RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000289382.7

CNOT11-201, Transcript of CCR4-NOT transcription complex subunit 11, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CNOT11, Length 2,599 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT11-201ENST00000289382 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
CNOT11-201ENST00000289382 TPCN1Q9ULQ1 816 aa22.15■■□□□ 1.14
CNOT11-201ENST00000289382 PXDNLA1KZ92 1463 aa22.15■■□□□ 1.14
CNOT11-201ENST00000289382 ELF2Q15723 593 aa22.15■■□□□ 1.14
CNOT11-201ENST00000289382 CLSTN2Q9H4D0 955 aa22.15■■□□□ 1.14
CNOT11-201ENST00000289382 AXIN2Q9Y2T1 843 aa22.15■■□□□ 1.14
CNOT11-201ENST00000289382 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.14
CNOT11-201ENST00000289382 LRRC8AQ8IWT6 810 aa22.14■■□□□ 1.14
CNOT11-201ENST00000289382 PTPN14Q15678 1187 aa22.14■■□□□ 1.13
CNOT11-201ENST00000289382 ST7Q9NRC1 585 aa22.14■■□□□ 1.13
CNOT11-201ENST00000289382 CDC25BP30305 580 aa22.13■■□□□ 1.13
CNOT11-201ENST00000289382 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
CNOT11-201ENST00000289382 ARID5BQ14865 1188 aa22.13■■□□□ 1.13
CNOT11-201ENST00000289382 NYAP1Q6ZVC0 841 aa22.13■■□□□ 1.13
CNOT11-201ENST00000289382 NFAT5O94916 1531 aa22.13■■□□□ 1.13
CNOT11-201ENST00000289382 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
CNOT11-201ENST00000289382 ERO1AQ96HE7 468 aa22.13■■□□□ 1.13
CNOT11-201ENST00000289382 RUFY2Q8WXA3 655 aa22.12■■□□□ 1.13
CNOT11-201ENST00000289382 SPATA32Q96LK8 384 aa22.12■■□□□ 1.13
CNOT11-201ENST00000289382 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
CNOT11-201ENST00000289382 NPHP3Q7Z494 1330 aa22.12■■□□□ 1.13
CNOT11-201ENST00000289382 TM6SF1Q9BZW5 370 aa22.12■■□□□ 1.13
CNOT11-201ENST00000289382 RNMTO43148 476 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
CNOT11-201ENST00000289382 AKAP4Q5JQC9 854 aa22.11■■□□□ 1.13
CNOT11-201ENST00000289382 TCEANC2Q96MN5 208 aa22.11■■□□□ 1.13
CNOT11-201ENST00000289382 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
CNOT11-201ENST00000289382 ERBB3P21860 1342 aa22.11■■□□□ 1.13
CNOT11-201ENST00000289382 NR1I2O75469 434 aa22.11■■□□□ 1.13
CNOT11-201ENST00000289382 GCP02774 474 aa22.11■■□□□ 1.13
CNOT11-201ENST00000289382 NECTIN1Q15223 517 aa22.11■■□□□ 1.13
CNOT11-201ENST00000289382 SLFNL1Q499Z3 407 aa22.11■■□□□ 1.13
CNOT11-201ENST00000289382 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
CNOT11-201ENST00000289382 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
CNOT11-201ENST00000289382 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
CNOT11-201ENST00000289382 KLHDC4Q8TBB5 520 aa22.1■■□□□ 1.13
CNOT11-201ENST00000289382 KCNB2Q92953 911 aa22.1■■□□□ 1.13
CNOT11-201ENST00000289382 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa22.1■■□□□ 1.13
CNOT11-201ENST00000289382 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
CNOT11-201ENST00000289382 TTC41PQ6P2S7 1318 aa22.1■■□□□ 1.13
CNOT11-201ENST00000289382 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
CNOT11-201ENST00000289382 SKILP12757 684 aa22.09■■□□□ 1.13
CNOT11-201ENST00000289382 SLC39A6Q13433 755 aa22.09■■□□□ 1.13
CNOT11-201ENST00000289382 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
CNOT11-201ENST00000289382 KAZALD1Q96I82 304 aa22.09■■□□□ 1.13
CNOT11-201ENST00000289382 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
CNOT11-201ENST00000289382 NEMFO60524 1076 aa22.09■■□□□ 1.13
CNOT11-201ENST00000289382 CREB3L3Q68CJ9 461 aa22.09■■□□□ 1.13
CNOT11-201ENST00000289382 ZNF446Q9NWS9 450 aa22.09■■□□□ 1.13
CNOT11-201ENST00000289382 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa22.09■■□□□ 1.13
