RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000438120.5

PTPRF-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRF, Length 6,377 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-209ENST00000438120 CEPT1Q9Y6K0 416 aa15.97■□□□□ 0.15
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PTPRF-209ENST00000438120 RAB5BP61020 215 aa15.97■□□□□ 0.15
PTPRF-209ENST00000438120 RAB31Q13636 194 aa15.97■□□□□ 0.15
PTPRF-209ENST00000438120 PGM2L1Q6PCE3 622 aa15.97■□□□□ 0.15
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PTPRF-209ENST00000438120 ZBTB8AQ96BR9 441 aa15.97■□□□□ 0.15
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PTPRF-209ENST00000438120 VEGFCP49767 419 aa15.97■□□□□ 0.15
PTPRF-209ENST00000438120 BORAQ6PGQ7 559 aa15.97■□□□□ 0.15
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PTPRF-209ENST00000438120 OR1D5P58170 312 aa15.96■□□□□ 0.15
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PTPRF-209ENST00000438120 SLC35F3Q8IY50 421 aa15.96■□□□□ 0.15
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PTPRF-209ENST00000438120 SLC14A1Q13336 389 aa15.96■□□□□ 0.15
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PTPRF-209ENST00000438120 PARP16Q8N5Y8 322 aa15.96■□□□□ 0.15
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PTPRF-209ENST00000438120 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa15.96■□□□□ 0.15
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PTPRF-209ENST00000438120 K7ESM1 405 aa15.96■□□□□ 0.14
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PTPRF-209ENST00000438120 SERPINA7P05543 415 aa15.96■□□□□ 0.14
PTPRF-209ENST00000438120 TM4SF18Q96CE8 201 aa15.96■□□□□ 0.14
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PTPRF-209ENST00000438120 NRSN2Q9GZP1 204 aa15.95■□□□□ 0.14
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PTPRF-209ENST00000438120 DNAJB6O75190 326 aa15.95■□□□□ 0.14
PTPRF-209ENST00000438120 Q6ZSR9 355 aa15.95■□□□□ 0.14
PTPRF-209ENST00000438120 SLC7A13Q8TCU3 470 aa15.95■□□□□ 0.14
PTPRF-209ENST00000438120 MUCL1Q96DR8 90 aa15.95■□□□□ 0.14
PTPRF-209ENST00000438120 MBNL1Q9NR56 388 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
PTPRF-209ENST00000438120 ADAM29Q9UKF5 820 aa15.95■□□□□ 0.14
PTPRF-209ENST00000438120 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa15.95■□□□□ 0.14
PTPRF-209ENST00000438120 HCRTR1O43613 425 aa15.95■□□□□ 0.14
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