RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000255198.2

ZBED3-201, Transcript of zinc finger BED-type containing 3, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene ZBED3, Length 6,172 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3-201ENST00000255198 PODXL2Q9NZ53 605 aa23.4■■□□□ 1.34
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ZBED3-201ENST00000255198 CCDC155Q8N6L0 562 aa23.39■■□□□ 1.34
ZBED3-201ENST00000255198 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.34
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ZBED3-201ENST00000255198 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.33
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ZBED3-201ENST00000255198 NECAB1Q8N987 351 aa23.39■■□□□ 1.33
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ZBED3-201ENST00000255198 CALM3P0DP25 149 aa23.38■■□□□ 1.33
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ZBED3-201ENST00000255198 ARID5AQ03989 594 aa23.38■■□□□ 1.33
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ZBED3-201ENST00000255198 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa23.38■■□□□ 1.33
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ZBED3-201ENST00000255198 CYP7A1P22680 504 aa23.37■■□□□ 1.33
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ZBED3-201ENST00000255198 ACSBG1Q96GR2 724 aa23.37■■□□□ 1.33
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ZBED3-201ENST00000255198 GIMAP6Q6P9H5 292 aa23.36■■□□□ 1.33
ZBED3-201ENST00000255198 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa23.36■■□□□ 1.33
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ZBED3-201ENST00000255198 PSMC4P43686 418 aa23.35■■□□□ 1.33
ZBED3-201ENST00000255198 RMND1Q9NWS8 449 aa23.35■■□□□ 1.33
ZBED3-201ENST00000255198 UBASH3AP57075 661 aa23.35■■□□□ 1.33
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ZBED3-201ENST00000255198 CHRNA2Q15822 529 aa23.34■■□□□ 1.33
ZBED3-201ENST00000255198 TCHPQ9BT92 498 aa23.34■■□□□ 1.33
ZBED3-201ENST00000255198 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP23.34■■□□□ 1.33
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ZBED3-201ENST00000255198 BRF1Q92994 677 aa23.33■■□□□ 1.32
ZBED3-201ENST00000255198 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.32
ZBED3-201ENST00000255198 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP23.32■■□□□ 1.32
ZBED3-201ENST00000255198 PTPRCP08575 1304 aa23.32■■□□□ 1.32
ZBED3-201ENST00000255198 TCEANC2Q96MN5 208 aa23.32■■□□□ 1.32
ZBED3-201ENST00000255198 KIF4AO95239 1232 aa23.32■■□□□ 1.32
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ZBED3-201ENST00000255198 IFNL2Q8IZJ0 200 aa23.32■■□□□ 1.32
ZBED3-201ENST00000255198 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP23.32■■□□□ 1.32
ZBED3-201ENST00000255198 CCDC160A6NGH7 325 aa23.32■■□□□ 1.32
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ZBED3-201ENST00000255198 VEZTQ9HBM0 779 aa23.32■■□□□ 1.32
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ZBED3-201ENST00000255198 ZBTB43O43298 467 aa23.31■■□□□ 1.32
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ZBED3-201ENST00000255198 RTN1Q16799 776 aa23.3■■□□□ 1.32
ZBED3-201ENST00000255198 TIGD1Q96MW7 591 aa23.3■■□□□ 1.32
ZBED3-201ENST00000255198 SELENOOQ9BVL4 669 aa23.3■■□□□ 1.32
ZBED3-201ENST00000255198 PLCB3Q01970 1234 aa23.3■■□□□ 1.32
ZBED3-201ENST00000255198 LRSAM1Q6UWE0 723 aa23.3■■□□□ 1.32
ZBED3-201ENST00000255198 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP23.3■■□□□ 1.32
ZBED3-201ENST00000255198 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa23.29■■□□□ 1.32
ZBED3-201ENST00000255198 KRT23Q9C075 422 aa23.29■■□□□ 1.32
ZBED3-201ENST00000255198 USP37Q86T82 979 aa23.29■■□□□ 1.32
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