RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000418331.6

PTPRJ-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRJ, Length 5,122 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-201ENST00000418331 RHOXF1Q8NHV9 184 aa19.87■□□□□ 0.77
PTPRJ-201ENST00000418331 SLC41A2Q96JW4 573 aa19.87■□□□□ 0.77
PTPRJ-201ENST00000418331 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP19.87■□□□□ 0.77
PTPRJ-201ENST00000418331 IFNA2P01563 188 aa19.87■□□□□ 0.77
PTPRJ-201ENST00000418331 TFP02787 698 aa19.87■□□□□ 0.77
PTPRJ-201ENST00000418331 CHRM4P08173 479 aa19.87■□□□□ 0.77
PTPRJ-201ENST00000418331 LIM2P55344 173 aa19.87■□□□□ 0.77
PTPRJ-201ENST00000418331 RHEBQ15382 184 aa19.87■□□□□ 0.77
PTPRJ-201ENST00000418331 SLC22A6Q4U2R8 563 aa19.87■□□□□ 0.77
PTPRJ-201ENST00000418331 C5orf46Q6UWT4 87 aa19.87■□□□□ 0.77
PTPRJ-201ENST00000418331 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP19.87■□□□□ 0.77
PTPRJ-201ENST00000418331 TMEM255BQ8WV15 326 aa19.87■□□□□ 0.77
PTPRJ-201ENST00000418331 SNAPC3Q92966 411 aa19.87■□□□□ 0.77
PTPRJ-201ENST00000418331 TCEAL3Q969E4 200 aa19.87■□□□□ 0.77
PTPRJ-201ENST00000418331 ASB1Q9Y576 335 aa19.87■□□□□ 0.77
PTPRJ-201ENST00000418331 OR5K3A6NET4 321 aa19.87■□□□□ 0.77
PTPRJ-201ENST00000418331 H7C1C5 153 aa19.87■□□□□ 0.77
PTPRJ-201ENST00000418331 RAC2P15153 192 aa19.87■□□□□ 0.77
PTPRJ-201ENST00000418331 LCN6P62502 163 aa19.87■□□□□ 0.77
PTPRJ-201ENST00000418331 DCAF12Q5T6F0 453 aa19.87■□□□□ 0.77
PTPRJ-201ENST00000418331 PRAMEF20Q5VT98 475 aa19.87■□□□□ 0.77
PTPRJ-201ENST00000418331 NXNL2Q5VZ03 156 aa19.87■□□□□ 0.77
PTPRJ-201ENST00000418331 MS4A6EQ96DS6 147 aa19.87■□□□□ 0.77
PTPRJ-201ENST00000418331 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa19.87■□□□□ 0.77
PTPRJ-201ENST00000418331 NELFAQ9H3P2 528 aa19.87■□□□□ 0.77
PTPRJ-201ENST00000418331 IL21Q9HBE4 155 aa19.87■□□□□ 0.77
PTPRJ-201ENST00000418331 EMC3Q9P0I2 261 aa19.87■□□□□ 0.77
PTPRJ-201ENST00000418331 KLHL13Q9P2N7 655 aa19.87■□□□□ 0.77
PTPRJ-201ENST00000418331 TMEM72A0PK05 275 aa19.87■□□□□ 0.77
PTPRJ-201ENST00000418331 CYCSP99999 105 aaKnown RBP19.87■□□□□ 0.77
PTPRJ-201ENST00000418331 DNAAF1Q8NEP3 725 aa19.87■□□□□ 0.77
PTPRJ-201ENST00000418331 MOKQ9UQ07 419 aa19.87■□□□□ 0.77
PTPRJ-201ENST00000418331 SMCO3A2RU48 225 aa19.86■□□□□ 0.77
PTPRJ-201ENST00000418331 ANKRD30BLA7E2S9 258 aa19.86■□□□□ 0.77
PTPRJ-201ENST00000418331 AP1G1O43747 822 aa19.86■□□□□ 0.77
PTPRJ-201ENST00000418331 CNN3Q15417 329 aaKnown RBP19.86■□□□□ 0.77
PTPRJ-201ENST00000418331 CCDC28AQ8IWP9 274 aa19.86■□□□□ 0.77
PTPRJ-201ENST00000418331 C7orf50Q9BRJ6 194 aaKnown RBP19.86■□□□□ 0.77
PTPRJ-201ENST00000418331 C6orf106Q9H6K1 298 aaPredicted RBP19.86■□□□□ 0.77
PTPRJ-201ENST00000418331 B3GALT1Q9Y5Z6 326 aa19.86■□□□□ 0.77
PTPRJ-201ENST00000418331 OR2T7P0C7T2 308 aa19.86■□□□□ 0.77
PTPRJ-201ENST00000418331 GCH1P30793 250 aa19.86■□□□□ 0.77
PTPRJ-201ENST00000418331 OR2T27Q8NH04 317 aa19.86■□□□□ 0.77
PTPRJ-201ENST00000418331 HCAR1Q9BXC0 346 aa19.86■□□□□ 0.77
PTPRJ-201ENST00000418331 POM121BA6NF01 834 aa19.86■□□□□ 0.77
PTPRJ-201ENST00000418331 DCNP07585 359 aaKnown RBP19.86■□□□□ 0.77
PTPRJ-201ENST00000418331 MAOAP21397 527 aa19.86■□□□□ 0.77
PTPRJ-201ENST00000418331 CRMP1Q14194 572 aa19.86■□□□□ 0.77
PTPRJ-201ENST00000418331 FAM198BQ6UWH4 519 aa19.86■□□□□ 0.77
