RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628306.2

CAPNS1-216, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,389 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-216ENST00000628306 LIN52Q52LA3 116 aa21.71■■□□□ 1.07
CAPNS1-216ENST00000628306 OTUD3Q5T2D3 398 aaPredicted RBP21.71■■□□□ 1.07
CAPNS1-216ENST00000628306 RNF220Q5VTB9 566 aa21.71■■□□□ 1.07
CAPNS1-216ENST00000628306 TIGD3Q6B0B8 471 aa21.71■■□□□ 1.07
CAPNS1-216ENST00000628306 FAM83FQ8NEG4 500 aaPredicted RBP21.71■■□□□ 1.07
CAPNS1-216ENST00000628306 ZPLD1Q8TCW7 415 aa21.71■■□□□ 1.07
CAPNS1-216ENST00000628306 PIK3R3Q92569 461 aa21.71■■□□□ 1.07
CAPNS1-216ENST00000628306 ABTB1Q969K4 478 aaPredicted RBP21.71■■□□□ 1.07
CAPNS1-216ENST00000628306 DACH2Q96NX9 599 aa21.71■■□□□ 1.07
CAPNS1-216ENST00000628306 GALNT8Q9NY28 637 aa21.71■■□□□ 1.07
CAPNS1-216ENST00000628306 MKLN1Q9UL63 735 aa21.71■■□□□ 1.07
CAPNS1-216ENST00000628306 DTX4Q9Y2E6 619 aa21.71■■□□□ 1.07
CAPNS1-216ENST00000628306 MED12LQ86YW9 2145 aa21.7■■□□□ 1.06
CAPNS1-216ENST00000628306 TO15178 435 aa21.7■■□□□ 1.06
CAPNS1-216ENST00000628306 NID1P14543 1247 aa21.7■■□□□ 1.06
CAPNS1-216ENST00000628306 TNFRSF1BP20333 461 aa21.7■■□□□ 1.06
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC36A3Q495N2 470 aa21.7■■□□□ 1.06
CAPNS1-216ENST00000628306 FAHD1Q6P587 224 aa21.7■■□□□ 1.06
CAPNS1-216ENST00000628306 PLXDC2Q6UX71 529 aa21.7■■□□□ 1.06
CAPNS1-216ENST00000628306 YRDCQ86U90 279 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.06
CAPNS1-216ENST00000628306 PRR22Q8IZ63 422 aa21.7■■□□□ 1.06
CAPNS1-216ENST00000628306 CIARTQ8N365 385 aaPredicted RBP21.7■■□□□ 1.06
CAPNS1-216ENST00000628306 DHRSXQ8N5I4 330 aa21.7■■□□□ 1.06
CAPNS1-216ENST00000628306 PIK3C3Q8NEB9 887 aa21.7■■□□□ 1.06
CAPNS1-216ENST00000628306 MDFIQ99750 246 aa21.7■■□□□ 1.06
CAPNS1-216ENST00000628306 TUBA1CQ9BQE3 449 aa21.7■■□□□ 1.06
CAPNS1-216ENST00000628306 ANKRD60Q9BZ19 345 aa21.7■■□□□ 1.06
CAPNS1-216ENST00000628306 HOXD1Q9GZZ0 328 aa21.7■■□□□ 1.06
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CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF443Q9Y2A4 671 aaPredicted RBP21.7■■□□□ 1.06
CAPNS1-216ENST00000628306 GXYLT2A0PJZ3 443 aa21.69■■□□□ 1.06
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CAPNS1-216ENST00000628306 NPIPB9F8W1W9 429 aa21.69■■□□□ 1.06
CAPNS1-216ENST00000628306 GNB5O14775 395 aa21.69■■□□□ 1.06
CAPNS1-216ENST00000628306 SIAH2O43255 324 aa21.69■■□□□ 1.06
CAPNS1-216ENST00000628306 DIRAS1O95057 198 aa21.69■■□□□ 1.06
CAPNS1-216ENST00000628306 LY6G6DO95868 133 aa21.69■■□□□ 1.06
CAPNS1-216ENST00000628306 TMIGD3P0DMS9 266 aaPredicted RBP21.69■■□□□ 1.06
CAPNS1-216ENST00000628306 THRBP10828 461 aa21.69■■□□□ 1.06
CAPNS1-216ENST00000628306 ANXA8P13928 327 aa21.69■■□□□ 1.06
CAPNS1-216ENST00000628306 IL7RP16871 459 aa21.69■■□□□ 1.06
CAPNS1-216ENST00000628306 RAD23AP54725 363 aa21.69■■□□□ 1.06
CAPNS1-216ENST00000628306 EEF1A1P68104 462 aaKnown RBP21.69■■□□□ 1.06
