RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284116.8

GDPD1-201, Transcript of glycerophosphodiester phosphodiesterase domain containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GDPD1, Length 1,821 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDPD1-201ENST00000284116 FAM227BQ96M60 508 aa22.83■■□□□ 1.25
GDPD1-201ENST00000284116 HAUS7Q99871 368 aa22.83■■□□□ 1.25
GDPD1-201ENST00000284116 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
GDPD1-201ENST00000284116 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
GDPD1-201ENST00000284116 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
GDPD1-201ENST00000284116 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
GDPD1-201ENST00000284116 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
GDPD1-201ENST00000284116 CRKLP46109 303 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
GDPD1-201ENST00000284116 ZNF34Q8IZ26 560 aa22.82■■□□□ 1.24
GDPD1-201ENST00000284116 SYNE4Q8N205 404 aa22.82■■□□□ 1.24
GDPD1-201ENST00000284116 NEUROD6Q96NK8 337 aa22.82■■□□□ 1.24
GDPD1-201ENST00000284116 MYH3P11055 1940 aa22.81■■□□□ 1.24
GDPD1-201ENST00000284116 TIMM10P62072 90 aa22.81■■□□□ 1.24
GDPD1-201ENST00000284116 ITPK1Q13572 414 aa22.81■■□□□ 1.24
GDPD1-201ENST00000284116 RASEFQ8IZ41 740 aa22.81■■□□□ 1.24
GDPD1-201ENST00000284116 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
GDPD1-201ENST00000284116 KCNB2Q92953 911 aa22.81■■□□□ 1.24
GDPD1-201ENST00000284116 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
GDPD1-201ENST00000284116 TMX3Q96JJ7 454 aa22.81■■□□□ 1.24
GDPD1-201ENST00000284116 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
GDPD1-201ENST00000284116 CCDC171Q6TFL3 1326 aa22.8■■□□□ 1.24
GDPD1-201ENST00000284116 PALLDQ8WX93 1383 aa22.8■■□□□ 1.24
GDPD1-201ENST00000284116 CEP126Q9P2H0 1117 aa22.8■■□□□ 1.24
GDPD1-201ENST00000284116 ZNF609O15014 1411 aa22.8■■□□□ 1.24
GDPD1-201ENST00000284116 RFX7Q2KHR2 1363 aa22.8■■□□□ 1.24
GDPD1-201ENST00000284116 KCNQ2O43526 872 aa22.8■■□□□ 1.24
GDPD1-201ENST00000284116 GSE1Q14687 1217 aa22.8■■□□□ 1.24
GDPD1-201ENST00000284116 TTLL11Q8NHH1 800 aa22.8■■□□□ 1.24
GDPD1-201ENST00000284116 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
GDPD1-201ENST00000284116 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
GDPD1-201ENST00000284116 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
GDPD1-201ENST00000284116 A0A0D9SFI3 127 aa22.79■■□□□ 1.24
GDPD1-201ENST00000284116 NECTIN1Q15223 517 aa22.79■■□□□ 1.24
GDPD1-201ENST00000284116 MAP4K1Q92918 833 aa22.79■■□□□ 1.24
GDPD1-201ENST00000284116 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
GDPD1-201ENST00000284116 CUL4AQ13619 759 aa22.78■■□□□ 1.24
GDPD1-201ENST00000284116 MED23Q9ULK4 1368 aa22.78■■□□□ 1.24
GDPD1-201ENST00000284116 A0A1B0GUL7 405 aa22.78■■□□□ 1.24
GDPD1-201ENST00000284116 CTSWP56202 376 aa22.78■■□□□ 1.24
GDPD1-201ENST00000284116 TAF7LQ5H9L4 462 aa22.78■■□□□ 1.24
GDPD1-201ENST00000284116 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
GDPD1-201ENST00000284116 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
GDPD1-201ENST00000284116 ZNF831Q5JPB2 1677 aa22.77■■□□□ 1.24
GDPD1-201ENST00000284116 UBN2Q6ZU65 1347 aa22.77■■□□□ 1.24
GDPD1-201ENST00000284116 PDE8AO60658 829 aa22.77■■□□□ 1.24
GDPD1-201ENST00000284116 NUCB2P80303 420 aa22.77■■□□□ 1.24
GDPD1-201ENST00000284116 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
GDPD1-201ENST00000284116 AKAP2Q9Y2D5 859 aa22.77■■□□□ 1.24
GDPD1-201ENST00000284116 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa22.76■■□□□ 1.23
