RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000423112.2

RFX3-AS1-201, RFX3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene RFX3-AS1, Length 552 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CARM1Q86X55 608 aa14.25□□□□□ -0.13
RFX3-AS1-201ENST00000423112 OR56A1Q8NGH5 318 aa14.25□□□□□ -0.13
RFX3-AS1-201ENST00000423112 BCL2L2Q92843 193 aaPredicted RBP14.25□□□□□ -0.13
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MTERF3Q96E29 417 aa14.25□□□□□ -0.13
RFX3-AS1-201ENST00000423112 L3HYPDHQ96EM0 354 aa14.25□□□□□ -0.13
RFX3-AS1-201ENST00000423112 DNAJA3Q96EY1 480 aa14.25□□□□□ -0.13
RFX3-AS1-201ENST00000423112 AURKBQ96GD4 344 aaPredicted RBP14.25□□□□□ -0.13
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ZNF416Q9BWM5 594 aa14.25□□□□□ -0.13
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TMPRSS13Q9BYE2 586 aa14.25□□□□□ -0.13
RFX3-AS1-201ENST00000423112 OR11A1Q9GZK7 315 aa14.25□□□□□ -0.13
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PIF1Q9H611 641 aa14.25□□□□□ -0.13
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SIRT3Q9NTG7 399 aaPredicted RBP14.25□□□□□ -0.13
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CMAHPQ9Y471 501 aa14.25□□□□□ -0.13
RFX3-AS1-201ENST00000423112 OR6C65A6NJZ3 312 aa14.24□□□□□ -0.13
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PPIHO43447 177 aaKnown RBP14.24□□□□□ -0.13
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RAD51CO43502 376 aa14.24□□□□□ -0.13
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PRPH2P23942 346 aa14.24□□□□□ -0.13
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PRTN3P24158 256 aa14.24□□□□□ -0.13
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PRKAA2P54646 552 aa14.24□□□□□ -0.13
RFX3-AS1-201ENST00000423112 FOXA1P55317 472 aa14.24□□□□□ -0.13
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TP53BP2Q13625 1128 aa14.24□□□□□ -0.13
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ZNF141Q15928 474 aa14.24□□□□□ -0.13
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PAQR6Q6TCH4 344 aa14.24□□□□□ -0.13
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RIBC1Q8N443 379 aaPredicted RBP14.24□□□□□ -0.13
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SYT14Q8NB59 555 aa14.24□□□□□ -0.13
RFX3-AS1-201ENST00000423112 IL17RDQ8NFM7 739 aa14.24□□□□□ -0.13
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PMM1Q92871 262 aa14.24□□□□□ -0.13
RFX3-AS1-201ENST00000423112 DDIT4LQ96D03 193 aa14.24□□□□□ -0.13
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SDF2Q99470 211 aa14.24□□□□□ -0.13
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SF3B5Q9BWJ5 86 aaKnown RBP14.24□□□□□ -0.13
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RAB17Q9H0T7 212 aa14.24□□□□□ -0.13
RFX3-AS1-201ENST00000423112 REV1Q9UBZ9 1251 aa14.24□□□□□ -0.13
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PCDHGB4Q9UN71 923 aa14.24□□□□□ -0.13
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CORINQ9Y5Q5 1042 aa14.24□□□□□ -0.13
RFX3-AS1-201ENST00000423112 KCNE3Q9Y6H6 103 aa14.24□□□□□ -0.13
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP14.24□□□□□ -0.13
RFX3-AS1-201ENST00000423112 WNT9BO14905 357 aa14.23□□□□□ -0.13
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CRCPO75575 148 aa14.23□□□□□ -0.13
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PRSS23O95084 383 aa14.23□□□□□ -0.13
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MPZL1O95297 269 aa14.23□□□□□ -0.13
RFX3-AS1-201ENST00000423112 LGI1O95970 557 aa14.23□□□□□ -0.13
RFX3-AS1-201ENST00000423112 GSNP06396 782 aa14.23□□□□□ -0.13
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CBR1P16152 277 aa14.23□□□□□ -0.13
RFX3-AS1-201ENST00000423112 GATA3P23771 443 aa14.23□□□□□ -0.13
RFX3-AS1-201ENST00000423112 COL8A2P25067 703 aa14.23□□□□□ -0.13
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CCT3P49368 545 aaKnown RBP14.23□□□□□ -0.13
RFX3-AS1-201ENST00000423112 DAG1Q14118 895 aa14.23□□□□□ -0.13
RFX3-AS1-201ENST00000423112 DCAF12L2Q5VW00 463 aa14.23□□□□□ -0.13
RFX3-AS1-201ENST00000423112 R3HCC1LQ7Z5L2 792 aaKnown RBP14.23□□□□□ -0.13
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ADGRG3Q86Y34 549 aa14.23□□□□□ -0.13
