RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262124.15

SEH1L-201, Transcript of SEH1 like nucleoporin, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SEH1L, Length 3,494 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEH1L-201ENST00000262124 PXDNLA1KZ92 1463 aa14.63□□□□□ -0.07
SEH1L-201ENST00000262124 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
SEH1L-201ENST00000262124 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa14.63□□□□□ -0.07
SEH1L-201ENST00000262124 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
SEH1L-201ENST00000262124 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa14.62□□□□□ -0.07
SEH1L-201ENST00000262124 ATP6V1AP38606 617 aa14.62□□□□□ -0.07
SEH1L-201ENST00000262124 DDB1Q16531 1140 aa14.62□□□□□ -0.07
SEH1L-201ENST00000262124 COPRSQ9NQ92 184 aa14.62□□□□□ -0.07
SEH1L-201ENST00000262124 CPDO75976 1380 aa14.62□□□□□ -0.07
SEH1L-201ENST00000262124 GREM2Q9H772 168 aa14.61□□□□□ -0.07
SEH1L-201ENST00000262124 CACNA1FO60840 1977 aa14.61□□□□□ -0.07
SEH1L-201ENST00000262124 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
SEH1L-201ENST00000262124 METTL24Q5JXM2 366 aa14.61□□□□□ -0.07
SEH1L-201ENST00000262124 KDM3BQ7LBC6 1761 aa14.61□□□□□ -0.07
SEH1L-201ENST00000262124 LMO7Q8WWI1 1683 aa14.61□□□□□ -0.07
SEH1L-201ENST00000262124 SYCE3A1L190 88 aa14.61□□□□□ -0.07
SEH1L-201ENST00000262124 H7C1W4 665 aa14.61□□□□□ -0.07
SEH1L-201ENST00000262124 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
SEH1L-201ENST00000262124 TAF5LO75529 589 aa14.61□□□□□ -0.07
SEH1L-201ENST00000262124 TCIRG1Q13488 830 aa14.61□□□□□ -0.07
SEH1L-201ENST00000262124 TTLL5Q6EMB2 1281 aa14.61□□□□□ -0.07
SEH1L-201ENST00000262124 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
SEH1L-201ENST00000262124 GRPEL1Q9HAV7 217 aa14.61□□□□□ -0.07
SEH1L-201ENST00000262124 ALS2Q96Q42 1657 aa14.6□□□□□ -0.07
SEH1L-201ENST00000262124 SLC27A2O14975 620 aa14.6□□□□□ -0.07
SEH1L-201ENST00000262124 ATG9AQ7Z3C6 839 aa14.6□□□□□ -0.07
SEH1L-201ENST00000262124 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa14.6□□□□□ -0.07
SEH1L-201ENST00000262124 DCCP43146 1447 aa14.6□□□□□ -0.07
SEH1L-201ENST00000262124 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa14.6□□□□□ -0.07
SEH1L-201ENST00000262124 GJB2P29033 226 aa14.6□□□□□ -0.07
SEH1L-201ENST00000262124 PLCB2Q00722 1185 aa14.6□□□□□ -0.07
SEH1L-201ENST00000262124 TTC39AQ5SRH9 613 aa14.6□□□□□ -0.07
SEH1L-201ENST00000262124 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa14.6□□□□□ -0.07
SEH1L-201ENST00000262124 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
SEH1L-201ENST00000262124 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
SEH1L-201ENST00000262124 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
SEH1L-201ENST00000262124 AOX1Q06278 1338 aa14.6□□□□□ -0.07
SEH1L-201ENST00000262124 SCARF1Q14162 830 aa14.6□□□□□ -0.07
SEH1L-201ENST00000262124 ME3Q16798 604 aa14.6□□□□□ -0.07
SEH1L-201ENST00000262124 PTF1AQ7RTS3 328 aa14.6□□□□□ -0.07
SEH1L-201ENST00000262124 NGLY1Q96IV0 654 aa14.6□□□□□ -0.07
SEH1L-201ENST00000262124 CNPY2Q9Y2B0 182 aa14.6□□□□□ -0.07
SEH1L-201ENST00000262124 UTRNP46939 3433 aa14.59□□□□□ -0.07
SEH1L-201ENST00000262124 KIF1AQ12756 1690 aa14.59□□□□□ -0.07
SEH1L-201ENST00000262124 EYA2O00167 538 aa14.59□□□□□ -0.07
SEH1L-201ENST00000262124 CCDC191Q8NCU4 936 aa14.59□□□□□ -0.07
SEH1L-201ENST00000262124 UTYO14607 1347 aa14.59□□□□□ -0.07
SEH1L-201ENST00000262124 ITGA6P23229 1130 aa14.59□□□□□ -0.07
SEH1L-201ENST00000262124 CASP7P55210 303 aa14.59□□□□□ -0.07
SEH1L-201ENST00000262124 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