PTPRJ-201ENST00000418331 Q6ZNB5 142 aa19.86■□□□□ 0.77
PTPRJ-201ENST00000418331 VN1R3Q9BXE9 311 aa19.86■□□□□ 0.77
PTPRJ-201ENST00000418331 MMP17Q9ULZ9 603 aa19.86■□□□□ 0.77
PTPRJ-201ENST00000418331 LOC102723532A0A0G2JNH3 316 aa19.86■□□□□ 0.77
PTPRJ-201ENST00000418331 PAHP00439 452 aa19.86■□□□□ 0.77
PTPRJ-201ENST00000418331 ADARB1P78563 741 aaKnown RBP19.86■□□□□ 0.77
PTPRJ-201ENST00000418331 OR13F1Q8NGS4 319 aa19.86■□□□□ 0.77
PTPRJ-201ENST00000418331 DEDD2Q8WXF8 326 aa19.86■□□□□ 0.77
PTPRJ-201ENST00000418331 OR51J1Q9H342 316 aa19.86■□□□□ 0.77
PTPRJ-201ENST00000418331 PRDM9Q9NQV7 894 aa19.86■□□□□ 0.77
PTPRJ-201ENST00000418331 TAS2R16Q9NYV7 291 aa19.86■□□□□ 0.77
PTPRJ-201ENST00000418331 PCDHGA6Q9Y5G7 932 aa19.86■□□□□ 0.77
PTPRJ-201ENST00000418331 TP53P04637 393 aaPredicted RBP19.85■□□□□ 0.77
PTPRJ-201ENST00000418331 FPR3P25089 353 aa19.85■□□□□ 0.77
PTPRJ-201ENST00000418331 CAV3P56539 151 aa19.85■□□□□ 0.77
PTPRJ-201ENST00000418331 PDZD9Q8IXQ8 264 aa19.85■□□□□ 0.77
PTPRJ-201ENST00000418331 TBC1D15Q8TC07 691 aa19.85■□□□□ 0.77
PTPRJ-201ENST00000418331 PRR14Q9BWN1 585 aa19.85■□□□□ 0.77
PTPRJ-201ENST00000418331 ANKRD19PQ9H560 264 aa19.85■□□□□ 0.77
PTPRJ-201ENST00000418331 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP19.85■□□□□ 0.77
PTPRJ-201ENST00000418331 LYRM4Q9HD34 91 aa19.85■□□□□ 0.77
PTPRJ-201ENST00000418331 KLK4Q9Y5K2 254 aa19.85■□□□□ 0.77
PTPRJ-201ENST00000418331 ZNF593O00488 134 aaPredicted RBP19.85■□□□□ 0.77
PTPRJ-201ENST00000418331 ATG12O94817 140 aa19.85■□□□□ 0.77
PTPRJ-201ENST00000418331 FOXK2Q01167 660 aa19.85■□□□□ 0.77
PTPRJ-201ENST00000418331 ZNF616Q08AN1 781 aa19.85■□□□□ 0.77
PTPRJ-201ENST00000418331 C17orf67Q0P5P2 114 aa19.85■□□□□ 0.77
PTPRJ-201ENST00000418331 FGFBP1Q14512 234 aa19.85■□□□□ 0.77
PTPRJ-201ENST00000418331 STK11Q15831 433 aa19.85■□□□□ 0.77
PTPRJ-201ENST00000418331 HYAL4Q2M3T9 481 aa19.85■□□□□ 0.77
PTPRJ-201ENST00000418331 PLK5Q496M5 336 aa19.85■□□□□ 0.77
PTPRJ-201ENST00000418331 NMNAT3Q96T66 252 aa19.85■□□□□ 0.77
PTPRJ-201ENST00000418331 TSNAXQ99598 290 aaKnown RBP19.85■□□□□ 0.77
PTPRJ-201ENST00000418331 PBX4Q9BYU1 374 aa19.85■□□□□ 0.77
PTPRJ-201ENST00000418331 TAS2R31P59538 309 aa19.85■□□□□ 0.77
PTPRJ-201ENST00000418331 PCBD1P61457 104 aa19.85■□□□□ 0.77
PTPRJ-201ENST00000418331 HAGHLQ6PII5 290 aaPredicted RBP19.85■□□□□ 0.77
PTPRJ-201ENST00000418331 SGPP2Q8IWX5 399 aa19.85■□□□□ 0.77
PTPRJ-201ENST00000418331 SGCZQ96LD1 299 aa19.85■□□□□ 0.77
PTPRJ-201ENST00000418331 GAREM1Q9H706 876 aa19.85■□□□□ 0.77
PTPRJ-201ENST00000418331 ZFP57Q9NU63 452 aa19.85■□□□□ 0.77
PTPRJ-201ENST00000418331 NXT1Q9UKK6 140 aaKnown RBP19.85■□□□□ 0.77
PTPRJ-201ENST00000418331 SLC35D2Q76EJ3 337 aa19.85■□□□□ 0.77
PTPRJ-201ENST00000418331 SLC2A12Q8TD20 617 aa19.85■□□□□ 0.77
PTPRJ-201ENST00000418331 TRAV36DV7A0A075B6V5 113 aa19.84■□□□□ 0.77
PTPRJ-201ENST00000418331 TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 188 aa19.84■□□□□ 0.77
PTPRJ-201ENST00000418331 F5H5P2 479 aa19.84■□□□□ 0.77
PTPRJ-201ENST00000418331 ARPC5O15511 151 aa19.84■□□□□ 0.77
PTPRJ-201ENST00000418331 PIGAP37287 484 aa19.84■□□□□ 0.77
PTPRJ-201ENST00000418331 HTR2BP41595 481 aa19.84■□□□□ 0.77
PTPRJ-201ENST00000418331 RPS25P62851 125 aaKnown RBP19.84■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29 ms