RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000216840.10

RABGGTA-201, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGGTA, Length 2,088 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-201ENST00000216840 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP20.88■□□□□ 0.93
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RABGGTA-201ENST00000216840 FSD1Q9BTV5 496 aa20.86■□□□□ 0.93
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RABGGTA-201ENST00000216840 TIMM10P62072 90 aa20.84■□□□□ 0.93
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RABGGTA-201ENST00000216840 SUSD4Q5VX71 490 aa20.8■□□□□ 0.92
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RABGGTA-201ENST00000216840 IL27Q8NEV9 243 aa20.79■□□□□ 0.92
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RABGGTA-201ENST00000216840 TMX3Q96JJ7 454 aa20.77■□□□□ 0.92
RABGGTA-201ENST00000216840 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP20.77■□□□□ 0.92
RABGGTA-201ENST00000216840 NECTIN1Q15223 517 aa20.77■□□□□ 0.92
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RABGGTA-201ENST00000216840 SPEF2Q9C093 1822 aa20.77■□□□□ 0.92
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RABGGTA-201ENST00000216840 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP20.74■□□□□ 0.91
RABGGTA-201ENST00000216840 SBF2Q86WG5 1849 aa20.74■□□□□ 0.91
RABGGTA-201ENST00000216840 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP20.74■□□□□ 0.91
RABGGTA-201ENST00000216840 TTC14Q96N46 770 aa20.74■□□□□ 0.91
RABGGTA-201ENST00000216840 CNNM1Q9NRU3 951 aa20.74■□□□□ 0.91
RABGGTA-201ENST00000216840 NTSR2O95665 410 aa20.73■□□□□ 0.91
RABGGTA-201ENST00000216840 CHGBP05060 677 aa20.73■□□□□ 0.91
RABGGTA-201ENST00000216840 CUL4AQ13619 759 aa20.73■□□□□ 0.91
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