RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000246533.7

CAPNS1-201, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-201ENST00000246533 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP32.39■■■□□ 2.78
CAPNS1-201ENST00000246533 NYXQ9GZU5 481 aa32.39■■■□□ 2.78
CAPNS1-201ENST00000246533 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP32.39■■■□□ 2.78
CAPNS1-201ENST00000246533 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP32.39■■■□□ 2.78
CAPNS1-201ENST00000246533 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP32.38■■■□□ 2.77
CAPNS1-201ENST00000246533 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP32.38■■■□□ 2.77
CAPNS1-201ENST00000246533 ITPRIPQ8IWB1 547 aa32.38■■■□□ 2.77
CAPNS1-201ENST00000246533 HSCBQ8IWL3 235 aa32.38■■■□□ 2.77
CAPNS1-201ENST00000246533 C2CD5Q86YS7 1000 aa32.38■■■□□ 2.77
CAPNS1-201ENST00000246533 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa32.38■■■□□ 2.77
CAPNS1-201ENST00000246533 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP32.37■■■□□ 2.77
CAPNS1-201ENST00000246533 DDX11L8A8MPP1 907 aa32.37■■■□□ 2.77
CAPNS1-201ENST00000246533 NEURL1BA8MQ27 555 aa32.37■■■□□ 2.77
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC4A10Q6U841 1118 aa32.37■■■□□ 2.77
CAPNS1-201ENST00000246533 SNX21Q969T3 373 aa32.37■■■□□ 2.77
CAPNS1-201ENST00000246533 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP32.36■■■□□ 2.774e-7■■■□□ 18.5
CAPNS1-201ENST00000246533 RBM25P49756 843 aaKnown RBP32.36■■■□□ 2.77
CAPNS1-201ENST00000246533 BEND3Q5T5X7 828 aa32.35■■■□□ 2.77
CAPNS1-201ENST00000246533 CCDC191Q8NCU4 936 aa32.35■■■□□ 2.77
CAPNS1-201ENST00000246533 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP32.35■■■□□ 2.77
CAPNS1-201ENST00000246533 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP32.34■■■□□ 2.77
CAPNS1-201ENST00000246533 NEXNQ0ZGT2 675 aa32.34■■■□□ 2.77
CAPNS1-201ENST00000246533 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP32.34■■■□□ 2.77
CAPNS1-201ENST00000246533 PDE6BP35913 854 aa32.34■■■□□ 2.77
CAPNS1-201ENST00000246533 NUCB1Q02818 461 aa32.34■■■□□ 2.77
CAPNS1-201ENST00000246533 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP32.33■■■□□ 2.77
CAPNS1-201ENST00000246533 SH3TC1Q8TE82 1336 aa32.33■■■□□ 2.77
CAPNS1-201ENST00000246533 H0YIN7 160 aa32.32■■■□□ 2.76
CAPNS1-201ENST00000246533 SRGNP10124 158 aa32.32■■■□□ 2.76
CAPNS1-201ENST00000246533 PTMSP20962 102 aa32.32■■■□□ 2.76
CAPNS1-201ENST00000246533 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP32.32■■■□□ 2.76
CAPNS1-201ENST00000246533 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP32.32■■■□□ 2.76
CAPNS1-201ENST00000246533 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP32.31■■■□□ 2.76
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC10A5Q5PT55 438 aa32.31■■■□□ 2.76
CAPNS1-201ENST00000246533 LINS1Q8NG48 757 aa32.31■■■□□ 2.76
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP32.31■■■□□ 2.76
CAPNS1-201ENST00000246533 PTPRCP08575 1304 aa32.31■■■□□ 2.76
CAPNS1-201ENST00000246533 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP32.3■■■□□ 2.76
CAPNS1-201ENST00000246533 GCKRQ14397 625 aa32.3■■■□□ 2.76
CAPNS1-201ENST00000246533 GPR162Q16538 588 aa32.3■■■□□ 2.76
CAPNS1-201ENST00000246533 PIM2Q9P1W9 311 aa32.3■■■□□ 2.76
CAPNS1-201ENST00000246533 BCS1LQ9Y276 419 aa32.3■■■□□ 2.76
CAPNS1-201ENST00000246533 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP32.29■■■□□ 2.76
CAPNS1-201ENST00000246533 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP32.29■■■□□ 2.76
CAPNS1-201ENST00000246533 TMEM57Q8N5G2 664 aa32.28■■■□□ 2.76
CAPNS1-201ENST00000246533 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP32.28■■■□□ 2.76
CAPNS1-201ENST00000246533 TRAK2O60296 914 aa32.27■■■□□ 2.76
CAPNS1-201ENST00000246533 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP32.27■■■□□ 2.76