SEH1L-201ENST00000262124 LMBRD1Q9NUN5 540 aa14.59□□□□□ -0.07
SEH1L-201ENST00000262124 PAG1Q9NWQ8 432 aa14.59□□□□□ -0.07
SEH1L-201ENST00000262124 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.07
SEH1L-201ENST00000262124 IDH1O75874 414 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.07
SEH1L-201ENST00000262124 APPP05067 770 aa14.58□□□□□ -0.07
SEH1L-201ENST00000262124 ANAPC15P60006 121 aa14.58□□□□□ -0.07
SEH1L-201ENST00000262124 CCT2P78371 535 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.07
SEH1L-201ENST00000262124 GPT2Q8TD30 523 aa14.58□□□□□ -0.07
SEH1L-201ENST00000262124 TPCN1Q9ULQ1 816 aa14.58□□□□□ -0.07
SEH1L-201ENST00000262124 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa14.58□□□□□ -0.08
SEH1L-201ENST00000262124 SYT1P21579 422 aa14.58□□□□□ -0.08
SEH1L-201ENST00000262124 C5P01031 1676 aa14.58□□□□□ -0.08
SEH1L-201ENST00000262124 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
SEH1L-201ENST00000262124 GUCY1B3Q02153 619 aa14.57□□□□□ -0.08
SEH1L-201ENST00000262124 XAGE2Q96GT9 111 aa14.57□□□□□ -0.08
SEH1L-201ENST00000262124 NPHP1O15259 732 aa14.57□□□□□ -0.08
SEH1L-201ENST00000262124 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
SEH1L-201ENST00000262124 MCM2P49736 904 aa14.57□□□□□ -0.08
SEH1L-201ENST00000262124 NECTIN1Q15223 517 aa14.57□□□□□ -0.08
SEH1L-201ENST00000262124 SEC31BQ9NQW1 1179 aa14.57□□□□□ -0.08
SEH1L-201ENST00000262124 ATP5JP18859 108 aa14.56□□□□□ -0.08
SEH1L-201ENST00000262124 ZAP70P43403 619 aa14.56□□□□□ -0.08
SEH1L-201ENST00000262124 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
SEH1L-201ENST00000262124 BRF1Q92994 677 aa14.56□□□□□ -0.08
SEH1L-201ENST00000262124 UBAP1LF5GYI3 381 aa14.56□□□□□ -0.08
SEH1L-201ENST00000262124 IL15P40933 162 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
SEH1L-201ENST00000262124 RNF20Q5VTR2 975 aa14.56□□□□□ -0.08
SEH1L-201ENST00000262124 MAP4K1Q92918 833 aa14.56□□□□□ -0.08
SEH1L-201ENST00000262124 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
SEH1L-201ENST00000262124 JAK2O60674 1132 aa14.56□□□□□ -0.08
SEH1L-201ENST00000262124 CCDC158Q5M9N0 1113 aa14.56□□□□□ -0.08
SEH1L-201ENST00000262124 CHMP4CQ96CF2 233 aa14.56□□□□□ -0.08
SEH1L-201ENST00000262124 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
SEH1L-201ENST00000262124 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
SEH1L-201ENST00000262124 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
SEH1L-201ENST00000262124 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
SEH1L-201ENST00000262124 USP48Q86UV5 1035 aa14.55□□□□□ -0.08
SEH1L-201ENST00000262124 TMEM63CQ9P1W3 806 aa14.55□□□□□ -0.08
SEH1L-201ENST00000262124 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
SEH1L-201ENST00000262124 STX6O43752 255 aa14.55□□□□□ -0.08
SEH1L-201ENST00000262124 CYP21A2P08686 494 aa14.55□□□□□ -0.08
SEH1L-201ENST00000262124 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa14.55□□□□□ -0.08
SEH1L-201ENST00000262124 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
SEH1L-201ENST00000262124 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
SEH1L-201ENST00000262124 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa14.54□□□□□ -0.08
SEH1L-201ENST00000262124 NLRP10Q86W26 655 aa14.54□□□□□ -0.08
SEH1L-201ENST00000262124 TTC14Q96N46 770 aa14.54□□□□□ -0.08
SEH1L-201ENST00000262124 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
SEH1L-201ENST00000262124 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
SEH1L-201ENST00000262124 Q6ZUG5 572 aa14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.4 ms