RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000260116.4

TTPA-201, Transcript of alpha tocopherol transfer protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TTPA, Length 2,338 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPA-201ENST00000260116 GNAI3P08754 354 aa13.59□□□□□ -0.23
TTPA-201ENST00000260116 CEP85Q6P2H3 762 aa13.59□□□□□ -0.23
TTPA-201ENST00000260116 SGIP1Q9BQI5 828 aa13.59□□□□□ -0.23
TTPA-201ENST00000260116 UTYO14607 1347 aa13.59□□□□□ -0.23
TTPA-201ENST00000260116 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP13.59□□□□□ -0.23
TTPA-201ENST00000260116 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP13.59□□□□□ -0.23
TTPA-201ENST00000260116 OLFM4Q6UX06 510 aa13.59□□□□□ -0.23
TTPA-201ENST00000260116 TTLL11Q8NHH1 800 aa13.59□□□□□ -0.23
TTPA-201ENST00000260116 A0A0G2JLW4 131 aa13.58□□□□□ -0.23
TTPA-201ENST00000260116 CTSWP56202 376 aa13.58□□□□□ -0.23
TTPA-201ENST00000260116 SLC16A10Q8TF71 515 aa13.58□□□□□ -0.23
TTPA-201ENST00000260116 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP13.58□□□□□ -0.23
TTPA-201ENST00000260116 ST5P78524 1137 aa13.58□□□□□ -0.24
TTPA-201ENST00000260116 NYXQ9GZU5 481 aa13.58□□□□□ -0.24
TTPA-201ENST00000260116 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP13.58□□□□□ -0.24
TTPA-201ENST00000260116 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP13.57□□□□□ -0.24
TTPA-201ENST00000260116 PDE8AO60658 829 aa13.57□□□□□ -0.24
TTPA-201ENST00000260116 ITGA6P23229 1130 aa13.57□□□□□ -0.24
TTPA-201ENST00000260116 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa13.57□□□□□ -0.24
TTPA-201ENST00000260116 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa13.57□□□□□ -0.24
TTPA-201ENST00000260116 POLD1P28340 1107 aa13.57□□□□□ -0.24
TTPA-201ENST00000260116 NLGN2Q8NFZ4 835 aa13.57□□□□□ -0.24
TTPA-201ENST00000260116 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP13.57□□□□□ -0.24
TTPA-201ENST00000260116 NLRP3Q96P20 1036 aa13.57□□□□□ -0.24
TTPA-201ENST00000260116 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP13.57□□□□□ -0.24
TTPA-201ENST00000260116 SPON1Q9HCB6 807 aa13.57□□□□□ -0.24
TTPA-201ENST00000260116 SNAP23O00161 211 aa13.56□□□□□ -0.24
TTPA-201ENST00000260116 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP13.56□□□□□ -0.24
TTPA-201ENST00000260116 CDHR2Q9BYE9 1310 aa13.55□□□□□ -0.24
TTPA-201ENST00000260116 LAMB2P55268 1798 aa13.55□□□□□ -0.24
TTPA-201ENST00000260116 LRRC24Q50LG9 513 aa13.55□□□□□ -0.24
TTPA-201ENST00000260116 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP13.55□□□□□ -0.24
TTPA-201ENST00000260116 MYH3P11055 1940 aa13.54□□□□□ -0.24
TTPA-201ENST00000260116 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP13.54□□□□□ -0.24
TTPA-201ENST00000260116 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP13.54□□□□□ -0.24
TTPA-201ENST00000260116 CCDC136Q96JN2 1154 aa13.54□□□□□ -0.24
TTPA-201ENST00000260116 CSF1RP07333 972 aa13.53□□□□□ -0.24
TTPA-201ENST00000260116 CCDC57Q2TAC2 916 aa13.53□□□□□ -0.24
TTPA-201ENST00000260116 BRIP1Q9BX63 1249 aa13.53□□□□□ -0.24
TTPA-201ENST00000260116 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP13.53□□□□□ -0.24
TTPA-201ENST00000260116 NRXN2Q9P2S2 1712 aa13.53□□□□□ -0.24
TTPA-201ENST00000260116 CACNA1SQ13698 1873 aa13.53□□□□□ -0.24
TTPA-201ENST00000260116 RGL2O15211 777 aa13.53□□□□□ -0.24
TTPA-201ENST00000260116 SRGNP10124 158 aa13.53□□□□□ -0.24
TTPA-201ENST00000260116 DPEP1P16444 411 aa13.53□□□□□ -0.24
TTPA-201ENST00000260116 ATP8B2P98198 1209 aa13.53□□□□□ -0.24
TTPA-201ENST00000260116 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP13.53□□□□□ -0.24
TTPA-201ENST00000260116 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP13.53□□□□□ -0.24
TTPA-201ENST00000260116 SLC10A5Q5PT55 438 aa13.53□□□□□ -0.24