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TSSK3Q96PN8 268 aa14.23□□□□□ -0.13
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SEC61A2Q9H9S3 476 aa14.23□□□□□ -0.13
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ZNF275Q9NSD4 429 aaPredicted RBP14.23□□□□□ -0.13
RFX3-AS1-201ENST00000423112 OXSMQ9NWU1 459 aa14.23□□□□□ -0.13
RFX3-AS1-201ENST00000423112 C1orf109Q9NX04 203 aa14.23□□□□□ -0.13
RFX3-AS1-201ENST00000423112 IGHV2OR16-5A0A0B4J2B6 119 aa14.22□□□□□ -0.13
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NR5A2O00482 541 aa14.22□□□□□ -0.13
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP14.22□□□□□ -0.13
RFX3-AS1-201ENST00000423112 AK1P00568 194 aa14.22□□□□□ -0.13
RFX3-AS1-201ENST00000423112 HPXP02790 462 aa14.22□□□□□ -0.13
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ADRA2CP18825 462 aa14.22□□□□□ -0.13
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SDC1P18827 310 aa14.22□□□□□ -0.13
RFX3-AS1-201ENST00000423112 EFNA1P20827 205 aaPredicted RBP14.22□□□□□ -0.13
RFX3-AS1-201ENST00000423112 HTR3AP46098 478 aa14.22□□□□□ -0.13
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SH3BGRP55822 239 aaPredicted RBP14.22□□□□□ -0.13
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TUBA1BP68363 451 aa14.22□□□□□ -0.13
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TUBA4AP68366 448 aa14.22□□□□□ -0.13
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ZP4Q12836 540 aa14.22□□□□□ -0.13
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SNTB2Q13425 540 aaKnown RBP14.22□□□□□ -0.13
RFX3-AS1-201ENST00000423112 GPR68Q15743 365 aa14.22□□□□□ -0.13
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SPDYE7PQ495Y7 208 aa14.22□□□□□ -0.13
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ZDHHC24Q6UX98 284 aa14.22□□□□□ -0.13
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TUBA1AQ71U36 451 aa14.22□□□□□ -0.13
RFX3-AS1-201ENST00000423112 LCA5Q86VQ0 697 aa14.22□□□□□ -0.13
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ZIC4Q8N9L1 334 aa14.22□□□□□ -0.13
RFX3-AS1-201ENST00000423112 OR9K2Q8NGE7 335 aa14.22□□□□□ -0.13
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RNF217Q8TC41 542 aa14.22□□□□□ -0.13
RFX3-AS1-201ENST00000423112 OIT3Q8WWZ8 545 aa14.22□□□□□ -0.13
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MOAP1Q96BY2 351 aa14.22□□□□□ -0.13
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RAB39BQ96DA2 213 aa14.22□□□□□ -0.13
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ZNF385AQ96PM9 386 aaKnown RBP14.22□□□□□ -0.13
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PAFAH2Q99487 392 aa14.22□□□□□ -0.13
RFX3-AS1-201ENST00000423112 GSTO2Q9H4Y5 243 aa14.22□□□□□ -0.13
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ZNF665Q9H7R5 613 aa14.22□□□□□ -0.13
RFX3-AS1-201ENST00000423112 GPATCH2Q9NW75 528 aa14.22□□□□□ -0.13
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SLC35A3Q9Y2D2 325 aa14.22□□□□□ -0.13
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CCL27Q9Y4X3 112 aa14.22□□□□□ -0.13
RFX3-AS1-201ENST00000423112 DUXAA6NLW8 204 aa14.21□□□□□ -0.13
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TRIM49D1C9J1S8 452 aa14.21□□□□□ -0.13
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ZNF208O43345 1280 aa14.21□□□□□ -0.13
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PLPP2O43688 288 aa14.21□□□□□ -0.13
RFX3-AS1-201ENST00000423112 STX11O75558 287 aa14.21□□□□□ -0.13
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ALX3O95076 343 aa14.21□□□□□ -0.13
RFX3-AS1-201ENST00000423112 GSTA1P08263 222 aa14.21□□□□□ -0.13
RFX3-AS1-201ENST00000423112 GCH1P30793 250 aa14.21□□□□□ -0.13
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ARR3P36575 388 aa14.21□□□□□ -0.13
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MAP2K6P52564 334 aa14.21□□□□□ -0.13
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NAA20P61599 178 aa14.21□□□□□ -0.13
RFX3-AS1-201ENST00000423112 OTUD3Q5T2D3 398 aaPredicted RBP14.21□□□□□ -0.13
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TREML1Q86YW5 311 aa14.21□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.5 ms