RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589742.5

RFX2-215, Transcript of regulatory factor X2, human

TSL 4

Gene RFX2, Length 565 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RFX2-215	ENST00000589742	PIN1	Q13526	163 aa	Predicted RBP	10.64	□□□□□ -0.71
RFX2-215	ENST00000589742	OR7A5	Q15622	319 aa		10.64	□□□□□ -0.71
RFX2-215	ENST00000589742	SLC25A35	Q3KQZ1	300 aa		10.64	□□□□□ -0.71
RFX2-215	ENST00000589742	C1orf140	Q5VVS0	124 aa		10.64	□□□□□ -0.71
RFX2-215	ENST00000589742	SP5	Q6BEB4	398 aa	Predicted RBP	10.64	□□□□□ -0.71
RFX2-215	ENST00000589742	C6orf89	Q6UWU4	347 aa		10.64	□□□□□ -0.71
RFX2-215	ENST00000589742	WDR88	Q6ZMY6	472 aa		10.64	□□□□□ -0.71
RFX2-215	ENST00000589742	FKBP9P1	Q75LS8	142 aa		10.64	□□□□□ -0.71
RFX2-215	ENST00000589742	LUZP2	Q86TE4	346 aa		10.64	□□□□□ -0.71
RFX2-215	ENST00000589742	CCDC103	Q8IW40	242 aa		10.64	□□□□□ -0.71
RFX2-215	ENST00000589742	TUSC5	Q8IXB3	177 aa		10.64	□□□□□ -0.71
RFX2-215	ENST00000589742	STK35	Q8TDR2	534 aa		10.64	□□□□□ -0.71
RFX2-215	ENST00000589742	ADAMTS16	Q8TE57	1224 aa		10.64	□□□□□ -0.71
RFX2-215	ENST00000589742	LZIC	Q8WZA0	190 aa		10.64	□□□□□ -0.71
RFX2-215	ENST00000589742	SLC38A4	Q969I6	547 aa		10.64	□□□□□ -0.71
RFX2-215	ENST00000589742	SLC25A36	Q96CQ1	311 aa		10.64	□□□□□ -0.71
RFX2-215	ENST00000589742	STARD4	Q96DR4	205 aa		10.64	□□□□□ -0.71
RFX2-215	ENST00000589742	KTI12	Q96EK9	354 aa	Predicted RBP	10.64	□□□□□ -0.71
RFX2-215	ENST00000589742	HSH2D	Q96JZ2	352 aa		10.64	□□□□□ -0.71
RFX2-215	ENST00000589742	CLPTM1L	Q96KA5	538 aa		10.64	□□□□□ -0.71
RFX2-215	ENST00000589742	ZFP3	Q96NJ6	502 aa		10.64	□□□□□ -0.71
RFX2-215	ENST00000589742	SFXN3	Q9BWM7	321 aa		10.64	□□□□□ -0.71
RFX2-215	ENST00000589742	C12orf10	Q9HB07	376 aa		10.64	□□□□□ -0.71
RFX2-215	ENST00000589742	KLHL13	Q9P2N7	655 aa		10.64	□□□□□ -0.71
RFX2-215	ENST00000589742	TRAPPC4	Q9Y296	219 aa		10.64	□□□□□ -0.71
RFX2-215	ENST00000589742	SNX13	Q9Y5W8	968 aa		10.64	□□□□□ -0.71
RFX2-215	ENST00000589742		V9GYQ6	96 aa		10.64	□□□□□ -0.71
RFX2-215	ENST00000589742	PTPN13	Q12923	2485 aa		10.64	□□□□□ -0.71
RFX2-215	ENST00000589742	PKDREJ	Q9NTG1	2253 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RFX2-215	ENST00000589742		A0A087WUJ7	227 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RFX2-215	ENST00000589742	TRAPPC13	A5PLN9	417 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RFX2-215	ENST00000589742	LIPT2	A6NK58	231 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RFX2-215	ENST00000589742		J3KTA2	159 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RFX2-215	ENST00000589742	ARPC2	O15144	300 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RFX2-215	ENST00000589742	SMNDC1	O75940	238 aa	Known RBP eCLIP	10.63	□□□□□ -0.71
RFX2-215	ENST00000589742	PRKD3	O94806	890 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RFX2-215	ENST00000589742	AKR7A3	O95154	331 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RFX2-215	ENST00000589742	AHSA1	O95433	338 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RFX2-215	ENST00000589742	CRH	P06850	196 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RFX2-215	ENST00000589742	PNMT	P11086	282 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RFX2-215	ENST00000589742	FUT4	P22083	530 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RFX2-215	ENST00000589742	CBL	P22681	906 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RFX2-215	ENST00000589742	RPS5	P46782	204 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
RFX2-215	ENST00000589742	CTBP2	P56545	445 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RFX2-215	ENST00000589742	SLC35A1	P78382	337 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RFX2-215	ENST00000589742	CBX1	P83916	185 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RFX2-215	ENST00000589742	TFF3	Q07654	80 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RFX2-215	ENST00000589742	RASGEF1B	Q0VAM2	473 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RFX2-215	ENST00000589742	SNTB1	Q13884	538 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
RFX2-215	ENST00000589742	GUSBP1	Q15486	140 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RFX2-215	ENST00000589742	IFI44L	Q53G44	452 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RFX2-215	ENST00000589742	GTF2IRD2B	Q6EKJ0	949 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RFX2-215	ENST00000589742	ZNF613	Q6PF04	617 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RFX2-215	ENST00000589742	NUFIP2	Q7Z417	695 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
