RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577827.5

PTPRM-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRM, Length 4,640 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-205ENST00000577827 QRSL1Q9H0R6 528 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
PTPRM-205ENST00000577827 SPNS1Q9H2V7 528 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRM-205ENST00000577827 NOX4Q9NPH5 578 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRM-205ENST00000577827 MARCH5Q9NX47 278 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRM-205ENST00000577827 H3BUI4 141 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRM-205ENST00000577827 CDC123O75794 336 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
PTPRM-205ENST00000577827 INHBBP09529 407 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRM-205ENST00000577827 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
PTPRM-205ENST00000577827 EIF2B1Q14232 305 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
PTPRM-205ENST00000577827 GPR18Q14330 331 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRM-205ENST00000577827 CCSMST1Q4G0I0 132 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRM-205ENST00000577827 CCNJQ5T5M9 372 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRM-205ENST00000577827 TMEM225Q6GV28 225 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRM-205ENST00000577827 RTL6Q6ICC9 239 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRM-205ENST00000577827 SSX6Q7RTT6 188 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRM-205ENST00000577827 FAM122BQ7Z309 247 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRM-205ENST00000577827 SGPP2Q8IWX5 399 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRM-205ENST00000577827 PAQR8Q8TEZ7 354 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRM-205ENST00000577827 TMEM255BQ8WV15 326 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRM-205ENST00000577827 OR14A2Q96R54 314 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRM-205ENST00000577827 TEAD3Q99594 435 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRM-205ENST00000577827 SGPP1Q9BX95 441 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRM-205ENST00000577827 METTL7AQ9H8H3 244 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRM-205ENST00000577827 PDE7BQ9NP56 450 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRM-205ENST00000577827 SIRT5Q9NXA8 310 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRM-205ENST00000577827 FTSJ1Q9UET6 329 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRM-205ENST00000577827 FBXL2Q9UKC9 423 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRM-205ENST00000577827 NUDT19A8MXV4 375 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRM-205ENST00000577827 SRMP19623 302 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRM-205ENST00000577827 RAG2P55895 527 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRM-205ENST00000577827 CSNK2A1P68400 391 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
PTPRM-205ENST00000577827 FLI1Q01543 452 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
PTPRM-205ENST00000577827 TOR2AQ5JU69 321 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRM-205ENST00000577827 CLLU1Q5K131 121 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRM-205ENST00000577827 DPY19L2P2Q6ZN68 376 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRM-205ENST00000577827 TMUB2Q71RG4 321 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRM-205ENST00000577827 BHLHA9Q7RTU4 235 aa9.63□□□□□ -0.87
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PTPRM-205ENST00000577827 DOK4Q8TEW6 326 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRM-205ENST00000577827 RNF141Q8WVD5 230 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRM-205ENST00000577827 HMGB4Q8WW32 186 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRM-205ENST00000577827 PGAM5Q96HS1 289 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRM-205ENST00000577827 NECTIN4Q96NY8 510 aa9.63□□□□□ -0.87
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PTPRM-205ENST00000577827 DNTTIP1Q9H147 329 aa9.63□□□□□ -0.87
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PTPRM-205ENST00000577827 A0A1B0GUH1 482 aa9.63□□□□□ -0.87
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PTPRM-205ENST00000577827 SNRPGP15A8MWD9 76 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRM-205ENST00000577827 NPIPA7E9PJI5 369 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRM-205ENST00000577827 THBS1P07996 1170 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRM-205ENST00000577827 NPIPA8P0DM63 369 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRM-205ENST00000577827 HOXA9P31269 272 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRM-205ENST00000577827 PER3P56645 1201 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRM-205ENST00000577827 KIAA1024LP59773 190 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRM-205ENST00000577827 DBPQ10586 325 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
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PTPRM-205ENST00000577827 PXDC1Q5TGL8 231 aa9.63□□□□□ -0.87
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PTPRM-205ENST00000577827 PCNPQ8WW12 178 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
PTPRM-205ENST00000577827 ZDHHC12Q96GR4 267 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRM-205ENST00000577827 SLC25A44Q96H78 314 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
PTPRM-205ENST00000577827 TNFRSF13CQ96RJ3 184 aa9.63□□□□□ -0.87
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PTPRM-205ENST00000577827 ARPC5LQ9BPX5 153 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRM-205ENST00000577827 SPIN2BQ9BPZ2 258 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRM-205ENST00000577827 HINT3Q9NQE9 182 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
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PTPRM-205ENST00000577827 C18orf63Q68DL7 685 aa9.63□□□□□ -0.87
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PTPRM-205ENST00000577827 TEX261Q6UWH6 196 aa9.63□□□□□ -0.87
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PTPRM-205ENST00000577827 OR5D14Q8NGL3 314 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRM-205ENST00000577827 ST8SIA4Q92187 359 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRM-205ENST00000577827 RELTQ969Z4 430 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRM-205ENST00000577827 SORCS2Q96PQ0 1159 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRM-205ENST00000577827 RPS10P5Q9NQ39 176 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRM-205ENST00000577827 SLC6A13Q9NSD5 602 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRM-205ENST00000577827 DZANK1Q9NVP4 752 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRM-205ENST00000577827 U3KQ87 197 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRM-205ENST00000577827 VSTM2BA6NLU5 285 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRM-205ENST00000577827 DSCR3O14972 297 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRM-205ENST00000577827 AKR7A2O43488 359 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRM-205ENST00000577827 SCO2O43819 266 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRM-205ENST00000577827 DIRAS3O95661 229 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRM-205ENST00000577827 SOD1P00441 154 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRM-205ENST00000577827 PTGER1P34995 402 aa9.63□□□□□ -0.87
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