RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548567.5

CS-212, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CS, Length 3,057 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-212ENST00000548567 NFKBIDQ8NI38 313 aa6.73□□□□□ -1.33
CS-212ENST00000548567 HGDQ93099 445 aa6.73□□□□□ -1.33
CS-212ENST00000548567 TAMM41Q96BW9 452 aa6.73□□□□□ -1.33
CS-212ENST00000548567 PKP2Q99959 881 aa6.73□□□□□ -1.33
CS-212ENST00000548567 DCUN1D5Q9BTE7 237 aa6.73□□□□□ -1.33
CS-212ENST00000548567 ACTR6Q9GZN1 396 aa6.73□□□□□ -1.33
CS-212ENST00000548567 MYNNQ9NPC7 610 aa6.73□□□□□ -1.33
CS-212ENST00000548567 NDRG3Q9UGV2 375 aa6.73□□□□□ -1.33
CS-212ENST00000548567 GDF2Q9UK05 429 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
CS-212ENST00000548567 PROCRQ9UNN8 238 aa6.73□□□□□ -1.33
CS-212ENST00000548567 RAP2CQ9Y3L5 183 aa6.73□□□□□ -1.33
CS-212ENST00000548567 MYO1GB0I1T2 1018 aa6.73□□□□□ -1.33
CS-212ENST00000548567 ATE1O95260 518 aa6.73□□□□□ -1.33
CS-212ENST00000548567 COX4I1P13073 169 aa6.73□□□□□ -1.33
CS-212ENST00000548567 ZNF26P17031 533 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
CS-212ENST00000548567 BMXP51813 675 aa6.73□□□□□ -1.33
CS-212ENST00000548567 STX1BP61266 288 aa6.73□□□□□ -1.33
CS-212ENST00000548567 CBLBQ13191 982 aa6.73□□□□□ -1.33
CS-212ENST00000548567 HIKESHIQ53FT3 197 aa6.73□□□□□ -1.33
CS-212ENST00000548567 DMRTC1Q5HYR2 192 aa6.73□□□□□ -1.33
CS-212ENST00000548567 MRPL2Q5T653 305 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
CS-212ENST00000548567 KRT80Q6KB66 452 aa6.73□□□□□ -1.33
CS-212ENST00000548567 C16orf89Q6UX73 402 aa6.73□□□□□ -1.33
CS-212ENST00000548567 SERPINA11Q86U17 422 aa6.73□□□□□ -1.33
CS-212ENST00000548567 IGFN1Q86VF2 1251 aa6.73□□□□□ -1.33
CS-212ENST00000548567 ACBD4Q8NC06 268 aa6.73□□□□□ -1.33
CS-212ENST00000548567 STARD4Q96DR4 205 aa6.73□□□□□ -1.33
CS-212ENST00000548567 MS4A4EQ96PG1 132 aa6.73□□□□□ -1.33
CS-212ENST00000548567 KCNS3Q9BQ31 491 aa6.73□□□□□ -1.33
CS-212ENST00000548567 TPT1P8Q9HAU6 139 aa6.73□□□□□ -1.33
CS-212ENST00000548567 TCF7L2Q9NQB0 619 aa6.73□□□□□ -1.33
CS-212ENST00000548567 MED29Q9NX70 200 aa6.73□□□□□ -1.33
CS-212ENST00000548567 MCTS1Q9ULC4 181 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
CS-212ENST00000548567 SNX13Q9Y5W8 968 aa6.73□□□□□ -1.33
CS-212ENST00000548567 CPSF4LA6NMK7 179 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
CS-212ENST00000548567 BCKDKO14874 412 aa6.72□□□□□ -1.33
CS-212ENST00000548567 RGS13O14921 159 aa6.72□□□□□ -1.33
CS-212ENST00000548567 GPRIN2O60269 458 aa6.72□□□□□ -1.33
CS-212ENST00000548567 SLC22A3O75751 556 aa6.72□□□□□ -1.33
CS-212ENST00000548567 UGT2B17O75795 530 aa6.72□□□□□ -1.33
CS-212ENST00000548567 EPPINO95925 133 aa6.72□□□□□ -1.33
CS-212ENST00000548567 CHRM4P08173 479 aa6.72□□□□□ -1.33
CS-212ENST00000548567 PSMD4P55036 377 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
CS-212ENST00000548567 ATP5J2P56134 94 aa6.72□□□□□ -1.33
CS-212ENST00000548567 KCNJ10P78508 379 aa6.72□□□□□ -1.33
CS-212ENST00000548567 IGLV3-21P80748 117 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
CS-212ENST00000548567 CYP51A1Q16850 503 aa6.72□□□□□ -1.33
CS-212ENST00000548567 FAM209AQ5JX71 171 aa6.72□□□□□ -1.33
CS-212ENST00000548567 TMEM211Q6ICI0 200 aa6.72□□□□□ -1.33
