RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491292.5

ERCC3-208, Transcript of ERCC excision repair 3, TFIIH core complex helicase subunit, human

TSL 2

Gene ERCC3, Length 4,018 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ERCC3-208	ENST00000491292	UBE2I	P63279	158 aa	Known RBP	9.08	□□□□□ -0.96
ERCC3-208	ENST00000491292	BIK	Q13323	160 aa		9.08	□□□□□ -0.96
ERCC3-208	ENST00000491292	TMEM255A	Q5JRV8	349 aa		9.08	□□□□□ -0.96
ERCC3-208	ENST00000491292	UBE2NL	Q5JXB2	153 aa		9.08	□□□□□ -0.96
ERCC3-208	ENST00000491292	SDR16C5	Q8N3Y7	309 aa		9.08	□□□□□ -0.96
ERCC3-208	ENST00000491292	CLRN3	Q8NCR9	226 aa		9.08	□□□□□ -0.96
ERCC3-208	ENST00000491292	LCN9	Q8WX39	176 aa		9.08	□□□□□ -0.96
ERCC3-208	ENST00000491292	SLC35A4	Q96G79	324 aa		9.08	□□□□□ -0.96
ERCC3-208	ENST00000491292	CRB3	Q9BUF7	120 aa		9.08	□□□□□ -0.96
ERCC3-208	ENST00000491292	CPEB1	Q9BZB8	566 aa	Known RBP	9.08	□□□□□ -0.96
ERCC3-208	ENST00000491292	MTHFD2L	Q9H903	347 aa	Predicted RBP	9.08	□□□□□ -0.96
ERCC3-208	ENST00000491292	DPP7	Q9UHL4	492 aa		9.08	□□□□□ -0.96
ERCC3-208	ENST00000491292	ERVK-19	Q9WJR5	959 aa		9.08	□□□□□ -0.96
ERCC3-208	ENST00000491292	NPFFR2	Q9Y5X5	522 aa		9.08	□□□□□ -0.96
ERCC3-208	ENST00000491292	ADAMTS4	O75173	837 aa		9.08	□□□□□ -0.96
ERCC3-208	ENST00000491292	F12	P00748	615 aa	Predicted RBP	9.08	□□□□□ -0.96
ERCC3-208	ENST00000491292	HLA-DQB1	P01920	261 aa		9.08	□□□□□ -0.96
ERCC3-208	ENST00000491292	IFNGR1	P15260	489 aa		9.08	□□□□□ -0.96
ERCC3-208	ENST00000491292	NAGA	P17050	411 aa		9.08	□□□□□ -0.96
ERCC3-208	ENST00000491292	SYN1	P17600	705 aa		9.08	□□□□□ -0.96
ERCC3-208	ENST00000491292	BTC	P35070	178 aa		9.08	□□□□□ -0.96
ERCC3-208	ENST00000491292	MMP15	P51511	669 aa		9.08	□□□□□ -0.96
ERCC3-208	ENST00000491292	SGCG	Q13326	291 aa		9.08	□□□□□ -0.96
ERCC3-208	ENST00000491292	AMZ1	Q400G9	498 aa		9.08	□□□□□ -0.96
ERCC3-208	ENST00000491292	ALG10B	Q5I7T1	473 aa		9.08	□□□□□ -0.96
ERCC3-208	ENST00000491292	PLPP4	Q5VZY2	271 aa		9.08	□□□□□ -0.96
ERCC3-208	ENST00000491292	LCTL	Q6UWM7	567 aa		9.08	□□□□□ -0.96
ERCC3-208	ENST00000491292	KREMEN2	Q8NCW0	462 aa		9.08	□□□□□ -0.96
ERCC3-208	ENST00000491292	OR51Q1	Q8NH59	317 aa		9.08	□□□□□ -0.96
ERCC3-208	ENST00000491292	SMIM4	Q8WVI0	70 aa		9.08	□□□□□ -0.96
ERCC3-208	ENST00000491292	ZNF707	Q96C28	371 aa	Predicted RBP	9.08	□□□□□ -0.96
