RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293922.1

PTX4-201, Transcript of pentraxin 4, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTX4, Length 1,422 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX4-201ENST00000293922 GRIPAP1Q4V328 841 aa23.2■■□□□ 1.3
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PTX4-201ENST00000293922 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP23.19■■□□□ 1.3
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PTX4-201ENST00000293922 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa23.19■■□□□ 1.3
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PTX4-201ENST00000293922 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP23.18■■□□□ 1.3
PTX4-201ENST00000293922 CCDC191Q8NCU4 936 aa23.18■■□□□ 1.3
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PTX4-201ENST00000293922 KIF16BQ96L93 1317 aa23.18■■□□□ 1.3
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PTX4-201ENST00000293922 ARHGAP45Q92619 1136 aa23.12■■□□□ 1.29
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PTX4-201ENST00000293922 SUPT20HQ8NEM7 779 aa23.08■■□□□ 1.29
PTX4-201ENST00000293922 SEC31BQ9NQW1 1179 aa23.08■■□□□ 1.29
PTX4-201ENST00000293922 DUOX1Q9NRD9 1551 aa23.08■■□□□ 1.28
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PTX4-201ENST00000293922 TRIM27P14373 513 aa23.08■■□□□ 1.28
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PTX4-201ENST00000293922 POTEJP0CG39 1038 aa23.07■■□□□ 1.28
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PTX4-201ENST00000293922 C20orf194Q5TEA3 1177 aa23.02■■□□□ 1.28
PTX4-201ENST00000293922 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa23.02■■□□□ 1.28
PTX4-201ENST00000293922 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP23.02■■□□□ 1.28
PTX4-201ENST00000293922 TTLL11Q8NHH1 800 aa23.02■■□□□ 1.28
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PTX4-201ENST00000293922 F6X3S4 739 aa23.01■■□□□ 1.27
PTX4-201ENST00000293922 CASP7P55210 303 aa23.01■■□□□ 1.27
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