CAPNS1-216ENST00000628306 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP21.69■■□□□ 1.062e-10■■■■■ 40.3
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CAPNS1-216ENST00000628306 MICAQ29983 383 aa21.69■■□□□ 1.06
CAPNS1-216ENST00000628306 SHEQ5VZ18 495 aa21.69■■□□□ 1.06
CAPNS1-216ENST00000628306 KDM4DQ6B0I6 523 aa21.69■■□□□ 1.06
CAPNS1-216ENST00000628306 NPSR1Q6W5P4 371 aa21.69■■□□□ 1.06
CAPNS1-216ENST00000628306 LINC00471Q8N535 108 aa21.69■■□□□ 1.06
CAPNS1-216ENST00000628306 TOR1AIP2Q8NFQ8 470 aa21.69■■□□□ 1.06
CAPNS1-216ENST00000628306 SMPDL3BQ92485 455 aa21.69■■□□□ 1.06
CAPNS1-216ENST00000628306 COX4I2Q96KJ9 171 aa21.69■■□□□ 1.06
CAPNS1-216ENST00000628306 ADI1Q9BV57 179 aa21.69■■□□□ 1.06
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CAPNS1-216ENST00000628306 CHST2Q9Y4C5 530 aa21.69■■□□□ 1.06
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CAPNS1-216ENST00000628306 A0A1W2PRQ8 180 aa21.68■■□□□ 1.06
CAPNS1-216ENST00000628306 KIAA1324LA8MWY0 1029 aaPredicted RBP21.68■■□□□ 1.06
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CAPNS1-216ENST00000628306 TTC23Q5W5X9 447 aa21.68■■□□□ 1.06
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CAPNS1-216ENST00000628306 OR4D11Q8NGI4 311 aa21.68■■□□□ 1.06
CAPNS1-216ENST00000628306 GIPC3Q8TF64 312 aa21.68■■□□□ 1.06
CAPNS1-216ENST00000628306 HGDQ93099 445 aa21.68■■□□□ 1.06
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CAPNS1-216ENST00000628306 ITPAQ9BY32 194 aa21.68■■□□□ 1.06
CAPNS1-216ENST00000628306 NXF5Q9H1B4 397 aaKnown RBP21.68■■□□□ 1.06
CAPNS1-216ENST00000628306 ANKRD19PQ9H560 264 aa21.68■■□□□ 1.06
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CAPNS1-216ENST00000628306 PDP1Q9P0J1 537 aaPredicted RBP21.68■■□□□ 1.06
CAPNS1-216ENST00000628306 MAGED1Q9Y5V3 778 aaPredicted RBP21.68■■□□□ 1.06
CAPNS1-216ENST00000628306 U3KQV3 271 aa21.68■■□□□ 1.06
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CAPNS1-216ENST00000628306 FMO6PO60774 539 aa21.67■■□□□ 1.06
CAPNS1-216ENST00000628306 UGT2B17O75795 530 aa21.67■■□□□ 1.06
CAPNS1-216ENST00000628306 GADD45GO95257 159 aa21.67■■□□□ 1.06
CAPNS1-216ENST00000628306 OXSR1O95747 527 aaPredicted RBP21.67■■□□□ 1.06
CAPNS1-216ENST00000628306 IFNA8P32881 189 aa21.67■■□□□ 1.06
CAPNS1-216ENST00000628306 CAPGP40121 348 aa21.67■■□□□ 1.06
CAPNS1-216ENST00000628306 RPS6KA3P51812 740 aa21.67■■□□□ 1.06
CAPNS1-216ENST00000628306 SPIBQ01892 262 aa21.67■■□□□ 1.06
CAPNS1-216ENST00000628306 GPR68Q15743 365 aa21.67■■□□□ 1.06
CAPNS1-216ENST00000628306 C6orf52Q5T4I8 152 aa21.67■■□□□ 1.06
CAPNS1-216ENST00000628306 CCNJQ5T5M9 372 aa21.67■■□□□ 1.06
CAPNS1-216ENST00000628306 TMEM81Q6P7N7 255 aa21.67■■□□□ 1.06
CAPNS1-216ENST00000628306 OR6T1Q8NGN1 323 aa21.67■■□□□ 1.06
CAPNS1-216ENST00000628306 PRRC1Q96M27 445 aa21.67■■□□□ 1.06
CAPNS1-216ENST00000628306 TMEFF2Q9UIK5 374 aaPredicted RBP21.67■■□□□ 1.06
CAPNS1-216ENST00000628306 A4GNTQ9UNA3 340 aa21.67■■□□□ 1.06
CAPNS1-216ENST00000628306 TESMINQ9Y4I5 508 aa21.67■■□□□ 1.06
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