TTPA-201ENST00000260116 C2CD5Q86YS7 1000 aa13.53□□□□□ -0.24
TTPA-201ENST00000260116 SPEF2Q9C093 1822 aa13.52□□□□□ -0.24
TTPA-201ENST00000260116 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP13.52□□□□□ -0.24
TTPA-201ENST00000260116 SURF6O75683 361 aaKnown RBP13.52□□□□□ -0.24
TTPA-201ENST00000260116 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP13.52□□□□□ -0.24
TTPA-201ENST00000260116 CCDC152Q4G0S7 254 aa13.52□□□□□ -0.24
TTPA-201ENST00000260116 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP13.52□□□□□ -0.24
TTPA-201ENST00000260116 TAF7LQ5H9L4 462 aa13.52□□□□□ -0.25
TTPA-201ENST00000260116 PLA2G12BQ9BX93 195 aa13.52□□□□□ -0.25
TTPA-201ENST00000260116 TAF5LO75529 589 aa13.51□□□□□ -0.25
TTPA-201ENST00000260116 CRY2Q49AN0 593 aa13.51□□□□□ -0.25
TTPA-201ENST00000260116 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa13.51□□□□□ -0.25
TTPA-201ENST00000260116 C10orf71Q711Q0 1435 aa13.51□□□□□ -0.25
TTPA-201ENST00000260116 KCNA3P22001 575 aa13.51□□□□□ -0.25
TTPA-201ENST00000260116 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa13.51□□□□□ -0.25
TTPA-201ENST00000260116 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa13.5□□□□□ -0.25
TTPA-201ENST00000260116 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP13.5□□□□□ -0.25
TTPA-201ENST00000260116 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP13.5□□□□□ -0.25
TTPA-201ENST00000260116 SSH3Q8TE77 659 aa13.5□□□□□ -0.25
TTPA-201ENST00000260116 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP13.5□□□□□ -0.25
TTPA-201ENST00000260116 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP13.5□□□□□ -0.25
TTPA-201ENST00000260116 H0YIN7 160 aa13.5□□□□□ -0.25
TTPA-201ENST00000260116 PDE6BP35913 854 aa13.5□□□□□ -0.25
TTPA-201ENST00000260116 MTX1Q13505 466 aa13.5□□□□□ -0.25
TTPA-201ENST00000260116 POLA2Q14181 598 aa13.5□□□□□ -0.25
TTPA-201ENST00000260116 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP13.5□□□□□ -0.25
TTPA-201ENST00000260116 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP13.49□□□□□ -0.25
TTPA-201ENST00000260116 MPHOSPH8Q99549 860 aa13.49□□□□□ -0.25
TTPA-201ENST00000260116 CNNM1Q9NRU3 951 aa13.48□□□□□ -0.25
TTPA-201ENST00000260116 TAOK2Q9UL54 1235 aa13.48□□□□□ -0.25
TTPA-201ENST00000260116 RPS8P62241 208 aaKnown RBP13.48□□□□□ -0.25
TTPA-201ENST00000260116 TSHZ3Q63HK5 1081 aa13.48□□□□□ -0.25
TTPA-201ENST00000260116 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP13.48□□□□□ -0.25
TTPA-201ENST00000260116 ATG9AQ7Z3C6 839 aa13.48□□□□□ -0.25
TTPA-201ENST00000260116 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP13.48□□□□□ -0.25
TTPA-201ENST00000260116 SYT17Q9BSW7 474 aa13.48□□□□□ -0.25
TTPA-201ENST00000260116 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP13.48□□□□□ -0.25
TTPA-201ENST00000260116 PODXL2Q9NZ53 605 aa13.48□□□□□ -0.25
TTPA-201ENST00000260116 SLX4Q8IY92 1834 aa13.48□□□□□ -0.25
TTPA-201ENST00000260116 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP13.47□□□□□ -0.25
TTPA-201ENST00000260116 C21orf2O43822 256 aa13.47□□□□□ -0.25
TTPA-201ENST00000260116 SASH1O94885 1247 aa13.47□□□□□ -0.25
TTPA-201ENST00000260116 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa13.47□□□□□ -0.25
TTPA-201ENST00000260116 PPP4R2Q9NY27 417 aa13.47□□□□□ -0.25
TTPA-201ENST00000260116 TFCP2Q12800 502 aa13.47□□□□□ -0.25
TTPA-201ENST00000260116 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP13.47□□□□□ -0.25
TTPA-201ENST00000260116 MASTLQ96GX5 879 aa13.47□□□□□ -0.25
TTPA-201ENST00000260116 LNPKQ9C0E8 428 aa13.47□□□□□ -0.25
TTPA-201ENST00000260116 BCS1LQ9Y276 419 aa13.47□□□□□ -0.25
TTPA-201ENST00000260116 KLRK1P26718 216 aa13.46□□□□□ -0.25
TTPA-201ENST00000260116 GRAPQ13588 217 aa13.46□□□□□ -0.25
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