RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552222.5

CS-231, Transcript of citrate synthase, human

TSL 4

Gene CS, Length 555 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-231	ENST00000552222	ICAM5	Q9UMF0	924 aa		12.31	□□□□□ -0.44
CS-231	ENST00000552222	ZNF232	Q9UNY5	417 aa		12.31	□□□□□ -0.44
CS-231	ENST00000552222	ZNF443	Q9Y2A4	671 aa	Predicted RBP	12.31	□□□□□ -0.44
CS-231	ENST00000552222	MRPS18C	Q9Y3D5	142 aa	Known RBP	12.31	□□□□□ -0.44
CS-231	ENST00000552222	IGHV4-30-2	A0A087WSY4	118 aa		12.3	□□□□□ -0.44
CS-231	ENST00000552222	CDHR4	A6H8M9	788 aa		12.3	□□□□□ -0.44
CS-231	ENST00000552222	C16orf97	H3BN30	126 aa		12.3	□□□□□ -0.44
CS-231	ENST00000552222	HS3ST1	O14792	307 aa		12.3	□□□□□ -0.44
CS-231	ENST00000552222	MSTN	O14793	375 aa		12.3	□□□□□ -0.44
CS-231	ENST00000552222	ZIC3	O60481	467 aa		12.3	□□□□□ -0.44
CS-231	ENST00000552222	MFN2	O95140	757 aa		12.3	□□□□□ -0.44
CS-231	ENST00000552222	UBTFL6	P0CB48	400 aa	Predicted RBP	12.3	□□□□□ -0.44
CS-231	ENST00000552222	CPN1	P15169	458 aa		12.3	□□□□□ -0.44
CS-231	ENST00000552222	SRD5A2	P31213	254 aa		12.3	□□□□□ -0.44
CS-231	ENST00000552222	FAP	Q12884	760 aa		12.3	□□□□□ -0.44
CS-231	ENST00000552222	LARS2	Q15031	903 aa	Known RBP	12.3	□□□□□ -0.44
CS-231	ENST00000552222	SF3B4	Q15427	424 aa	Known RBP eCLIP	12.3	□□□□□ -0.44	5e-6	■□□□□ 9.5
CS-231	ENST00000552222	ZSWIM7	Q19AV6	140 aa		12.3	□□□□□ -0.44
CS-231	ENST00000552222	ZNF311	Q5JNZ3	666 aa		12.3	□□□□□ -0.44
CS-231	ENST00000552222	RNF220	Q5VTB9	566 aa		12.3	□□□□□ -0.44
CS-231	ENST00000552222	ZNF836	Q6ZNA1	936 aa		12.3	□□□□□ -0.44
CS-231	ENST00000552222	RINL	Q6ZS11	566 aa		12.3	□□□□□ -0.44
CS-231	ENST00000552222	PATL1	Q86TB9	770 aa	Known RBP	12.3	□□□□□ -0.44
CS-231	ENST00000552222	IFNE	Q86WN2	208 aa		12.3	□□□□□ -0.44
CS-231	ENST00000552222	WFDC8	Q8IUA0	241 aa		12.3	□□□□□ -0.44
CS-231	ENST00000552222	DEFB107A	Q8IZN7	70 aa		12.3	□□□□□ -0.44
CS-231	ENST00000552222	TOR1AIP2	Q8NFQ8	470 aa		12.3	□□□□□ -0.44
CS-231	ENST00000552222	OR5W2	Q8NH69	310 aa		12.3	□□□□□ -0.44
CS-231	ENST00000552222	CNOT9	Q92600	299 aa	Known RBP	12.3	□□□□□ -0.44
CS-231	ENST00000552222	KCNK17	Q96T54	332 aa		12.3	□□□□□ -0.44
CS-231	ENST00000552222	C1orf21	Q9H246	121 aa		12.3	□□□□□ -0.44
