RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262605.8

TTPAL-201, Transcript of alpha tocopherol transfer protein like, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TTPAL, Length 6,212 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAL-201ENST00000262605 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa12.23□□□□□ -0.45
TTPAL-201ENST00000262605 ZNF213O14771 459 aa12.23□□□□□ -0.45
TTPAL-201ENST00000262605 CCDC191Q8NCU4 936 aa12.23□□□□□ -0.45
TTPAL-201ENST00000262605 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa12.23□□□□□ -0.45
TTPAL-201ENST00000262605 NECAB1Q8N987 351 aa12.23□□□□□ -0.45
TTPAL-201ENST00000262605 C6orf229H3BNL8 230 aa12.23□□□□□ -0.45
TTPAL-201ENST00000262605 CLSTN1O94985 981 aa12.23□□□□□ -0.45
TTPAL-201ENST00000262605 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP12.23□□□□□ -0.45
TTPAL-201ENST00000262605 USP26Q9BXU7 913 aa12.23□□□□□ -0.45
TTPAL-201ENST00000262605 CPA1P15085 419 aa12.23□□□□□ -0.45
TTPAL-201ENST00000262605 TPM4P67936 248 aa12.23□□□□□ -0.45
TTPAL-201ENST00000262605 UBAC1Q9BSL1 405 aa12.22□□□□□ -0.45
TTPAL-201ENST00000262605 WWC3Q9ULE0 1092 aa12.22□□□□□ -0.45
TTPAL-201ENST00000262605 PDCP20941 246 aa12.22□□□□□ -0.45
TTPAL-201ENST00000262605 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP12.22□□□□□ -0.45
TTPAL-201ENST00000262605 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa12.22□□□□□ -0.45
TTPAL-201ENST00000262605 USP5P45974 858 aa12.22□□□□□ -0.45
TTPAL-201ENST00000262605 CCDC82Q8N4S0 544 aa12.22□□□□□ -0.45
TTPAL-201ENST00000262605 TAF5LO75529 589 aa12.22□□□□□ -0.45
TTPAL-201ENST00000262605 TMX3Q96JJ7 454 aa12.22□□□□□ -0.45
TTPAL-201ENST00000262605 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP12.22□□□□□ -0.45
TTPAL-201ENST00000262605 NRKQ7Z2Y5 1582 aa12.22□□□□□ -0.45
TTPAL-201ENST00000262605 A0A1B0GUL7 405 aa12.22□□□□□ -0.45
TTPAL-201ENST00000262605 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP12.22□□□□□ -0.45
TTPAL-201ENST00000262605 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa12.21□□□□□ -0.45
TTPAL-201ENST00000262605 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP12.21□□□□□ -0.45
TTPAL-201ENST00000262605 DTNBO60941 627 aa12.21□□□□□ -0.45
TTPAL-201ENST00000262605 FAM227BQ96M60 508 aa12.21□□□□□ -0.45
TTPAL-201ENST00000262605 NLRP3Q96P20 1036 aa12.21□□□□□ -0.45
TTPAL-201ENST00000262605 ST5P78524 1137 aa12.21□□□□□ -0.45
TTPAL-201ENST00000262605 GDPD2Q9HCC8 539 aa12.21□□□□□ -0.45
TTPAL-201ENST00000262605 BECN2A8MW95 431 aa12.21□□□□□ -0.46
TTPAL-201ENST00000262605 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa12.21□□□□□ -0.46
TTPAL-201ENST00000262605 IKQ13123 557 aaPredicted RBP12.21□□□□□ -0.46
TTPAL-201ENST00000262605 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa12.21□□□□□ -0.46
TTPAL-201ENST00000262605 CHST3Q7LGC8 479 aa12.21□□□□□ -0.46
TTPAL-201ENST00000262605 GJB2P29033 226 aa12.21□□□□□ -0.46
TTPAL-201ENST00000262605 KIAA2012Q0VF49 1180 aa12.21□□□□□ -0.46
TTPAL-201ENST00000262605 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP12.21□□□□□ -0.46
TTPAL-201ENST00000262605 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa12.21□□□□□ -0.46
TTPAL-201ENST00000262605 PIGBQ92521 554 aa12.21□□□□□ -0.46
TTPAL-201ENST00000262605 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa12.21□□□□□ -0.46
TTPAL-201ENST00000262605 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP12.21□□□□□ -0.46
TTPAL-201ENST00000262605 EYA2O00167 538 aa12.2□□□□□ -0.46
TTPAL-201ENST00000262605 NEK1Q96PY6 1258 aa12.2□□□□□ -0.46
TTPAL-201ENST00000262605 NRDCO43847 1150 aa12.2□□□□□ -0.46
TTPAL-201ENST00000262605 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP12.2□□□□□ -0.46
TTPAL-201ENST00000262605 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP12.2□□□□□ -0.46
