RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520348.5

SNHG6-201, Transcript of small nucleolar RNA host gene 6, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SNHG6, Length 648 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG6-201ENST00000520348 TUBA3CQ13748 450 aa14.54□□□□□ -0.08
SNHG6-201ENST00000520348 ACER2Q5QJU3 275 aa14.54□□□□□ -0.08
SNHG6-201ENST00000520348 ZNF468Q5VIY5 522 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
SNHG6-201ENST00000520348 ARHGAP11AQ6P4F7 1023 aa14.54□□□□□ -0.08
SNHG6-201ENST00000520348 IL20RBQ6UXL0 311 aa14.54□□□□□ -0.08
SNHG6-201ENST00000520348 DPY19L2P2Q6ZN68 376 aa14.54□□□□□ -0.08
SNHG6-201ENST00000520348 LRRC17Q8N6Y2 441 aa14.54□□□□□ -0.08
SNHG6-201ENST00000520348 OR13F1Q8NGS4 319 aa14.54□□□□□ -0.08
SNHG6-201ENST00000520348 OR51A7Q8NH64 312 aa14.54□□□□□ -0.08
SNHG6-201ENST00000520348 POC1BQ8TC44 478 aa14.54□□□□□ -0.08
SNHG6-201ENST00000520348 TMIGD2Q96BF3 282 aa14.54□□□□□ -0.08
SNHG6-201ENST00000520348 C1GALT1C1Q96EU7 318 aa14.54□□□□□ -0.08
SNHG6-201ENST00000520348 TMEM41AQ96HV5 264 aa14.54□□□□□ -0.08
SNHG6-201ENST00000520348 MOGAT1Q96PD6 335 aa14.54□□□□□ -0.08
SNHG6-201ENST00000520348 GPN2Q9H9Y4 310 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
SNHG6-201ENST00000520348 NRIP3Q9NQ35 241 aa14.54□□□□□ -0.08
SNHG6-201ENST00000520348 GPR83Q9NYM4 423 aa14.54□□□□□ -0.08
SNHG6-201ENST00000520348 MED11Q9P086 117 aa14.54□□□□□ -0.08
SNHG6-201ENST00000520348 CEPT1Q9Y6K0 416 aa14.54□□□□□ -0.08
SNHG6-201ENST00000520348 A0A087WZY1 265 aa14.53□□□□□ -0.08
SNHG6-201ENST00000520348 C2orf72A6NCS6 295 aa14.53□□□□□ -0.08
SNHG6-201ENST00000520348 IDH3BO43837 385 aa14.53□□□□□ -0.08
SNHG6-201ENST00000520348 ADH6P28332 368 aa14.53□□□□□ -0.08
SNHG6-201ENST00000520348 SOX8P57073 446 aa14.53□□□□□ -0.08
SNHG6-201ENST00000520348 FOXF1Q12946 379 aa14.53□□□□□ -0.08
SNHG6-201ENST00000520348 AIMP2Q13155 320 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
SNHG6-201ENST00000520348 RAB39AQ14964 217 aa14.53□□□□□ -0.08
SNHG6-201ENST00000520348 FAM69AQ5T7M9 428 aa14.53□□□□□ -0.08
SNHG6-201ENST00000520348 SYT6Q5T7P8 510 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
SNHG6-201ENST00000520348 UBE2UQ5VVX9 321 aa14.53□□□□□ -0.08
SNHG6-201ENST00000520348 NXNL2Q5VZ03 156 aa14.53□□□□□ -0.08
SNHG6-201ENST00000520348 SLC22A10Q63ZE4 541 aa14.53□□□□□ -0.08
SNHG6-201ENST00000520348 B3GNTL1Q67FW5 361 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
SNHG6-201ENST00000520348 ARSKQ6UWY0 536 aa14.53□□□□□ -0.08
SNHG6-201ENST00000520348 ZNF227Q86WZ6 799 aa14.53□□□□□ -0.08
SNHG6-201ENST00000520348 PLCZ1Q86YW0 608 aa14.53□□□□□ -0.08
SNHG6-201ENST00000520348 TMEM156Q8N614 296 aa14.53□□□□□ -0.08
SNHG6-201ENST00000520348 IL22RA1Q8N6P7 574 aa14.53□□□□□ -0.08
SNHG6-201ENST00000520348 ANKK1Q8NFD2 765 aa14.53□□□□□ -0.08
SNHG6-201ENST00000520348 C9orf43Q8TAL5 461 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
SNHG6-201ENST00000520348 FCGR1BQ92637 280 aa14.53□□□□□ -0.08
SNHG6-201ENST00000520348 TAAR8Q969N4 342 aa14.53□□□□□ -0.08
SNHG6-201ENST00000520348 KIAA1143Q96AT1 154 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
SNHG6-201ENST00000520348 IFT27Q9BW83 186 aa14.53□□□□□ -0.08
SNHG6-201ENST00000520348 AMBNQ9NP70 447 aa14.53□□□□□ -0.08
SNHG6-201ENST00000520348 ACOT13Q9NPJ3 140 aa14.53□□□□□ -0.08
SNHG6-201ENST00000520348 HINT3Q9NQE9 182 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
SNHG6-201ENST00000520348 IL20RAQ9UHF4 553 aa14.53□□□□□ -0.08
SNHG6-201ENST00000520348 SLC6A5Q9Y345 797 aa14.53□□□□□ -0.08