CS-231	ENST00000552222	CACYBP	Q9HB71	228 aa	Known RBP	12.3	□□□□□ -0.44
CS-231	ENST00000552222	EXOSC3	Q9NQT5	275 aa	Known RBP	12.3	□□□□□ -0.44
CS-231	ENST00000552222	TAS2R1	Q9NYW7	299 aa		12.3	□□□□□ -0.44
CS-231	ENST00000552222	ADA2	Q9NZK5	511 aa		12.3	□□□□□ -0.44
CS-231	ENST00000552222	CD300A	Q9UGN4	299 aa		12.3	□□□□□ -0.44
CS-231	ENST00000552222	CHST2	Q9Y4C5	530 aa		12.3	□□□□□ -0.44
CS-231	ENST00000552222	MAGED1	Q9Y5V3	778 aa	Predicted RBP	12.3	□□□□□ -0.44
CS-231	ENST00000552222		A0A087WZY1	265 aa		12.29	□□□□□ -0.44
CS-231	ENST00000552222		A0A096LNT2	108 aa		12.29	□□□□□ -0.44
CS-231	ENST00000552222	PRORSD1P	A6NEY8	169 aa		12.29	□□□□□ -0.44
CS-231	ENST00000552222		M0QX08	132 aa		12.29	□□□□□ -0.44
CS-231	ENST00000552222	OVOL3	O00110	214 aa		12.29	□□□□□ -0.44
CS-231	ENST00000552222	GMFG	O60234	142 aa		12.29	□□□□□ -0.44
CS-231	ENST00000552222	SERPINB7	O75635	380 aa		12.29	□□□□□ -0.44
CS-231	ENST00000552222	CGA	P01215	116 aa		12.29	□□□□□ -0.44
CS-231	ENST00000552222	PRKAR1B	P31321	381 aa		12.29	□□□□□ -0.44
CS-231	ENST00000552222	LHX2	P50458	406 aa		12.29	□□□□□ -0.44
CS-231	ENST00000552222	CRYBA2	P53672	197 aa		12.29	□□□□□ -0.44
CS-231	ENST00000552222	CLDN18	P56856	261 aa		12.29	□□□□□ -0.44
CS-231	ENST00000552222	RPS4X	P62701	263 aa	Known RBP	12.29	□□□□□ -0.44
CS-231	ENST00000552222	SPATS1	Q496A3	300 aa		12.29	□□□□□ -0.44
CS-231	ENST00000552222	GLYR1	Q49A26	553 aa	Predicted RBP	12.29	□□□□□ -0.44
CS-231	ENST00000552222	SAMD4B	Q5PRF9	694 aa	Known RBP	12.29	□□□□□ -0.44
CS-231	ENST00000552222	DHRS4L2	Q6PKH6	230 aa		12.29	□□□□□ -0.44
CS-231	ENST00000552222	DNM1P46	Q6ZS02	220 aa		12.29	□□□□□ -0.44
CS-231	ENST00000552222	ZNF771	Q7L3S4	317 aa	Predicted RBP	12.29	□□□□□ -0.44
CS-231	ENST00000552222	ARMC8	Q8IUR7	673 aa		12.29	□□□□□ -0.44
CS-231	ENST00000552222	CLIP4	Q8N3C7	705 aa		12.29	□□□□□ -0.44
CS-231	ENST00000552222	ZNF611	Q8N823	705 aa		12.29	□□□□□ -0.44
CS-231	ENST00000552222	OR14L1P	Q8NHC6	308 aa		12.29	□□□□□ -0.44
CS-231	ENST00000552222	GPR119	Q8TDV5	335 aa		12.29	□□□□□ -0.44
CS-231	ENST00000552222	CDRT15	Q96T59	188 aa		12.29	□□□□□ -0.44
CS-231	ENST00000552222	KCTD14	Q9BQ13	255 aa	Predicted RBP	12.29	□□□□□ -0.44
CS-231	ENST00000552222	RLIM	Q9NVW2	624 aa		12.29	□□□□□ -0.44
CS-231	ENST00000552222	TAS2R10	Q9NYW0	307 aa		12.29	□□□□□ -0.44
