RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577426.1

TRAPPC8-202, Transcript of trafficking protein particle complex 8, humanhuman

TSL 5

Gene TRAPPC8, Length 437 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8-202ENST00000577426 REEP4Q9H6H4 257 aa4.5□□□□□ -1.69
TRAPPC8-202ENST00000577426 LRTM1Q9HBL6 345 aa4.5□□□□□ -1.69
TRAPPC8-202ENST00000577426 EQTNQ9NQ60 294 aa4.5□□□□□ -1.69
TRAPPC8-202ENST00000577426 PLSCR4Q9NRQ2 329 aa4.5□□□□□ -1.69
TRAPPC8-202ENST00000577426 ACSS1Q9NUB1 689 aaPredicted RBP4.5□□□□□ -1.69
TRAPPC8-202ENST00000577426 C1orf109Q9NX04 203 aa4.5□□□□□ -1.69
TRAPPC8-202ENST00000577426 PAQR5Q9NXK6 330 aaPredicted RBP4.5□□□□□ -1.69
TRAPPC8-202ENST00000577426 KLHL28Q9NXS3 571 aa4.5□□□□□ -1.69
TRAPPC8-202ENST00000577426 ZNF226Q9NYT6 803 aa4.5□□□□□ -1.69
TRAPPC8-202ENST00000577426 ZIM2Q9NZV7 527 aa4.5□□□□□ -1.69
TRAPPC8-202ENST00000577426 MARCOQ9UEW3 520 aaPredicted RBP4.5□□□□□ -1.69
TRAPPC8-202ENST00000577426 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP4.5□□□□□ -1.69
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TRAPPC8-202ENST00000577426 ARID1AO14497 2285 aa4.49□□□□□ -1.69
TRAPPC8-202ENST00000577426 MXRA5Q9NR99 2828 aa4.49□□□□□ -1.69
TRAPPC8-202ENST00000577426 PRR14LQ5THK1 2151 aa4.49□□□□□ -1.69
TRAPPC8-202ENST00000577426 SVEP1Q4LDE5 3571 aa4.49□□□□□ -1.69
TRAPPC8-202ENST00000577426 A0A0G2JND7 137 aa4.49□□□□□ -1.69
TRAPPC8-202ENST00000577426 A0A1W2PQD3 144 aa4.49□□□□□ -1.69
TRAPPC8-202ENST00000577426 ERICH4A6NGS2 130 aa4.49□□□□□ -1.69
TRAPPC8-202ENST00000577426 SLCO1B7G3V0H7 640 aa4.49□□□□□ -1.69
TRAPPC8-202ENST00000577426 C16orf97H3BN30 126 aa4.49□□□□□ -1.69
TRAPPC8-202ENST00000577426 EBAG9O00559 213 aa4.49□□□□□ -1.69
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TRAPPC8-202ENST00000577426 GMFGO60234 142 aa4.49□□□□□ -1.69
TRAPPC8-202ENST00000577426 SS18L1O75177 396 aaPredicted RBP4.49□□□□□ -1.69
TRAPPC8-202ENST00000577426 CRLF1O75462 422 aa4.49□□□□□ -1.69
TRAPPC8-202ENST00000577426 DCTN3O75935 186 aa4.49□□□□□ -1.69
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TRAPPC8-202ENST00000577426 KITP10721 976 aa4.49□□□□□ -1.69
TRAPPC8-202ENST00000577426 ACP2P11117 423 aa4.49□□□□□ -1.69
TRAPPC8-202ENST00000577426 IL11P20809 199 aa4.49□□□□□ -1.69
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TRAPPC8-202ENST00000577426 LCN1P31025 176 aa4.49□□□□□ -1.69
TRAPPC8-202ENST00000577426 SLC6A8P48029 635 aa4.49□□□□□ -1.69
TRAPPC8-202ENST00000577426 RFX3P48380 749 aa4.49□□□□□ -1.69
TRAPPC8-202ENST00000577426 RPL14P50914 215 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
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TRAPPC8-202ENST00000577426 MLC1Q15049 377 aa4.49□□□□□ -1.69
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TRAPPC8-202ENST00000577426 MFSD12Q6NUT3 480 aa4.49□□□□□ -1.69
TRAPPC8-202ENST00000577426 ZCCHC12Q6PEW1 402 aa4.49□□□□□ -1.69
TRAPPC8-202ENST00000577426 PRSS57Q6UWY2 283 aa4.49□□□□□ -1.69
TRAPPC8-202ENST00000577426 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP4.49□□□□□ -1.69
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TRAPPC8-202ENST00000577426 ZNF550Q7Z398 422 aa4.49□□□□□ -1.69
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TRAPPC8-202ENST00000577426 GPR151Q8TDV0 419 aa4.49□□□□□ -1.69
TRAPPC8-202ENST00000577426 ACTRT2Q8TDY3 377 aa4.49□□□□□ -1.69
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TRAPPC8-202ENST00000577426 PARPBPQ9NWS1 579 aa4.49□□□□□ -1.69
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TRAPPC8-202ENST00000577426 DNAJC15Q9Y5T4 150 aa4.49□□□□□ -1.69
TRAPPC8-202ENST00000577426 CR1P17927 2039 aa4.48□□□□□ -1.69
TRAPPC8-202ENST00000577426 A0A1W2PRB8 838 aa4.48□□□□□ -1.69
TRAPPC8-202ENST00000577426 CCT8L1PA6NM43 557 aa4.48□□□□□ -1.69
TRAPPC8-202ENST00000577426 TRPC5OSA6NMA1 111 aa4.48□□□□□ -1.69
TRAPPC8-202ENST00000577426 TMEM233B4DJY2 109 aa4.48□□□□□ -1.69
TRAPPC8-202ENST00000577426 TNFSF11O14788 317 aa4.48□□□□□ -1.69
TRAPPC8-202ENST00000577426 PIP5K1BO14986 540 aa4.48□□□□□ -1.69
TRAPPC8-202ENST00000577426 SCAMP2O15127 329 aaKnown RBP4.48□□□□□ -1.69
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