CNOT11-201ENST00000289382 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
CNOT11-201ENST00000289382 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
CNOT11-201ENST00000289382 BICD2Q8TD16 824 aa22.08■■□□□ 1.13
CNOT11-201ENST00000289382 PDCP20941 246 aa22.08■■□□□ 1.12
CNOT11-201ENST00000289382 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.12
CNOT11-201ENST00000289382 ANKRD24Q8TF21 1146 aa22.08■■□□□ 1.12
CNOT11-201ENST00000289382 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.12
CNOT11-201ENST00000289382 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.12
CNOT11-201ENST00000289382 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa22.07■■□□□ 1.12
CNOT11-201ENST00000289382 SLU7O95391 586 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
CNOT11-201ENST00000289382 FAM227BQ96M60 508 aa22.07■■□□□ 1.12
CNOT11-201ENST00000289382 SIL1Q9H173 461 aa22.07■■□□□ 1.12
CNOT11-201ENST00000289382 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
CNOT11-201ENST00000289382 KDM3BQ7LBC6 1761 aa22.07■■□□□ 1.12
CNOT11-201ENST00000289382 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
CNOT11-201ENST00000289382 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa22.07■■□□□ 1.12
CNOT11-201ENST00000289382 SARM1Q6SZW1 724 aa22.07■■□□□ 1.12
CNOT11-201ENST00000289382 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
CNOT11-201ENST00000289382 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
CNOT11-201ENST00000289382 SUCLG2Q96I99 432 aa22.07■■□□□ 1.12
CNOT11-201ENST00000289382 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
CNOT11-201ENST00000289382 ECHDC1Q9NTX5 307 aa22.07■■□□□ 1.12
CNOT11-201ENST00000289382 C1orf141Q5JVX7 400 aa22.06■■□□□ 1.12
CNOT11-201ENST00000289382 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
CNOT11-201ENST00000289382 ARHGEF25Q86VW2 580 aa22.06■■□□□ 1.12
CNOT11-201ENST00000289382 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa22.06■■□□□ 1.12
CNOT11-201ENST00000289382 FAM193AP78312 1265 aa22.06■■□□□ 1.12
CNOT11-201ENST00000289382 CCDC69A6NI79 296 aa22.05■■□□□ 1.12
CNOT11-201ENST00000289382 NPHP1O15259 732 aa22.05■■□□□ 1.12
CNOT11-201ENST00000289382 CAVIN2O95810 425 aa22.05■■□□□ 1.12
CNOT11-201ENST00000289382 IQCB1Q15051 598 aa22.05■■□□□ 1.12
CNOT11-201ENST00000289382 AACSQ86V21 672 aa22.05■■□□□ 1.12
CNOT11-201ENST00000289382 CREBRFQ8IUR6 639 aa22.05■■□□□ 1.12
CNOT11-201ENST00000289382 PGBD1Q96JS3 809 aa22.05■■□□□ 1.12
CNOT11-201ENST00000289382 TAF6LQ9Y6J9 622 aa22.05■■□□□ 1.12
CNOT11-201ENST00000289382 CCZ1BP86790 482 aa22.05■■□□□ 1.12
CNOT11-201ENST00000289382 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
CNOT11-201ENST00000289382 STK3Q13188 491 aa22.05■■□□□ 1.12
CNOT11-201ENST00000289382 ANKLE2Q86XL3 938 aa22.05■■□□□ 1.12
CNOT11-201ENST00000289382 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
CNOT11-201ENST00000289382 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
CNOT11-201ENST00000289382 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
CNOT11-201ENST00000289382 USP16Q9Y5T5 823 aa22.05■■□□□ 1.12
CNOT11-201ENST00000289382 USP54Q70EL1 1684 aa22.05■■□□□ 1.12
CNOT11-201ENST00000289382 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa22.04■■□□□ 1.12
CNOT11-201ENST00000289382 TULP2O00295 520 aa22.04■■□□□ 1.12
CNOT11-201ENST00000289382 SASH1O94885 1247 aa22.04■■□□□ 1.12
CNOT11-201ENST00000289382 HOXB7P09629 217 aa22.04■■□□□ 1.12
CNOT11-201ENST00000289382 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
CNOT11-201ENST00000289382 SLC20A2Q08357 652 aa22.04■■□□□ 1.12
CNOT11-201ENST00000289382 KSR2Q6VAB6 950 aa22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.2 ms