RFX2-215	ENST00000589742	GDF7	Q7Z4P5	450 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RFX2-215	ENST00000589742	GTF2IRD2	Q86UP8	949 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RFX2-215	ENST00000589742	FAM86B1	Q8N7N1	296 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RFX2-215	ENST00000589742	TMEM99	Q8N816	258 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RFX2-215	ENST00000589742	RNF128	Q8TEB7	428 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RFX2-215	ENST00000589742	SLC7A6OS	Q96CW6	309 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
RFX2-215	ENST00000589742	SLC41A3	Q96GZ6	507 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RFX2-215	ENST00000589742	GMPPA	Q96IJ6	420 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
RFX2-215	ENST00000589742	ZNF300	Q96RE9	604 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
RFX2-215	ENST00000589742	THTPA	Q9BU02	230 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RFX2-215	ENST00000589742	PTDSS2	Q9BVG9	487 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RFX2-215	ENST00000589742	TAPBPL	Q9BX59	468 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RFX2-215	ENST00000589742	AMBRA1	Q9C0C7	1298 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RFX2-215	ENST00000589742	OPN3	Q9H1Y3	402 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
RFX2-215	ENST00000589742	NPDC1	Q9NQX5	325 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
RFX2-215	ENST00000589742	DCAF13	Q9NV06	445 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
RFX2-215	ENST00000589742	ING1	Q9UK53	422 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
RFX2-215	ENST00000589742	SLC7A7	Q9UM01	511 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RFX2-215	ENST00000589742	KLF2	Q9Y5W3	355 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
RFX2-215	ENST00000589742	FREM1	Q5H8C1	2179 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RFX2-215	ENST00000589742	CHP2	O43745	196 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RFX2-215	ENST00000589742	CYTIP	O60759	359 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RFX2-215	ENST00000589742	SS18L1	O75177	396 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
RFX2-215	ENST00000589742	CGA	P01215	116 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RFX2-215	ENST00000589742	GPI	P06744	558 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RFX2-215	ENST00000589742	AGTR1	P30556	359 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RFX2-215	ENST00000589742	TAS2R41	P59536	307 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RFX2-215	ENST00000589742	MS4A2	Q01362	244 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RFX2-215	ENST00000589742	LTB	Q06643	244 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RFX2-215	ENST00000589742	RNPS1	Q15287	305 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
RFX2-215	ENST00000589742	FXN	Q16595	210 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RFX2-215	ENST00000589742	LINC00114	Q6XXX2	140 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RFX2-215	ENST00000589742	FAM214B	Q7L5A3	538 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RFX2-215	ENST00000589742	NKAIN4	Q8IVV8	208 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RFX2-215	ENST00000589742	SLC43A2	Q8N370	569 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RFX2-215	ENST00000589742	ZNF610	Q8N9Z0	462 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RFX2-215	ENST00000589742	GEMIN6	Q8WXD5	167 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
RFX2-215	ENST00000589742	TAAR8	Q969N4	342 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RFX2-215	ENST00000589742	ZHX1-C8orf76	Q96EF9	292 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RFX2-215	ENST00000589742	NSMCE2	Q96MF7	247 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RFX2-215	ENST00000589742	PSD2	Q9BQI7	771 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RFX2-215	ENST00000589742	PRSS27	Q9BQR3	290 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RFX2-215	ENST00000589742	NAA11	Q9BSU3	229 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
RFX2-215	ENST00000589742	C1orf21	Q9H246	121 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RFX2-215	ENST00000589742	C12orf49	Q9H741	205 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RFX2-215	ENST00000589742	GORASP2	Q9H8Y8	452 aa		10.62	□□□□□ -0.71

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