ERCC3-208	ENST00000491292	ZNF514	Q96K75	400 aa	Predicted RBP	9.08	□□□□□ -0.96
ERCC3-208	ENST00000491292	TSSK2	Q96PF2	358 aa		9.08	□□□□□ -0.96
ERCC3-208	ENST00000491292	SLC6A7	Q99884	636 aa		9.08	□□□□□ -0.96
ERCC3-208	ENST00000491292	CCDC3	Q9BQI4	270 aa		9.08	□□□□□ -0.96
ERCC3-208	ENST00000491292	SGPP1	Q9BX95	441 aa		9.08	□□□□□ -0.96
ERCC3-208	ENST00000491292	ZNF350	Q9GZX5	532 aa		9.08	□□□□□ -0.96
ERCC3-208	ENST00000491292	NRIP3	Q9NQ35	241 aa		9.08	□□□□□ -0.96
ERCC3-208	ENST00000491292	SPHK2	Q9NRA0	654 aa		9.08	□□□□□ -0.96
ERCC3-208	ENST00000491292	KIF25	Q9UIL4	384 aa		9.08	□□□□□ -0.96
ERCC3-208	ENST00000491292	ZNF346	Q9UL40	294 aa	Known RBP	9.08	□□□□□ -0.96
ERCC3-208	ENST00000491292	SLC35A3	Q9Y2D2	325 aa		9.08	□□□□□ -0.96
ERCC3-208	ENST00000491292	TDRD15	B5MCY1	1934 aa	Known RBP	9.08	□□□□□ -0.96
ERCC3-208	ENST00000491292		A0A1B0GTH9	108 aa		9.08	□□□□□ -0.96
ERCC3-208	ENST00000491292	TMEM72	A0PK05	275 aa		9.08	□□□□□ -0.96
ERCC3-208	ENST00000491292	IGLON5	A6NGN9	336 aa		9.08	□□□□□ -0.96
ERCC3-208	ENST00000491292	GPR31	O00270	319 aa		9.08	□□□□□ -0.96
ERCC3-208	ENST00000491292	AKR1C4	P17516	323 aa		9.08	□□□□□ -0.96
ERCC3-208	ENST00000491292	PSMA3	P25788	255 aa		9.08	□□□□□ -0.96
ERCC3-208	ENST00000491292	CCKBR	P32239	447 aa		9.08	□□□□□ -0.96
ERCC3-208	ENST00000491292	DLST	P36957	453 aa		9.08	□□□□□ -0.96
ERCC3-208	ENST00000491292	PGD	P52209	483 aa		9.08	□□□□□ -0.96
ERCC3-208	ENST00000491292	ETFDH	Q16134	617 aa		9.08	□□□□□ -0.96
ERCC3-208	ENST00000491292	KLHL26	Q53HC5	615 aa		9.08	□□□□□ -0.96
ERCC3-208	ENST00000491292	COMMD2	Q86X83	199 aa		9.08	□□□□□ -0.96
ERCC3-208	ENST00000491292	CBLN2	Q8IUK8	224 aa		9.08	□□□□□ -0.96
ERCC3-208	ENST00000491292	GTPBP8	Q8N3Z3	284 aa	Predicted RBP	9.08	□□□□□ -0.96
ERCC3-208	ENST00000491292	ZNF615	Q8N8J6	731 aa		9.08	□□□□□ -0.96
ERCC3-208	ENST00000491292	NANP	Q8TBE9	248 aa		9.08	□□□□□ -0.96
ERCC3-208	ENST00000491292	HHIP	Q96QV1	700 aa		9.08	□□□□□ -0.96
ERCC3-208	ENST00000491292	PELO	Q9BRX2	385 aa	Known RBP	9.08	□□□□□ -0.96
ERCC3-208	ENST00000491292	RSPO3	Q9BXY4	272 aa	Predicted RBP	9.08	□□□□□ -0.96
ERCC3-208	ENST00000491292	IL20	Q9NYY1	176 aa		9.08	□□□□□ -0.96
ERCC3-208	ENST00000491292	SPACA6	W5XKT8	324 aa		9.08	□□□□□ -0.96
ERCC3-208	ENST00000491292	SOD2	P04179	222 aa		9.08	□□□□□ -0.96
ERCC3-208	ENST00000491292	IFNA6	P05013	189 aa		9.08	□□□□□ -0.96