CS-231	ENST00000552222	DKKL1	Q9UK85	242 aa		12.29	□□□□□ -0.44
CS-231	ENST00000552222	CDC42EP3	Q9UKI2	254 aa		12.29	□□□□□ -0.44
CS-231	ENST00000552222	C7orf72	A4D263	438 aa		12.28	□□□□□ -0.44
CS-231	ENST00000552222	TPST1	O60507	370 aa		12.28	□□□□□ -0.44
CS-231	ENST00000552222	CYP7B1	O75881	506 aa		12.28	□□□□□ -0.44
CS-231	ENST00000552222	ACTL6A	O96019	429 aa		12.28	□□□□□ -0.44
CS-231	ENST00000552222	LINGO3	P0C6S8	592 aa		12.28	□□□□□ -0.44
CS-231	ENST00000552222	HSD17B1	P14061	328 aa		12.28	□□□□□ -0.44
CS-231	ENST00000552222	HK1	P19367	917 aa		12.28	□□□□□ -0.44
CS-231	ENST00000552222	IDUA	P35475	653 aa		12.28	□□□□□ -0.44
CS-231	ENST00000552222	GFRA1	P56159	465 aa		12.28	□□□□□ -0.44
CS-231	ENST00000552222	CLDN15	P56746	228 aa		12.28	□□□□□ -0.44
CS-231	ENST00000552222	B3GALT5-AS1	P59052	145 aa		12.28	□□□□□ -0.44
CS-231	ENST00000552222	BNIP1	Q12981	228 aa		12.28	□□□□□ -0.44
CS-231	ENST00000552222	TMEM44	Q2T9K0	475 aa		12.28	□□□□□ -0.44
CS-231	ENST00000552222	PLPPR5	Q32ZL2	321 aa		12.28	□□□□□ -0.44
CS-231	ENST00000552222	COMTD1	Q86VU5	262 aa		12.28	□□□□□ -0.44
CS-231	ENST00000552222	ZNF440	Q8IYI8	595 aa		12.28	□□□□□ -0.44
CS-231	ENST00000552222	UBQLNL	Q8IYU4	475 aa		12.28	□□□□□ -0.44
CS-231	ENST00000552222	TMCO5A	Q8N6Q1	288 aa		12.28	□□□□□ -0.44
CS-231	ENST00000552222	RNF148	Q8N7C7	305 aa		12.28	□□□□□ -0.44
CS-231	ENST00000552222	ROBO4	Q8WZ75	1007 aa		12.28	□□□□□ -0.44
CS-231	ENST00000552222	TAMM41	Q96BW9	452 aa		12.28	□□□□□ -0.44
CS-231	ENST00000552222	ZNF524	Q96C55	264 aa		12.28	□□□□□ -0.44
CS-231	ENST00000552222	SLC7A6OS	Q96CW6	309 aa	Predicted RBP	12.28	□□□□□ -0.44
CS-231	ENST00000552222	AMBRA1	Q9C0C7	1298 aa		12.28	□□□□□ -0.44
CS-231	ENST00000552222	ARMC7	Q9H6L4	198 aa		12.28	□□□□□ -0.44
CS-231	ENST00000552222	MED17	Q9NVC6	651 aa		12.28	□□□□□ -0.44
CS-231	ENST00000552222	ETV2	O00321	342 aa	Predicted RBP	12.27	□□□□□ -0.45
CS-231	ENST00000552222	NUDT14	O95848	222 aa		12.27	□□□□□ -0.45
CS-231	ENST00000552222	OPN1SW	P03999	348 aa		12.27	□□□□□ -0.45
CS-231	ENST00000552222	ZNF16	P17020	682 aa	Predicted RBP	12.27	□□□□□ -0.45
CS-231	ENST00000552222	PGC	P20142	388 aa		12.27	□□□□□ -0.45
CS-231	ENST00000552222	CD247	P20963	164 aa		12.27	□□□□□ -0.45

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