RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409300.5

RAD9B-204, Transcript of RAD9 checkpoint clamp component B, human

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene RAD9B, Length 2,732 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RAD9B-204	ENST00000409300	RPH3A	Q9Y2J0	694 aa	Predicted RBP	10.2	□□□□□ -0.78
RAD9B-204	ENST00000409300	ADAM18	Q9Y3Q7	739 aa		10.2	□□□□□ -0.78
RAD9B-204	ENST00000409300	TNFSF12-TNFSF13	A0A0A6YY99	330 aa		10.2	□□□□□ -0.78
RAD9B-204	ENST00000409300	MCIDAS	D6RGH6	385 aa		10.2	□□□□□ -0.78
RAD9B-204	ENST00000409300	RGS10	O43665	173 aa		10.2	□□□□□ -0.78
RAD9B-204	ENST00000409300		P04436	131 aa		10.2	□□□□□ -0.78
RAD9B-204	ENST00000409300	PEPD	P12955	493 aa		10.2	□□□□□ -0.78
RAD9B-204	ENST00000409300	IL11	P20809	199 aa		10.2	□□□□□ -0.78
RAD9B-204	ENST00000409300	MSX1	P28360	303 aa		10.2	□□□□□ -0.78
RAD9B-204	ENST00000409300	DNASE1L1	P49184	302 aa		10.2	□□□□□ -0.78
RAD9B-204	ENST00000409300	SUMO3	P55854	103 aa	Predicted RBP	10.2	□□□□□ -0.78
RAD9B-204	ENST00000409300	CSNK2B	P67870	215 aa		10.2	□□□□□ -0.78
RAD9B-204	ENST00000409300	ST3GAL4	Q11206	333 aa		10.2	□□□□□ -0.78
RAD9B-204	ENST00000409300	CAMK2B	Q13554	666 aa		10.2	□□□□□ -0.78
RAD9B-204	ENST00000409300	TOMM20	Q15388	145 aa		10.2	□□□□□ -0.78
RAD9B-204	ENST00000409300	OR2M3	Q8NG83	312 aa		10.2	□□□□□ -0.78
RAD9B-204	ENST00000409300	TMEM163	Q8TC26	289 aa		10.2	□□□□□ -0.78
RAD9B-204	ENST00000409300	ST8SIA1	Q92185	356 aa		10.2	□□□□□ -0.78
RAD9B-204	ENST00000409300		Q96MT0	163 aa		10.2	□□□□□ -0.78
RAD9B-204	ENST00000409300	IP6K3	Q96PC2	410 aa		10.2	□□□□□ -0.78
RAD9B-204	ENST00000409300	FAM117A	Q9C073	453 aa		10.2	□□□□□ -0.78
RAD9B-204	ENST00000409300	C12orf10	Q9HB07	376 aa		10.2	□□□□□ -0.78
RAD9B-204	ENST00000409300	CPNE5	Q9HCH3	593 aa		10.2	□□□□□ -0.78
RAD9B-204	ENST00000409300	KLHL1	Q9NR64	748 aa		10.2	□□□□□ -0.78
RAD9B-204	ENST00000409300	SEC14L4	Q9UDX3	406 aa		10.2	□□□□□ -0.78
RAD9B-204	ENST00000409300	CHRNA9	Q9UGM1	479 aa		10.2	□□□□□ -0.78
RAD9B-204	ENST00000409300	PSORS1C1	Q9UIG5	152 aa		10.2	□□□□□ -0.78
RAD9B-204	ENST00000409300	FREM3	P0C091	2139 aa		10.19	□□□□□ -0.78
RAD9B-204	ENST00000409300	CCDC160	A6NGH7	325 aa		10.19	□□□□□ -0.78
RAD9B-204	ENST00000409300		A8MVM7	634 aa		10.19	□□□□□ -0.78
RAD9B-204	ENST00000409300	NDUFB2	O95178	105 aa		10.19	□□□□□ -0.78
RAD9B-204	ENST00000409300	APOL3	O95236	402 aa		10.19	□□□□□ -0.78
RAD9B-204	ENST00000409300	FADS2	O95864	444 aa	Known RBP	10.19	□□□□□ -0.78
RAD9B-204	ENST00000409300	F13B	P05160	661 aa		10.19	□□□□□ -0.78
RAD9B-204	ENST00000409300	STS	P08842	583 aa		10.19	□□□□□ -0.78
RAD9B-204	ENST00000409300	AQP2	P41181	271 aa		10.19	□□□□□ -0.78
RAD9B-204	ENST00000409300	MAP2K4	P45985	399 aa		10.19	□□□□□ -0.78
RAD9B-204	ENST00000409300	HTR3A	P46098	478 aa		10.19	□□□□□ -0.78
RAD9B-204	ENST00000409300	EFNB1	P98172	346 aa		10.19	□□□□□ -0.78