CS-212ENST00000548567 OR2L13Q8N349 312 aa6.72□□□□□ -1.33
CS-212ENST00000548567 PIWIL2Q8TC59 973 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
CS-212ENST00000548567 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP6.72□□□□□ -1.33
CS-212ENST00000548567 ROPN1LQ96C74 230 aa6.72□□□□□ -1.33
CS-212ENST00000548567 ZNF837Q96EG3 531 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
CS-212ENST00000548567 C1GALT1C1Q96EU7 318 aa6.72□□□□□ -1.33
CS-212ENST00000548567 MS4A3Q96HJ5 214 aa6.72□□□□□ -1.33
CS-212ENST00000548567 PELOQ9BRX2 385 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
CS-212ENST00000548567 ACTRT3Q9BYD9 372 aa6.72□□□□□ -1.33
CS-212ENST00000548567 ANKRD60Q9BZ19 345 aa6.72□□□□□ -1.33
CS-212ENST00000548567 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
CS-212ENST00000548567 ENKD1Q9H0I2 346 aa6.72□□□□□ -1.33
CS-212ENST00000548567 TGP01266 2768 aa6.72□□□□□ -1.33
CS-212ENST00000548567 RNF223E7ERA6 249 aa6.72□□□□□ -1.33
CS-212ENST00000548567 H3BMQ9 156 aa6.72□□□□□ -1.33
CS-212ENST00000548567 BLOC1S5-TXNDC5H3BN57 136 aa6.72□□□□□ -1.33
CS-212ENST00000548567 HDAC3O15379 428 aa6.72□□□□□ -1.33
CS-212ENST00000548567 ZNF264O43296 627 aa6.72□□□□□ -1.33
CS-212ENST00000548567 SUSD5O60279 629 aa6.72□□□□□ -1.33
CS-212ENST00000548567 WDR1O75083 606 aa6.72□□□□□ -1.33
CS-212ENST00000548567 CTAG2O75638 210 aa6.72□□□□□ -1.33
CS-212ENST00000548567 UBL4AP11441 157 aa6.72□□□□□ -1.33
CS-212ENST00000548567 GABRA1P14867 456 aa6.72□□□□□ -1.33
CS-212ENST00000548567 PRPS1L1P21108 318 aa6.72□□□□□ -1.33
CS-212ENST00000548567 CTSSP25774 331 aa6.72□□□□□ -1.33
CS-212ENST00000548567 NTF4P34130 210 aa6.72□□□□□ -1.33
CS-212ENST00000548567 CENPAP49450 140 aa6.72□□□□□ -1.33
CS-212ENST00000548567 DIO1P49895 249 aa6.72□□□□□ -1.33
CS-212ENST00000548567 PNLIPRP2P54317 469 aa6.72□□□□□ -1.33
CS-212ENST00000548567 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
CS-212ENST00000548567 E2F2Q14209 437 aa6.72□□□□□ -1.33
CS-212ENST00000548567 SELPLGQ14242 412 aa6.72□□□□□ -1.33
CS-212ENST00000548567 FLOT2Q14254 428 aa6.72□□□□□ -1.33
CS-212ENST00000548567 TAB1Q15750 504 aa6.72□□□□□ -1.33
CS-212ENST00000548567 GGTA1PQ4G0N0 100 aa6.72□□□□□ -1.33
CS-212ENST00000548567 VASH1Q7L8A9 365 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
CS-212ENST00000548567 DMRTC2Q8IXT2 367 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
CS-212ENST00000548567 CLDN22Q8N7P3 220 aa6.72□□□□□ -1.33
CS-212ENST00000548567 ZNF441Q8N8Z8 693 aa6.72□□□□□ -1.33
CS-212ENST00000548567 OR10A6Q8NH74 314 aa6.72□□□□□ -1.33
CS-212ENST00000548567 ISL2Q96A47 359 aa6.72□□□□□ -1.33
CS-212ENST00000548567 Q96MF0 132 aa6.72□□□□□ -1.33
CS-212ENST00000548567 COG8Q96MW5 612 aa6.72□□□□□ -1.33
CS-212ENST00000548567 MOV10Q9HCE1 1003 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
CS-212ENST00000548567 UPB1Q9UBR1 384 aa6.72□□□□□ -1.33
CS-212ENST00000548567 MOKQ9UQ07 419 aa6.72□□□□□ -1.33
CS-212ENST00000548567 PCDHB14Q9Y5E9 798 aa6.72□□□□□ -1.33
CS-212ENST00000548567 GIMAP1-GIMAP5A0A087WTJ2 511 aa6.71□□□□□ -1.33
CS-212ENST00000548567 A0A1W2PNV4 684 aa6.71□□□□□ -1.33
CS-212ENST00000548567 C7orf72A4D263 438 aa6.71□□□□□ -1.33
CS-212ENST00000548567 CENPBD1B2RD01 187 aa6.71□□□□□ -1.33
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