RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503687.2

RABGEF1-211, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2

Gene RABGEF1, Length 4,139 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-211ENST00000503687 C1orf53Q5VUE5 145 aa11.81□□□□□ -0.52
RABGEF1-211ENST00000503687 NKAIN2Q5VXU1 208 aa11.81□□□□□ -0.52
RABGEF1-211ENST00000503687 OLFML2AQ68BL7 652 aa11.81□□□□□ -0.52
RABGEF1-211ENST00000503687 SLC29A4Q7RTT9 530 aa11.81□□□□□ -0.52
RABGEF1-211ENST00000503687 OR6F1Q8NGZ6 308 aa11.81□□□□□ -0.52
RABGEF1-211ENST00000503687 ZMAT3Q9HA38 289 aaKnown RBP11.81□□□□□ -0.52
RABGEF1-211ENST00000503687 SLC25A19Q9HC21 320 aa11.81□□□□□ -0.52
RABGEF1-211ENST00000503687 LHX9Q9NQ69 397 aa11.81□□□□□ -0.52
RABGEF1-211ENST00000503687 ACOXLQ9NUZ1 547 aa11.81□□□□□ -0.52
RABGEF1-211ENST00000503687 MED12Q93074 2177 aa11.81□□□□□ -0.52
RABGEF1-211ENST00000503687 CACNA1EQ15878 2313 aa11.81□□□□□ -0.52
RABGEF1-211ENST00000503687 H3BML4 177 aa11.81□□□□□ -0.52
RABGEF1-211ENST00000503687 DVL2O14641 736 aa11.81□□□□□ -0.52
RABGEF1-211ENST00000503687 KRT33AO76009 404 aa11.81□□□□□ -0.52
RABGEF1-211ENST00000503687 EIF4EP06730 217 aaKnown RBP11.81□□□□□ -0.52
RABGEF1-211ENST00000503687 GABRB1P18505 474 aa11.81□□□□□ -0.52
RABGEF1-211ENST00000503687 DGCR2P98153 550 aa11.81□□□□□ -0.52
RABGEF1-211ENST00000503687 KLHL24Q6TFL4 600 aa11.81□□□□□ -0.52
RABGEF1-211ENST00000503687 NUP54Q7Z3B4 507 aa11.81□□□□□ -0.52
RABGEF1-211ENST00000503687 PAQR7Q86WK9 346 aa11.81□□□□□ -0.52
RABGEF1-211ENST00000503687 FBLIM1Q8WUP2 373 aa11.81□□□□□ -0.52
RABGEF1-211ENST00000503687 MRGPRX1Q96LB2 322 aa11.81□□□□□ -0.52
RABGEF1-211ENST00000503687 SNX18Q96RF0 628 aa11.81□□□□□ -0.52
RABGEF1-211ENST00000503687 PRODH2Q9UF12 536 aa11.81□□□□□ -0.52
RABGEF1-211ENST00000503687 CD207Q9UJ71 328 aa11.81□□□□□ -0.52
RABGEF1-211ENST00000503687 KCND3Q9UK17 655 aa11.81□□□□□ -0.52
RABGEF1-211ENST00000503687 CBLCQ9ULV8 474 aa11.81□□□□□ -0.52
RABGEF1-211ENST00000503687 VDAC3Q9Y277 283 aa11.81□□□□□ -0.52
RABGEF1-211ENST00000503687 ASXL3Q9C0F0 2248 aa11.81□□□□□ -0.52
RABGEF1-211ENST00000503687 ARRDC5A6NEK1 342 aa11.8□□□□□ -0.52
RABGEF1-211ENST00000503687 SPINT1O43278 529 aa11.8□□□□□ -0.52
RABGEF1-211ENST00000503687 PRAMEF2O60811 474 aa11.8□□□□□ -0.52
RABGEF1-211ENST00000503687 SEMA7AO75326 666 aa11.8□□□□□ -0.52
RABGEF1-211ENST00000503687 AHSA1O95433 338 aa11.8□□□□□ -0.52
RABGEF1-211ENST00000503687 ALG11Q2TAA5 492 aa11.8□□□□□ -0.52
RABGEF1-211ENST00000503687 NIPAL3Q6P499 406 aa11.8□□□□□ -0.52
RABGEF1-211ENST00000503687 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa11.8□□□□□ -0.52
RABGEF1-211ENST00000503687 ZNF101Q8IZC7 436 aa11.8□□□□□ -0.52
RABGEF1-211ENST00000503687 LSM14AQ8ND56 463 aaKnown RBP11.8□□□□□ -0.52
RABGEF1-211ENST00000503687 OR5H6Q8NGV6 325 aa11.8□□□□□ -0.52
RABGEF1-211ENST00000503687 SYNPRQ8TBG9 265 aa11.8□□□□□ -0.52
RABGEF1-211ENST00000503687 ENKD1Q9H0I2 346 aa11.8□□□□□ -0.52
RABGEF1-211ENST00000503687 PLEKHB1Q9UF11 243 aaPredicted RBP11.8□□□□□ -0.52
RABGEF1-211ENST00000503687 C19orf53Q9UNZ5 99 aaPredicted RBP11.8□□□□□ -0.52
RABGEF1-211ENST00000503687 PATJQ8NI35 1801 aa11.8□□□□□ -0.52
RABGEF1-211ENST00000503687 OR5K4A6NMS3 321 aa11.8□□□□□ -0.52
RABGEF1-211ENST00000503687 UCHL1P09936 223 aa11.8□□□□□ -0.52
RABGEF1-211ENST00000503687 ATF4P18848 351 aaPredicted RBP11.8□□□□□ -0.52
RABGEF1-211ENST00000503687 TEKQ02763 1124 aa11.8□□□□□ -0.52
