RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000627440.2

SNAP23-223, Transcript of synaptosome associated protein 23, human

TSL 5 BASIC

Gene SNAP23, Length 210 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNAP23-223	ENST00000627440	PON1	P27169	355 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNAP23-223	ENST00000627440	SLC7A1	P30825	629 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNAP23-223	ENST00000627440	ARR3	P36575	388 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNAP23-223	ENST00000627440	CLK3	P49761	638 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SNAP23-223	ENST00000627440	KLF3	P57682	345 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SNAP23-223	ENST00000627440	TCTA	P57738	103 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNAP23-223	ENST00000627440	IRF8	Q02556	426 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNAP23-223	ENST00000627440	TGM3	Q08188	693 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNAP23-223	ENST00000627440	CSTF3	Q12996	717 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SNAP23-223	ENST00000627440	PNOC	Q13519	176 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNAP23-223	ENST00000627440	CLEC16A	Q2KHT3	1053 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNAP23-223	ENST00000627440	TRMT5	Q32P41	509 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SNAP23-223	ENST00000627440	TSPO2	Q5TGU0	170 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNAP23-223	ENST00000627440	ZNF658	Q5TYW1	1059 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SNAP23-223	ENST00000627440	DIEXF	Q68CQ4	756 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SNAP23-223	ENST00000627440	FAM173B	Q6P4H8	233 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNAP23-223	ENST00000627440	C18orf65	Q6ZTR6	163 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNAP23-223	ENST00000627440	OR2W3	Q7Z3T1	314 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNAP23-223	ENST00000627440	SPATA12	Q7Z6I5	190 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNAP23-223	ENST00000627440	SLC26A10	Q8NG04	563 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNAP23-223	ENST00000627440	OR1K1	Q8NGR3	316 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNAP23-223	ENST00000627440	STYX	Q8WUJ0	223 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNAP23-223	ENST00000627440	EFHD2	Q96C19	240 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SNAP23-223	ENST00000627440	HSH2D	Q96JZ2	352 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNAP23-223	ENST00000627440	ZNF317	Q96PQ6	595 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SNAP23-223	ENST00000627440	TSPAN32	Q96QS1	320 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNAP23-223	ENST00000627440	NDN	Q99608	321 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNAP23-223	ENST00000627440	ROGDI	Q9GZN7	287 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNAP23-223	ENST00000627440	TUBA4B	Q9H853	241 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNAP23-223	ENST00000627440	SIX2	Q9NPC8	291 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNAP23-223	ENST00000627440	TMEM106B	Q9NUM4	274 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNAP23-223	ENST00000627440	BCAP29	Q9UHQ4	241 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNAP23-223	ENST00000627440	ZNF232	Q9UNY5	417 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNAP23-223	ENST00000627440	HEY1	Q9Y5J3	304 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNAP23-223	ENST00000627440		A0A1W2PRB8	838 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNAP23-223	ENST00000627440	MACROD2	A1Z1Q3	448 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNAP23-223	ENST00000627440	MYO1G	B0I1T2	1018 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNAP23-223	ENST00000627440	PHYH	O14832	338 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNAP23-223	ENST00000627440	OIP5	O43482	229 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNAP23-223	ENST00000627440	SPRY3	O43610	288 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNAP23-223	ENST00000627440	PSPN	O60542	156 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNAP23-223	ENST00000627440	RSL1D1	O76021	490 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SNAP23-223	ENST00000627440	GPR75	O95800	540 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNAP23-223	ENST00000627440	OXT	P01178	125 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNAP23-223	ENST00000627440	SLC35E2B	P0CK96	405 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNAP23-223	ENST00000627440	DRD5	P21918	477 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNAP23-223	ENST00000627440	ELK4	P28324	431 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNAP23-223	ENST00000627440	SAA4	P35542	130 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNAP23-223	ENST00000627440	CRAT	P43155	626 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNAP23-223	