SNHG6-201ENST00000520348 ZC3H12DA2A288 527 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
SNHG6-201ENST00000520348 MCIDASD6RGH6 385 aa14.52□□□□□ -0.09
SNHG6-201ENST00000520348 FTCDNL1E5RQL4 147 aa14.52□□□□□ -0.09
SNHG6-201ENST00000520348 ZNF701M0R085 212 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
SNHG6-201ENST00000520348 IMPA2O14732 288 aa14.52□□□□□ -0.09
SNHG6-201ENST00000520348 TRIM3O75382 744 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
SNHG6-201ENST00000520348 SNX4O95219 450 aa14.52□□□□□ -0.09
SNHG6-201ENST00000520348 SLC2A10O95528 541 aa14.52□□□□□ -0.09
SNHG6-201ENST00000520348 PPP1R3DO95685 299 aa14.52□□□□□ -0.09
SNHG6-201ENST00000520348 TXNDC12O95881 172 aa14.52□□□□□ -0.09
SNHG6-201ENST00000520348 ADRA2AP08913 450 aa14.52□□□□□ -0.09
SNHG6-201ENST00000520348 LIFP15018 202 aa14.52□□□□□ -0.09
SNHG6-201ENST00000520348 ST3GAL4Q11206 333 aa14.52□□□□□ -0.09
SNHG6-201ENST00000520348 TMED1Q13445 227 aa14.52□□□□□ -0.09
SNHG6-201ENST00000520348 NEDD8Q15843 81 aa14.52□□□□□ -0.09
SNHG6-201ENST00000520348 C1orf140Q5VVS0 124 aa14.52□□□□□ -0.09
SNHG6-201ENST00000520348 OR5M10Q6IEU7 315 aa14.52□□□□□ -0.09
SNHG6-201ENST00000520348 BCDIN3DQ7Z5W3 292 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
SNHG6-201ENST00000520348 GPR141Q7Z602 305 aa14.52□□□□□ -0.09
SNHG6-201ENST00000520348 THOC3Q96J01 351 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
SNHG6-201ENST00000520348 FER1L6-AS2Q96M78 137 aa14.52□□□□□ -0.09
SNHG6-201ENST00000520348 DDOQ99489 341 aa14.52□□□□□ -0.09
SNHG6-201ENST00000520348 NPAS1Q99742 590 aa14.52□□□□□ -0.09
SNHG6-201ENST00000520348 POTEKPQ9BYX7 375 aa14.52□□□□□ -0.09
SNHG6-201ENST00000520348 FGF20Q9NP95 211 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
SNHG6-201ENST00000520348 NANSQ9NR45 359 aa14.52□□□□□ -0.09
SNHG6-201ENST00000520348 FBXL2Q9UKC9 423 aa14.52□□□□□ -0.09
SNHG6-201ENST00000520348 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP14.52□□□□□ -0.09
SNHG6-201ENST00000520348 GPR52Q9Y2T5 361 aa14.52□□□□□ -0.09
SNHG6-201ENST00000520348 PCNX3Q9H6A9 2034 aa14.52□□□□□ -0.09
SNHG6-201ENST00000520348 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
SNHG6-201ENST00000520348 IRGMA1A4Y4 181 aa14.51□□□□□ -0.09
SNHG6-201ENST00000520348 SNTNA6NMZ2 147 aa14.51□□□□□ -0.09
SNHG6-201ENST00000520348 OR2T1O43869 369 aa14.51□□□□□ -0.09
SNHG6-201ENST00000520348 GMFGO60234 142 aa14.51□□□□□ -0.09
SNHG6-201ENST00000520348 SLC25A12O75746 678 aa14.51□□□□□ -0.09
SNHG6-201ENST00000520348 STSP08842 583 aa14.51□□□□□ -0.09
SNHG6-201ENST00000520348 C21orf33P30042 268 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
SNHG6-201ENST00000520348 HTR1FP30939 366 aa14.51□□□□□ -0.09
SNHG6-201ENST00000520348 EIF1P41567 113 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
SNHG6-201ENST00000520348 ZNF41P51814 821 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
SNHG6-201ENST00000520348 GP2P55259 537 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
SNHG6-201ENST00000520348 INPP5JQ15735 1006 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
SNHG6-201ENST00000520348 SGCBQ16585 318 aa14.51□□□□□ -0.09
SNHG6-201ENST00000520348 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
SNHG6-201ENST00000520348 PRAMEF20Q5VT98 475 aa14.51□□□□□ -0.09
SNHG6-201ENST00000520348 NIPAL3Q6P499 406 aa14.51□□□□□ -0.09
SNHG6-201ENST00000520348 FAM122BQ7Z309 247 aa14.51□□□□□ -0.09
SNHG6-201ENST00000520348 GID4Q8IVV7 300 aa14.51□□□□□ -0.09
SNHG6-201ENST00000520348 BEST3Q8N1M1 668 aa14.51□□□□□ -0.09
SNHG6-201ENST00000520348 SIRT6Q8N6T7 355 aa14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.7 ms