RABGEF1-211ENST00000503687 KCNAB1Q14722 419 aa11.8□□□□□ -0.52
RABGEF1-211ENST00000503687 KLHL26Q53HC5 615 aa11.8□□□□□ -0.52
RABGEF1-211ENST00000503687 OR52N1Q8NH53 320 aa11.8□□□□□ -0.52
RABGEF1-211ENST00000503687 METTL17Q9H7H0 456 aaPredicted RBP11.8□□□□□ -0.52
RABGEF1-211ENST00000503687 POM121CA8CG34 1229 aa11.8□□□□□ -0.52
RABGEF1-211ENST00000503687 ETV6P41212 452 aa11.8□□□□□ -0.52
RABGEF1-211ENST00000503687 ART1P52961 327 aa11.8□□□□□ -0.52
RABGEF1-211ENST00000503687 ZP2Q05996 745 aa11.8□□□□□ -0.52
RABGEF1-211ENST00000503687 ZNF79Q15937 498 aa11.8□□□□□ -0.52
RABGEF1-211ENST00000503687 DUSP6Q16828 381 aa11.8□□□□□ -0.52
RABGEF1-211ENST00000503687 APOOLQ6UXV4 268 aa11.8□□□□□ -0.52
RABGEF1-211ENST00000503687 MORN4Q8NDC4 146 aa11.8□□□□□ -0.52
RABGEF1-211ENST00000503687 TOR1AIP2Q8NFQ8 470 aa11.8□□□□□ -0.52
RABGEF1-211ENST00000503687 SLC6A18Q96N87 628 aa11.8□□□□□ -0.52
RABGEF1-211ENST00000503687 ALG12Q9BV10 488 aa11.8□□□□□ -0.52
RABGEF1-211ENST00000503687 IL20Q9NYY1 176 aa11.8□□□□□ -0.52
RABGEF1-211ENST00000503687 SLC6A5Q9Y345 797 aa11.8□□□□□ -0.52
RABGEF1-211ENST00000503687 IFNA7P01567 189 aa11.79□□□□□ -0.52
RABGEF1-211ENST00000503687 ALDOBP05062 364 aa11.79□□□□□ -0.52
RABGEF1-211ENST00000503687 ARRB1P49407 418 aaPredicted RBP11.79□□□□□ -0.52
RABGEF1-211ENST00000503687 EMDP50402 254 aa11.79□□□□□ -0.52
RABGEF1-211ENST00000503687 ASAH1Q13510 395 aa11.79□□□□□ -0.52
RABGEF1-211ENST00000503687 NKPD1Q17RQ9 610 aa11.79□□□□□ -0.52
RABGEF1-211ENST00000503687 CARD17Q5XLA6 110 aa11.79□□□□□ -0.52
RABGEF1-211ENST00000503687 OR7E24Q6IFN5 339 aa11.79□□□□□ -0.52
RABGEF1-211ENST00000503687 MED25Q71SY5 747 aa11.79□□□□□ -0.52
RABGEF1-211ENST00000503687 VASH1Q7L8A9 365 aaPredicted RBP11.79□□□□□ -0.52
RABGEF1-211ENST00000503687 ZNF227Q86WZ6 799 aa11.79□□□□□ -0.52
RABGEF1-211ENST00000503687 FOXRED2Q8IWF2 684 aa11.79□□□□□ -0.52
RABGEF1-211ENST00000503687 ARMC10Q8N2F6 343 aa11.79□□□□□ -0.52
RABGEF1-211ENST00000503687 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP11.79□□□□□ -0.52
RABGEF1-211ENST00000503687 GIMAP1Q8WWP7 306 aa11.79□□□□□ -0.52
RABGEF1-211ENST00000503687 DERL3Q96Q80 235 aa11.79□□□□□ -0.52
RABGEF1-211ENST00000503687 ARL6Q9H0F7 186 aa11.79□□□□□ -0.52
RABGEF1-211ENST00000503687 SYT4Q9H2B2 425 aa11.79□□□□□ -0.52
RABGEF1-211ENST00000503687 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP11.79□□□□□ -0.52
RABGEF1-211ENST00000503687 KLRF1Q9NZS2 232 aa11.79□□□□□ -0.52
RABGEF1-211ENST00000503687 TESQ9UGI8 421 aaKnown RBP11.79□□□□□ -0.52
RABGEF1-211ENST00000503687 PLEKHA6Q9Y2H5 1048 aa11.79□□□□□ -0.52
RABGEF1-211ENST00000503687 ENTPD2Q9Y5L3 495 aa11.79□□□□□ -0.52
RABGEF1-211ENST00000503687 PTPRDP23468 1912 aa11.79□□□□□ -0.52
RABGEF1-211ENST00000503687 LAMA3Q16787 3333 aa11.79□□□□□ -0.52
RABGEF1-211ENST00000503687 ANKRD34BA5PLL1 514 aa11.79□□□□□ -0.52
RABGEF1-211ENST00000503687 IDSB3KWA1 339 aa11.79□□□□□ -0.52
RABGEF1-211ENST00000503687 C4orf51C9J302 202 aa11.79□□□□□ -0.52
RABGEF1-211ENST00000503687 CFL1P23528 166 aaKnown RBP11.79□□□□□ -0.52
RABGEF1-211ENST00000503687 GDNFP39905 211 aa11.79□□□□□ -0.52
RABGEF1-211ENST00000503687 PRKXP51817 358 aa11.79□□□□□ -0.52
RABGEF1-211ENST00000503687 POU4F2Q12837 409 aa11.79□□□□□ -0.52
RABGEF1-211ENST00000503687 PCGF3Q3KNV8 242 aa11.79□□□□□ -0.52
RABGEF1-211ENST00000503687 ARHGAP11BQ3KRB8 267 aa11.79□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.2 ms