-201ENST00000311008 NUP188Q5SRE5 1749 aa23.25■■□□□ 1.31
SPNS1-201ENST00000311008 ZNF609O15014 1411 aa23.25■■□□□ 1.31
SPNS1-201ENST00000311008 PAPPAQ13219 1627 aa23.25■■□□□ 1.31
SPNS1-201ENST00000311008 TTLL7Q6ZT98 887 aa23.25■■□□□ 1.31
SPNS1-201ENST00000311008 ATG9AQ7Z3C6 839 aa23.25■■□□□ 1.31
SPNS1-201ENST00000311008 HELLSQ9NRZ9 838 aa23.25■■□□□ 1.31
SPNS1-201ENST00000311008 CIAO1O76071 339 aa23.24■■□□□ 1.31
SPNS1-201ENST00000311008 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
SPNS1-201ENST00000311008 ELP1O95163 1332 aa23.24■■□□□ 1.31
SPNS1-201ENST00000311008 TNS2Q63HR2 1409 aa23.24■■□□□ 1.31
SPNS1-201ENST00000311008 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
SPNS1-201ENST00000311008 EYA2O00167 538 aa23.23■■□□□ 1.31
SPNS1-201ENST00000311008 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa23.23■■□□□ 1.31
SPNS1-201ENST00000311008 A1BGP04217 495 aa23.22■■□□□ 1.31
SPNS1-201ENST00000311008 PAG1Q9NWQ8 432 aa23.22■■□□□ 1.31
SPNS1-201ENST00000311008 FBXO3Q9UK99 471 aa23.22■■□□□ 1.31
SPNS1-201ENST00000311008 TAF6LQ9Y6J9 622 aa23.22■■□□□ 1.31
SPNS1-201ENST00000311008 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
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SPNS1-201ENST00000311008 NEUROD6Q96NK8 337 aa23.21■■□□□ 1.31
SPNS1-201ENST00000311008 DSCC1Q9BVC3 393 aa23.21■■□□□ 1.31
SPNS1-201ENST00000311008 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP23.21■■□□□ 1.31
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SPNS1-201ENST00000311008 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP23.2■■□□□ 1.3
SPNS1-201ENST00000311008 GTF3C6Q969F1 213 aa23.2■■□□□ 1.3
SPNS1-201ENST00000311008 TCEANC2Q96MN5 208 aa23.2■■□□□ 1.3
SPNS1-201ENST00000311008 TJP1Q07157 1748 aa23.2■■□□□ 1.3
SPNS1-201ENST00000311008 OFD1O75665 1012 aa23.2■■□□□ 1.3
SPNS1-201ENST00000311008 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP23.2■■□□□ 1.3
SPNS1-201ENST00000311008 CYP21A2P08686 494 aa23.19■■□□□ 1.3
SPNS1-201ENST00000311008 CDC37L1Q7L3B6 337 aa23.19■■□□□ 1.3
SPNS1-201ENST00000311008 ZBTB3Q9H5J0 574 aa23.19■■□□□ 1.3
SPNS1-201ENST00000311008 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP23.18■■□□□ 1.3
SPNS1-201ENST00000311008 ISCA1Q9BUE6 129 aa23.18■■□□□ 1.3
SPNS1-201ENST00000311008 SLAIN2Q9P270 581 aa23.18■■□□□ 1.3
SPNS1-201ENST00000311008 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa23.18■■□□□ 1.3
SPNS1-201ENST00000311008 SPEF2Q9C093 1822 aa23.18■■□□□ 1.3
SPNS1-201ENST00000311008 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP23.18■■□□□ 1.3
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