RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476806.5

RBM39-230, Transcript of RNA binding motif protein 39, humanhuman

TSL 5

Gene RBM39, Length 754 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39-230ENST00000476806 ISYNA1Q9NPH2 558 aa7.13□□□□□ -1.27
RBM39-230ENST00000476806 CMC2Q9NRP2 79 aa7.13□□□□□ -1.27
RBM39-230ENST00000476806 RASSF1Q9NS23 344 aa7.13□□□□□ -1.27
RBM39-230ENST00000476806 MRPS18AQ9NVS2 196 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
RBM39-230ENST00000476806 HPF1Q9NWY4 346 aa7.13□□□□□ -1.27
RBM39-230ENST00000476806 REV1Q9UBZ9 1251 aa7.13□□□□□ -1.27
RBM39-230ENST00000476806 DTX4Q9Y2E6 619 aa7.13□□□□□ -1.27
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RBM39-230ENST00000476806 WIF1Q9Y5W5 379 aa7.13□□□□□ -1.27
RBM39-230ENST00000476806 B3GALT1Q9Y5Z6 326 aa7.13□□□□□ -1.27
RBM39-230ENST00000476806 LAMA5O15230 3695 aa7.13□□□□□ -1.27
RBM39-230ENST00000476806 NINQ8N4C6 2090 aa7.13□□□□□ -1.27
RBM39-230ENST00000476806 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
RBM39-230ENST00000476806 ASXL3Q9C0F0 2248 aa7.12□□□□□ -1.27
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RBM39-230ENST00000476806 HSPB2A8KAH6 182 aa7.12□□□□□ -1.27
RBM39-230ENST00000476806 CYSRT1A8MQ03 144 aa7.12□□□□□ -1.27
RBM39-230ENST00000476806 PTGES3LE9PB15 166 aa7.12□□□□□ -1.27
RBM39-230ENST00000476806 PRR23D1E9PI22 279 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
RBM39-230ENST00000476806 ETV2O00321 342 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
RBM39-230ENST00000476806 AHCYL1O43865 530 aa7.12□□□□□ -1.27
RBM39-230ENST00000476806 SEMA7AO75326 666 aa7.12□□□□□ -1.27
RBM39-230ENST00000476806 KLF7O75840 302 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
RBM39-230ENST00000476806 OR7A10O76100 309 aa7.12□□□□□ -1.27
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RBM39-230ENST00000476806 SOX14O95416 240 aa7.12□□□□□ -1.27
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RBM39-230ENST00000476806 SERPINA7P05543 415 aa7.12□□□□□ -1.27
RBM39-230ENST00000476806 GKN3PP0CG01 181 aa7.12□□□□□ -1.27
RBM39-230ENST00000476806 PRR23D2P0DMB1 279 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
RBM39-230ENST00000476806 COX6A1P12074 109 aa7.12□□□□□ -1.27
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RBM39-230ENST00000476806 MTNR1AP48039 350 aa7.12□□□□□ -1.27
RBM39-230ENST00000476806 CDH11P55287 796 aa7.12□□□□□ -1.27
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RBM39-230ENST00000476806 DNASE1L3Q13609 305 aa7.12□□□□□ -1.27
RBM39-230ENST00000476806 SF3A2Q15428 464 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
RBM39-230ENST00000476806 HSPB2Q16082 182 aa7.12□□□□□ -1.27
RBM39-230ENST00000476806 NNATQ16517 81 aa7.12□□□□□ -1.27
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RBM39-230ENST00000476806 NADK2Q4G0N4 442 aa7.12□□□□□ -1.27
RBM39-230ENST00000476806 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
RBM39-230ENST00000476806 C3orf38Q5JPI3 329 aa7.12□□□□□ -1.27
RBM39-230ENST00000476806 SYT6Q5T7P8 510 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
RBM39-230ENST00000476806 STPG1Q5TH74 334 aa7.12□□□□□ -1.27
RBM39-230ENST00000476806 PRAMEF17Q5VTA0 474 aa7.12□□□□□ -1.27
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RBM39-230ENST00000476806 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
RBM39-230ENST00000476806 TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 330 aa7.11□□□□□ -1.27
RBM39-230ENST00000476806 NPIPA5A0A0B4J1W7 369 aa7.11□□□□□ -1.27
RBM39-230ENST00000476806 MYOCOSA0A1B0GUC4 107 aa7.11□□□□□ -1.27
RBM39-230ENST00000476806 TMEM129A0AVI4 362 aa7.11□□□□□ -1.27
RBM39-230ENST00000476806 A6NIZ1 184 aa7.11□□□□□ -1.27
RBM39-230ENST00000476806 CENPBD1B2RD01 187 aa7.11□□□□□ -1.27
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