ERCC3-208	ENST00000491292	GIP	P09681	153 aa	Predicted RBP	9.08	□□□□□ -0.96
ERCC3-208	ENST00000491292	FAM157B	P0CG42	384 aa		9.08	□□□□□ -0.96
ERCC3-208	ENST00000491292	ACTC1	P68032	377 aa		9.08	□□□□□ -0.96
ERCC3-208	ENST00000491292	ACTA1	P68133	377 aa		9.08	□□□□□ -0.96
ERCC3-208	ENST00000491292	DUSP2	Q05923	314 aa		9.08	□□□□□ -0.96
ERCC3-208	ENST00000491292	RBM39	Q14498	530 aa	Known RBP	9.08	□□□□□ -0.96
ERCC3-208	ENST00000491292	DECR1	Q16698	335 aa		9.08	□□□□□ -0.96
ERCC3-208	ENST00000491292	PDSS1	Q5T2R2	415 aa		9.08	□□□□□ -0.96
ERCC3-208	ENST00000491292	SEZ6L2	Q6UXD5	910 aa		9.08	□□□□□ -0.96
ERCC3-208	ENST00000491292	ZNF793	Q6ZN11	406 aa		9.08	□□□□□ -0.96
ERCC3-208	ENST00000491292	ZNF227	Q86WZ6	799 aa		9.08	□□□□□ -0.96
ERCC3-208	ENST00000491292	ZC3H10	Q96K80	434 aa	Known RBP	9.08	□□□□□ -0.96
ERCC3-208	ENST00000491292	NPAS1	Q99742	590 aa		9.08	□□□□□ -0.96
ERCC3-208	ENST00000491292	GSKIP	Q9P0R6	139 aa		9.08	□□□□□ -0.96
ERCC3-208	ENST00000491292	GXYLT2	A0PJZ3	443 aa		9.07	□□□□□ -0.96
ERCC3-208	ENST00000491292	DCDC2B	A2VCK2	349 aa		9.07	□□□□□ -0.96
ERCC3-208	ENST00000491292	NPC1	O15118	1278 aa		9.07	□□□□□ -0.96
ERCC3-208	ENST00000491292	DCN	P07585	359 aa	Known RBP	9.07	□□□□□ -0.96
ERCC3-208	ENST00000491292	CTSL	P07711	333 aa		9.07	□□□□□ -0.96
ERCC3-208	ENST00000491292	AKR1C3	P42330	323 aa		9.07	□□□□□ -0.96
ERCC3-208	ENST00000491292	LTB	Q06643	244 aa		9.07	□□□□□ -0.96
ERCC3-208	ENST00000491292	OR7A5	Q15622	319 aa		9.07	□□□□□ -0.96
ERCC3-208	ENST00000491292	MPP7	Q5T2T1	576 aa		9.07	□□□□□ -0.96
ERCC3-208	ENST00000491292	LEG1	Q6P5S2	330 aa		9.07	□□□□□ -0.96
ERCC3-208	ENST00000491292	ZNF836	Q6ZNA1	936 aa		9.07	□□□□□ -0.96
ERCC3-208	ENST00000491292	CMIP	Q8IY22	773 aa		9.07	□□□□□ -0.96
ERCC3-208	ENST00000491292	BPIFC	Q8NFQ6	507 aa		9.07	□□□□□ -0.96
ERCC3-208	ENST00000491292	STEAP2	Q8NFT2	490 aa		9.07	□□□□□ -0.96
ERCC3-208	ENST00000491292	OR11G2	Q8NGC1	345 aa		9.07	□□□□□ -0.96
ERCC3-208	ENST00000491292	DIO2	Q92813	273 aa		9.07	□□□□□ -0.96
ERCC3-208	ENST00000491292	DTD2	Q96FN9	168 aa		9.07	□□□□□ -0.96
ERCC3-208	ENST00000491292	ZNF578	Q96N58	590 aa	Predicted RBP	9.07	□□□□□ -0.96
ERCC3-208	ENST00000491292	UQCC2	Q9BRT2	126 aa		9.07	□□□□□ -0.96
ERCC3-208	ENST00000491292	COMMD4	Q9H0A8	199 aa		9.07	□□□□□ -0.96

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