RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540445.5

LMO3-222, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene LMO3, Length 906 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-222ENST00000540445 RGNQ15493 299 aa7.96□□□□□ -1.14
LMO3-222ENST00000540445 OR7A5Q15622 319 aa7.96□□□□□ -1.14
LMO3-222ENST00000540445 MAPK11Q15759 364 aa7.96□□□□□ -1.14
LMO3-222ENST00000540445 ZSWIM7Q19AV6 140 aa7.96□□□□□ -1.14
LMO3-222ENST00000540445 TIMM23BQ5SRD1 257 aa7.96□□□□□ -1.14
LMO3-222ENST00000540445 OTUD3Q5T2D3 398 aaPredicted RBP7.96□□□□□ -1.14
LMO3-222ENST00000540445 ABLIM2Q6H8Q1 611 aa7.96□□□□□ -1.14
LMO3-222ENST00000540445 PRSS57Q6UWY2 283 aa7.96□□□□□ -1.14
LMO3-222ENST00000540445 CLEC9AQ6UXN8 241 aa7.96□□□□□ -1.14
LMO3-222ENST00000540445 CASP12Q6UXS9 341 aa7.96□□□□□ -1.14
LMO3-222ENST00000540445 HDXQ7Z353 690 aa7.96□□□□□ -1.14
LMO3-222ENST00000540445 GPAT4Q86UL3 456 aa7.96□□□□□ -1.14
LMO3-222ENST00000540445 P2RY8Q86VZ1 359 aa7.96□□□□□ -1.14
LMO3-222ENST00000540445 CLIP4Q8N3C7 705 aa7.96□□□□□ -1.14
LMO3-222ENST00000540445 ZNF433Q8N7K0 673 aaPredicted RBP7.96□□□□□ -1.14
LMO3-222ENST00000540445 OR52N5Q8NH56 324 aa7.96□□□□□ -1.14
LMO3-222ENST00000540445 GTF2H4Q92759 462 aa7.96□□□□□ -1.14
LMO3-222ENST00000540445 MAL2Q969L2 176 aa7.96□□□□□ -1.14
LMO3-222ENST00000540445 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP7.96□□□□□ -1.14
LMO3-222ENST00000540445 TRMT61AQ96FX7 289 aaKnown RBP7.96□□□□□ -1.14
LMO3-222ENST00000540445 EBF4Q9BQW3 602 aa7.96□□□□□ -1.14
LMO3-222ENST00000540445 TMEM204Q9BSN7 226 aa7.96□□□□□ -1.14
LMO3-222ENST00000540445 TAPBPLQ9BX59 468 aa7.96□□□□□ -1.14
LMO3-222ENST00000540445 PAIP1Q9H074 479 aaKnown RBP7.96□□□□□ -1.14
LMO3-222ENST00000540445 INTS9Q9NV88 658 aaKnown RBP7.96□□□□□ -1.14
LMO3-222ENST00000540445 ADPRHL2Q9NX46 363 aa7.96□□□□□ -1.14
LMO3-222ENST00000540445 ZNF443Q9Y2A4 671 aaPredicted RBP7.96□□□□□ -1.14
LMO3-222ENST00000540445 YLPM1P49750 1951 aaKnown RBP7.95□□□□□ -1.14
LMO3-222ENST00000540445 A0A096LPI6 279 aa7.95□□□□□ -1.14
LMO3-222ENST00000540445 A0A1W2PP18 115 aa7.95□□□□□ -1.14
LMO3-222ENST00000540445 A0A1W2PR80 420 aa7.95□□□□□ -1.14
LMO3-222ENST00000540445 OR5H1A6NKK0 313 aa7.95□□□□□ -1.14
LMO3-222ENST00000540445 A8MVM7 634 aa7.95□□□□□ -1.14
LMO3-222ENST00000540445 FAM171A2A8MVW0 826 aa7.95□□□□□ -1.14
LMO3-222ENST00000540445 H7C1Q1 480 aa7.95□□□□□ -1.14
LMO3-222ENST00000540445 NR5A2O00482 541 aa7.95□□□□□ -1.14
LMO3-222ENST00000540445 KRT33AO76009 404 aa7.95□□□□□ -1.14
LMO3-222ENST00000540445 THBS1P07996 1170 aa7.95□□□□□ -1.14
LMO3-222ENST00000540445 NUDT7P0C024 238 aa7.95□□□□□ -1.14
LMO3-222ENST00000540445 CDH2P19022 906 aaPredicted RBP7.95□□□□□ -1.14
LMO3-222ENST00000540445 NTF4P34130 210 aa7.95□□□□□ -1.14
LMO3-222ENST00000540445 IDUAP35475 653 aa7.95□□□□□ -1.14
LMO3-222ENST00000540445 SLC16A1P53985 500 aa7.95□□□□□ -1.14
LMO3-222ENST00000540445 RPS4XP62701 263 aaKnown RBP7.95□□□□□ -1.14
LMO3-222ENST00000540445 H3F3AP84243 136 aa7.95□□□□□ -1.14
LMO3-222ENST00000540445 LTBQ06643 244 aa7.95□□□□□ -1.14
LMO3-222ENST00000540445 FADDQ13158 208 aa7.95□□□□□ -1.14
LMO3-222ENST00000540445 ZNF672Q499Z4 452 aaPredicted RBP7.95□□□□□ -1.14
LMO3-222ENST00000540445 AGKQ53H12 422 aa7.95□□□□□ -1.14