CAPNS1-201ENST00000246533 MRE11P49959 708 aa32.27■■■□□ 2.76
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC51AQ86UW1 340 aa32.27■■■□□ 2.76
CAPNS1-201ENST00000246533 DLEC1Q9Y238 1755 aa32.27■■■□□ 2.76
CAPNS1-201ENST00000246533 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP32.26■■■□□ 2.76
CAPNS1-201ENST00000246533 CRY2Q49AN0 593 aa32.26■■■□□ 2.76
CAPNS1-201ENST00000246533 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa32.26■■■□□ 2.76
CAPNS1-201ENST00000246533 LAMB2P55268 1798 aa32.26■■■□□ 2.75
CAPNS1-201ENST00000246533 DDIT3P35638 169 aa32.26■■■□□ 2.75
CAPNS1-201ENST00000246533 ARHGAP45Q92619 1136 aa32.26■■■□□ 2.75
CAPNS1-201ENST00000246533 CACNA1SQ13698 1873 aa32.25■■■□□ 2.75
CAPNS1-201ENST00000246533 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP32.25■■■□□ 2.75
CAPNS1-201ENST00000246533 BMP2KLQ5H9B9 411 aa32.25■■■□□ 2.75
CAPNS1-201ENST00000246533 GCC1Q96CN9 775 aa32.25■■■□□ 2.75
CAPNS1-201ENST00000246533 NLRP3Q96P20 1036 aa32.25■■■□□ 2.75
CAPNS1-201ENST00000246533 TAF1P21675 1872 aa32.24■■■□□ 2.75
CAPNS1-201ENST00000246533 H7C1W4 665 aa32.24■■■□□ 2.75
CAPNS1-201ENST00000246533 MASTLQ96GX5 879 aa32.24■■■□□ 2.75
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP32.24■■■□□ 2.75
CAPNS1-201ENST00000246533 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP32.23■■■□□ 2.75
CAPNS1-201ENST00000246533 CHD1LQ86WJ1 897 aa32.23■■■□□ 2.75
CAPNS1-201ENST00000246533 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa32.23■■■□□ 2.75
CAPNS1-201ENST00000246533 SLX4Q8IY92 1834 aa32.23■■■□□ 2.75
CAPNS1-201ENST00000246533 CASP7P55210 303 aa32.22■■■□□ 2.75
CAPNS1-201ENST00000246533 TTLL6Q8N841 843 aa32.22■■■□□ 2.75
CAPNS1-201ENST00000246533 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP32.22■■■□□ 2.75
CAPNS1-201ENST00000246533 RIC1Q4ADV7 1423 aa32.21■■■□□ 2.75
CAPNS1-201ENST00000246533 NPR1P16066 1061 aa32.21■■■□□ 2.75
CAPNS1-201ENST00000246533 OLFM4Q6UX06 510 aa32.2■■■□□ 2.75
CAPNS1-201ENST00000246533 STYK1Q6J9G0 422 aa32.2■■■□□ 2.74
CAPNS1-201ENST00000246533 COL4A1P02462 1669 aa32.19■■■□□ 2.74
CAPNS1-201ENST00000246533 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP32.19■■■□□ 2.74
CAPNS1-201ENST00000246533 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP32.18■■■□□ 2.74
CAPNS1-201ENST00000246533 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP32.18■■■□□ 2.74
CAPNS1-201ENST00000246533 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP32.18■■■□□ 2.74
CAPNS1-201ENST00000246533 GBP4Q96PP9 640 aa32.18■■■□□ 2.74
CAPNS1-201ENST00000246533 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP32.18■■■□□ 2.74
CAPNS1-201ENST00000246533 ALDH1L1O75891 902 aa32.17■■■□□ 2.74
CAPNS1-201ENST00000246533 CDHR2Q9BYE9 1310 aa32.17■■■□□ 2.74
CAPNS1-201ENST00000246533 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP32.16■■■□□ 2.74
CAPNS1-201ENST00000246533 GRM8O00222 908 aa32.16■■■□□ 2.74
CAPNS1-201ENST00000246533 C21orf2O43822 256 aa32.16■■■□□ 2.74
CAPNS1-201ENST00000246533 PDE8AO60658 829 aa32.15■■■□□ 2.74
CAPNS1-201ENST00000246533 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa32.15■■■□□ 2.74
CAPNS1-201ENST00000246533 CNKSR1Q969H4 720 aa32.15■■■□□ 2.74
CAPNS1-201ENST00000246533 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP32.15■■■□□ 2.74
CAPNS1-201ENST00000246533 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP32.15■■■□□ 2.74
CAPNS1-201ENST00000246533 EPHA10Q5JZY3 1008 aa32.14■■■□□ 2.74
CAPNS1-201ENST00000246533 USP44Q9H0E7 712 aa32.14■■■□□ 2.74
CAPNS1-201ENST00000246533 SEC31BQ9NQW1 1179 aa32.14■■■□□ 2.74
CAPNS1-201ENST00000246533 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP32.14■■■□□ 2.74
CAPNS1-201ENST00000246533 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa32.14■■■□□ 2.74
CAPNS1-201ENST00000246533 ABCC4O15439 1325 aa32.13■■■□□ 2.73
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.5 ms