TTPAL-201ENST00000262605 SASS6Q6UVJ0 657 aa12.2□□□□□ -0.46
TTPAL-201ENST00000262605 CCDC34Q96HJ3 373 aa12.2□□□□□ -0.46
TTPAL-201ENST00000262605 SSH3Q8TE77 659 aa12.19□□□□□ -0.46
TTPAL-201ENST00000262605 TCIRG1Q13488 830 aa12.19□□□□□ -0.46
TTPAL-201ENST00000262605 TRAPPC3LQ5T215 181 aa12.19□□□□□ -0.46
TTPAL-201ENST00000262605 MIGA1Q8NAN2 632 aa12.19□□□□□ -0.46
TTPAL-201ENST00000262605 XAGE2Q96GT9 111 aa12.19□□□□□ -0.46
TTPAL-201ENST00000262605 SLIT1O75093 1534 aa12.19□□□□□ -0.46
TTPAL-201ENST00000262605 CRB1P82279 1406 aa12.19□□□□□ -0.46
TTPAL-201ENST00000262605 STK38Q15208 465 aa12.19□□□□□ -0.46
TTPAL-201ENST00000262605 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa12.19□□□□□ -0.46
TTPAL-201ENST00000262605 PES1O00541 588 aaKnown RBP12.18□□□□□ -0.46
TTPAL-201ENST00000262605 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa12.18□□□□□ -0.46
TTPAL-201ENST00000262605 XBP1P17861 261 aa12.18□□□□□ -0.46
TTPAL-201ENST00000262605 BRMS1Q9HCU9 246 aa12.18□□□□□ -0.46
TTPAL-201ENST00000262605 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP12.18□□□□□ -0.46
TTPAL-201ENST00000262605 PDE8AO60658 829 aa12.18□□□□□ -0.46
TTPAL-201ENST00000262605 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP12.18□□□□□ -0.46
TTPAL-201ENST00000262605 LRRC24Q50LG9 513 aa12.18□□□□□ -0.46
TTPAL-201ENST00000262605 GOLGA8BA8MQT2 603 aa12.18□□□□□ -0.46
TTPAL-201ENST00000262605 CYP7A1P22680 504 aa12.18□□□□□ -0.46
TTPAL-201ENST00000262605 TPTE2Q6XPS3 522 aa12.18□□□□□ -0.46
TTPAL-201ENST00000262605 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP12.18□□□□□ -0.46
TTPAL-201ENST00000262605 MAGEB6Q8N7X4 407 aa12.18□□□□□ -0.46
TTPAL-201ENST00000262605 SPATA32Q96LK8 384 aa12.18□□□□□ -0.46
TTPAL-201ENST00000262605 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP12.18□□□□□ -0.46
TTPAL-201ENST00000262605 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP12.17□□□□□ -0.46
TTPAL-201ENST00000262605 ME1P48163 572 aa12.17□□□□□ -0.46
TTPAL-201ENST00000262605 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP12.17□□□□□ -0.46
TTPAL-201ENST00000262605 CREB3L3Q68CJ9 461 aa12.17□□□□□ -0.46
TTPAL-201ENST00000262605 SH3TC1Q8TE82 1336 aa12.17□□□□□ -0.46
TTPAL-201ENST00000262605 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP12.17□□□□□ -0.46
TTPAL-201ENST00000262605 F8W031 263 aaPredicted RBP12.17□□□□□ -0.46
TTPAL-201ENST00000262605 CRKLP46109 303 aaKnown RBP12.17□□□□□ -0.46
TTPAL-201ENST00000262605 NASPP49321 788 aaPredicted RBP12.17□□□□□ -0.46
TTPAL-201ENST00000262605 TRIM22Q8IYM9 498 aa12.17□□□□□ -0.46
TTPAL-201ENST00000262605 NYXQ9GZU5 481 aa12.17□□□□□ -0.46
TTPAL-201ENST00000262605 KRT85P78386 507 aa12.17□□□□□ -0.46
TTPAL-201ENST00000262605 BRF1Q92994 677 aa12.17□□□□□ -0.46
TTPAL-201ENST00000262605 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP12.17□□□□□ -0.46
TTPAL-201ENST00000262605 USP32Q8NFA0 1604 aa12.17□□□□□ -0.46
TTPAL-201ENST00000262605 HEG1Q9ULI3 1381 aa12.17□□□□□ -0.46
TTPAL-201ENST00000262605 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP12.17□□□□□ -0.46
TTPAL-201ENST00000262605 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP12.17□□□□□ -0.46
TTPAL-201ENST00000262605 SDF4Q9BRK5 362 aa12.17□□□□□ -0.46
TTPAL-201ENST00000262605 BRPF3Q9ULD4 1205 aa12.17□□□□□ -0.46
TTPAL-201ENST00000262605 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa12.17□□□□□ -0.46
TTPAL-201ENST00000262605 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa12.16□□□□□ -0.46
TTPAL-201ENST00000262605 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP12.16□□□□□ -0.46
TTPAL-201ENST00000262605 AK2P54819 239 aa12.16□□□□□ -0.46
TTPAL-201ENST00000262605 SIK1P57059 783 aa12.16□□□□□ -0.46
TTPAL-201ENST00000262605 Q6ZUG5 572 aa12.16□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.2 ms