ENST00000627440	PPIC	P45877	212 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNAP23-223	ENST00000627440	MAP2K3	P46734	347 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNAP23-223	ENST00000627440	ZNF81	P51508	661 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNAP23-223	ENST00000627440	MVD	P53602	400 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNAP23-223	ENST00000627440	PNLIPRP2	P54317	469 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNAP23-223	ENST00000627440	GEM	P55040	296 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNAP23-223	ENST00000627440	PSMA6	P60900	246 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SNAP23-223	ENST00000627440	DPYSL3	Q14195	570 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNAP23-223	ENST00000627440	SPARCL1	Q14515	664 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNAP23-223	ENST00000627440	PDK3	Q15120	406 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNAP23-223	ENST00000627440	CCNG2	Q16589	344 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNAP23-223	ENST00000627440	ACSBG2	Q5FVE4	666 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNAP23-223	ENST00000627440	RGS7BP	Q6MZT1	257 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SNAP23-223	ENST00000627440	AGTRAP	Q6RW13	159 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNAP23-223	ENST00000627440	ARMC8	Q8IUR7	673 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNAP23-223	ENST00000627440	ANKMY2	Q8IV38	441 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNAP23-223	ENST00000627440	DDIAS	Q8IXT1	998 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNAP23-223	ENST00000627440	MGARP	Q8TDB4	240 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNAP23-223	ENST00000627440	SLC9A6	Q92581	669 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNAP23-223	ENST00000627440	LRRC39	Q96DD0	335 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNAP23-223	ENST00000627440	SNF8	Q96H20	258 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNAP23-223	ENST00000627440	FRG2B	Q96QU4	278 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNAP23-223	ENST00000627440	PCDHB18P	Q96TA0	734 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNAP23-223	ENST00000627440	LRRC1	Q9BTT6	524 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNAP23-223	ENST00000627440	EHD1	Q9H4M9	534 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNAP23-223	ENST00000627440	MED17	Q9NVC6	651 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNAP23-223	ENST00000627440	PARVA	Q9NVD7	372 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNAP23-223	ENST00000627440		A0A096LPE4	126 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNAP23-223	ENST00000627440	IGLV3-32	A0A0A0MS00	114 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNAP23-223	ENST00000627440	FAM237A	A0A1B0GTK4	181 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNAP23-223	ENST00000627440		A0A1W2PPZ6	126 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNAP23-223	ENST00000627440	PGRMC2	O15173	223 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNAP23-223	ENST00000627440	SKAP2	O75563	359 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SNAP23-223	ENST00000627440	IGHV1-46	P01743	117 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNAP23-223	ENST00000627440	SNRNP70	P08621	437 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SNAP23-223	ENST00000627440	ARSB	P15848	533 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNAP23-223	ENST00000627440	PRKAR1B	P31321	381 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNAP23-223	ENST00000627440	STX2	P32856	288 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNAP23-223	ENST00000627440	RAB13	P51153	203 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNAP23-223	ENST00000627440	PRKAG1	P54619	331 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNAP23-223	ENST00000627440	UBASH3A	P57075	661 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNAP23-223	ENST00000627440	ZP1	P60852	638 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNAP23-223	ENST00000627440	EWSR1	Q01844	656 aa	Known RBP eCLIP	4.91	□□□□□ -1.62
SNAP23-223	ENST00000627440	C17orf67	Q0P5P2	114 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNAP23-223	ENST00000627440	PTGR1	Q14914	329 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNAP23-223	ENST00000627440	FXN	Q16595	210 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNAP23-223	ENST00000627440	WDR25	Q64LD2	544 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SNAP23-223	ENST00000627440	AFTPH	Q6ULP2	937 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNAP23-223	ENST00000627440	C10orf99	Q6UWK7	81 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNAP23-223	ENST00000627440	RANBP10	Q6VN20	620 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNAP23-223	ENST00000627440	VMO1	Q7Z5L0	202 aa		4.91	□□□□□ -1.62

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