LMO3-222ENST00000540445 TTMPQ5BVD1 217 aa7.95□□□□□ -1.14
LMO3-222ENST00000540445 C9orf135Q5VTT2 229 aa7.95□□□□□ -1.14
LMO3-222ENST00000540445 OR7E24Q6IFN5 339 aa7.95□□□□□ -1.14
LMO3-222ENST00000540445 ADAM5Q6NVV9 412 aa7.95□□□□□ -1.14
LMO3-222ENST00000540445 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa7.95□□□□□ -1.14
LMO3-222ENST00000540445 KLHL17Q6TDP4 642 aa7.95□□□□□ -1.14
LMO3-222ENST00000540445 SSX8Q7RTT4 187 aa7.95□□□□□ -1.14
LMO3-222ENST00000540445 AAED1Q7RTV5 226 aa7.95□□□□□ -1.14
LMO3-222ENST00000540445 ATG4DQ86TL0 474 aaPredicted RBP7.95□□□□□ -1.14
LMO3-222ENST00000540445 LSRQ86X29 649 aaPredicted RBP7.95□□□□□ -1.14
LMO3-222ENST00000540445 DEPDC4Q8N2C3 294 aa7.95□□□□□ -1.14
LMO3-222ENST00000540445 CIARTQ8N365 385 aaPredicted RBP7.95□□□□□ -1.14
LMO3-222ENST00000540445 TMEM99Q8N816 258 aa7.95□□□□□ -1.14
LMO3-222ENST00000540445 LILRB1Q8NHL6 650 aaPredicted RBP7.95□□□□□ -1.14
LMO3-222ENST00000540445 SMAP2Q8WU79 429 aaPredicted RBP7.95□□□□□ -1.14
LMO3-222ENST00000540445 NEUROG1Q92886 237 aa7.95□□□□□ -1.14
LMO3-222ENST00000540445 SPDL1Q96EA4 605 aa7.95□□□□□ -1.14
LMO3-222ENST00000540445 THOC1Q96FV9 657 aaKnown RBP7.95□□□□□ -1.14
LMO3-222ENST00000540445 COX4I2Q96KJ9 171 aa7.95□□□□□ -1.14
LMO3-222ENST00000540445 CCDC28BQ9BUN5 200 aa7.95□□□□□ -1.14
LMO3-222ENST00000540445 SPATA9Q9BWV2 254 aa7.95□□□□□ -1.14
LMO3-222ENST00000540445 C1QTNF6Q9BXI9 259 aa7.95□□□□□ -1.14
LMO3-222ENST00000540445 GSX2Q9BZM3 304 aa7.95□□□□□ -1.14
LMO3-222ENST00000540445 ALG2Q9H553 416 aa7.95□□□□□ -1.14
LMO3-222ENST00000540445 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP7.95□□□□□ -1.14
LMO3-222ENST00000540445 TAS2R16Q9NYV7 291 aa7.95□□□□□ -1.14
LMO3-222ENST00000540445 CISD1Q9NZ45 108 aaKnown RBP7.95□□□□□ -1.14
LMO3-222ENST00000540445 SLAMF8Q9P0V8 285 aa7.95□□□□□ -1.14
LMO3-222ENST00000540445 RPS6KB2Q9UBS0 482 aa7.95□□□□□ -1.14
LMO3-222ENST00000540445 PRDM4Q9UKN5 801 aa7.95□□□□□ -1.14
LMO3-222ENST00000540445 SLC9A8Q9Y2E8 581 aa7.95□□□□□ -1.14
LMO3-222ENST00000540445 TLN2Q9Y4G6 2542 aa7.94□□□□□ -1.14
LMO3-222ENST00000540445 TRIM64A6NGJ6 449 aa7.94□□□□□ -1.14
LMO3-222ENST00000540445 TRIM64BA6NI03 449 aa7.94□□□□□ -1.14
LMO3-222ENST00000540445 LIPT2A6NK58 231 aa7.94□□□□□ -1.14
LMO3-222ENST00000540445 ELOA3DA6NLF2 546 aaPredicted RBP7.94□□□□□ -1.14
LMO3-222ENST00000540445 EVPLLA8MZ36 301 aa7.94□□□□□ -1.14
LMO3-222ENST00000540445 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP7.94□□□□□ -1.14
LMO3-222ENST00000540445 M0R1B8 84 aa7.94□□□□□ -1.14
LMO3-222ENST00000540445 ABCD4O14678 606 aa7.94□□□□□ -1.14
LMO3-222ENST00000540445 FRS3O43559 492 aa7.94□□□□□ -1.14
LMO3-222ENST00000540445 PGM3O95394 542 aa7.94□□□□□ -1.14
LMO3-222ENST00000540445 PRG2P13727 222 aa7.94□□□□□ -1.14
LMO3-222ENST00000540445 PAX1P15863 534 aa7.94□□□□□ -1.14
LMO3-222ENST00000540445 COX5AP20674 150 aa7.94□□□□□ -1.14
LMO3-222ENST00000540445 PPIBP23284 216 aaKnown RBP7.94□□□□□ -1.14
LMO3-222ENST00000540445 ZNF83P51522 516 aa7.94□□□□□ -1.14
LMO3-222ENST00000540445 HOXC5Q00444 222 aa7.94□□□□□ -1.14
LMO3-222ENST00000540445 TGFBR3Q03167 851 aa7.94□□□□□ -1.14
LMO3-222ENST00000540445 SLC17A1Q14916 467 aa7.94□□□□□ -1.14
LMO3-222ENST00000540445 GABRA6Q16445 453 aa7.94□□□□□ -1.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.8 ms