GDPD1-201ENST00000284116 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
GDPD1-201ENST00000284116 TICAM2Q86XR7 235 aa22.76■■□□□ 1.23
GDPD1-201ENST00000284116 GBP4Q96PP9 640 aa22.76■■□□□ 1.23
GDPD1-201ENST00000284116 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
GDPD1-201ENST00000284116 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa22.76■■□□□ 1.23
GDPD1-201ENST00000284116 SSFA2P28290 1259 aa22.75■■□□□ 1.23
GDPD1-201ENST00000284116 TTC14Q96N46 770 aa22.75■■□□□ 1.23
GDPD1-201ENST00000284116 DDX11L8A8MPP1 907 aa22.75■■□□□ 1.23
GDPD1-201ENST00000284116 ITGA6P23229 1130 aa22.75■■□□□ 1.23
GDPD1-201ENST00000284116 KBTBD3Q8NAB2 608 aa22.75■■□□□ 1.23
GDPD1-201ENST00000284116 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP22.75■■□□□ 1.23
GDPD1-201ENST00000284116 TM6SF1Q9BZW5 370 aa22.75■■□□□ 1.23
GDPD1-201ENST00000284116 GREM2Q9H772 168 aa22.75■■□□□ 1.23
GDPD1-201ENST00000284116 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
GDPD1-201ENST00000284116 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa22.74■■□□□ 1.23
GDPD1-201ENST00000284116 CAMTA2O94983 1202 aa22.74■■□□□ 1.23
GDPD1-201ENST00000284116 CLEC17AQ6ZS10 378 aa22.74■■□□□ 1.23
GDPD1-201ENST00000284116 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
GDPD1-201ENST00000284116 AK7Q96M32 723 aa22.74■■□□□ 1.23
GDPD1-201ENST00000284116 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa22.74■■□□□ 1.23
GDPD1-201ENST00000284116 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
GDPD1-201ENST00000284116 CREB3L3Q68CJ9 461 aa22.73■■□□□ 1.23
GDPD1-201ENST00000284116 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
GDPD1-201ENST00000284116 PAG1Q9NWQ8 432 aa22.73■■□□□ 1.23
GDPD1-201ENST00000284116 USP21Q9UK80 565 aa22.73■■□□□ 1.23
GDPD1-201ENST00000284116 SUSD4Q5VX71 490 aa22.73■■□□□ 1.23
GDPD1-201ENST00000284116 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
GDPD1-201ENST00000284116 SPEF2Q9C093 1822 aa22.73■■□□□ 1.23
GDPD1-201ENST00000284116 TAF5LO75529 589 aa22.72■■□□□ 1.23
GDPD1-201ENST00000284116 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
GDPD1-201ENST00000284116 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
GDPD1-201ENST00000284116 KCNJ4P48050 445 aa22.72■■□□□ 1.23
GDPD1-201ENST00000284116 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa22.72■■□□□ 1.23
GDPD1-201ENST00000284116 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa22.72■■□□□ 1.23
GDPD1-201ENST00000284116 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
GDPD1-201ENST00000284116 XAGE2Q96GT9 111 aa22.71■■□□□ 1.23
GDPD1-201ENST00000284116 GOLIM4O00461 696 aa22.71■■□□□ 1.23
GDPD1-201ENST00000284116 SLC27A2O14975 620 aa22.71■■□□□ 1.23
GDPD1-201ENST00000284116 CASTP20810 708 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
GDPD1-201ENST00000284116 ADCK5Q3MIX3 580 aa22.71■■□□□ 1.23
GDPD1-201ENST00000284116 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa22.71■■□□□ 1.23
GDPD1-201ENST00000284116 PARP10Q53GL7 1025 aa22.71■■□□□ 1.23
GDPD1-201ENST00000284116 CCDC158Q5M9N0 1113 aa22.71■■□□□ 1.23
GDPD1-201ENST00000284116 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
GDPD1-201ENST00000284116 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
GDPD1-201ENST00000284116 RIC1Q4ADV7 1423 aa22.7■■□□□ 1.22
GDPD1-201ENST00000284116 SH3TC1Q8TE82 1336 aa22.7■■□□□ 1.22
GDPD1-201ENST00000284116 ADORA1P30542 326 aa22.69■■□□□ 1.22
GDPD1-201ENST00000284116 AK2P54819 239 aa22.69■■□□□ 1.22
GDPD1-201ENST00000284116 METTL24Q5JXM2 366 aa22.69■■□□□ 1.22
GDPD1-201ENST00000284116 RNF20Q5VTR2 975 aa22.69■■□□□ 1.22
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