RAD9B-204	ENST00000409300	FOXK2	Q01167	660 aa		10.19	□□□□□ -0.78
RAD9B-204	ENST00000409300	EMX1	Q04741	257 aa	Predicted RBP	10.19	□□□□□ -0.78
RAD9B-204	ENST00000409300	PMS2P3	Q13401	168 aa		10.19	□□□□□ -0.78
RAD9B-204	ENST00000409300	PLPPR5	Q32ZL2	321 aa		10.19	□□□□□ -0.78
RAD9B-204	ENST00000409300	FOXB2	Q5VYV0	432 aa		10.19	□□□□□ -0.78
RAD9B-204	ENST00000409300	PLCZ1	Q86YW0	608 aa		10.19	□□□□□ -0.78
RAD9B-204	ENST00000409300	STX19	Q8N4C7	294 aa		10.19	□□□□□ -0.78
RAD9B-204	ENST00000409300	FAM26E	Q8N5C1	309 aa		10.19	□□□□□ -0.78
RAD9B-204	ENST00000409300	PSD4	Q8NDX1	1056 aa		10.19	□□□□□ -0.78
RAD9B-204	ENST00000409300	OR1J4	Q8NGS1	313 aa		10.19	□□□□□ -0.78
RAD9B-204	ENST00000409300	ARL5B	Q96KC2	179 aa		10.19	□□□□□ -0.78
RAD9B-204	ENST00000409300	ERMAP	Q96PL5	475 aa	Predicted RBP	10.19	□□□□□ -0.78
RAD9B-204	ENST00000409300	SECISBP2	Q96T21	854 aa	Known RBP	10.19	□□□□□ -0.78
RAD9B-204	ENST00000409300	ANGPTL4	Q9BY76	406 aa		10.19	□□□□□ -0.78
RAD9B-204	ENST00000409300	LHPP	Q9H008	270 aa		10.19	□□□□□ -0.78
RAD9B-204	ENST00000409300	SH2D2A	Q9NP31	389 aa		10.19	□□□□□ -0.78
RAD9B-204	ENST00000409300	LRFN1	Q9P244	771 aa		10.19	□□□□□ -0.78
RAD9B-204	ENST00000409300		A0A0G2JMM0	328 aa		10.19	□□□□□ -0.78
RAD9B-204	ENST00000409300		A0A1W2PPB8	328 aa		10.19	□□□□□ -0.78
RAD9B-204	ENST00000409300		A0A1W2PRS3	328 aa		10.19	□□□□□ -0.78
RAD9B-204	ENST00000409300	SH3D21	A4FU49	640 aa		10.19	□□□□□ -0.78
RAD9B-204	ENST00000409300	KIR3DP1	A8MWS1	328 aa		10.19	□□□□□ -0.78
RAD9B-204	ENST00000409300	DXO	O77932	396 aa	Known RBP	10.19	□□□□□ -0.78
RAD9B-204	ENST00000409300	MT-ND2	P03891	347 aa		10.19	□□□□□ -0.78
RAD9B-204	ENST00000409300	HIST1H2AB	P04908	130 aa		10.19	□□□□□ -0.78
RAD9B-204	ENST00000409300	HMGN1	P05114	100 aa		10.19	□□□□□ -0.78
RAD9B-204	ENST00000409300	TFPI	P10646	304 aa		10.19	□□□□□ -0.78
RAD9B-204	ENST00000409300	WT1	P19544	449 aa	Predicted RBP	10.19	□□□□□ -0.78
RAD9B-204	ENST00000409300	SLC6A6	P31641	620 aa		10.19	□□□□□ -0.78
RAD9B-204	ENST00000409300	FOXC1	Q12948	553 aa		10.19	□□□□□ -0.78
RAD9B-204	ENST00000409300	C1orf140	Q5VVS0	124 aa		10.19	□□□□□ -0.78
RAD9B-204	ENST00000409300	SLC6A19	Q695T7	634 aa		10.19	□□□□□ -0.78
RAD9B-204	ENST00000409300	HIST3H2A	Q7L7L0	130 aa		10.19	□□□□□ -0.78
RAD9B-204	ENST00000409300	CPO	Q8IVL8	374 aa		10.19	□□□□□ -0.78
RAD9B-204	ENST00000409300	DND1	Q8IYX4	353 aa	Known RBP	10.19	□□□□□ -0.78
RAD9B-204	ENST00000409300	GHDC	Q8N2G8	530 aa		10.19	□□□□□ -0.78
RAD9B-204	ENST00000409300	LNX2	Q8N448	690 aa		10.19	□□□□□ -0.78
RAD9B-204	ENST00000409300	CYB561A3	Q8NBI2	242 aa		10.19	□□□□□ -0.78
RAD9B-204	ENST00000409300	ANKK1	Q8NFD2	765 aa		10.19	□□□□□ -0.78
RAD9B-204	ENST00000409300	BBS1	Q8NFJ9	593 aa		10.19	□□□□□ -0.78
RAD9B-204	ENST00000409300	MOSPD2	Q8NHP6	518 aa		10.19	□□□□□ -0.78
RAD9B-204	ENST00000409300	HIST1H2AC	Q93077	130 aa		10.19	□□□□□ -0.78
RAD9B-204	ENST00000409300	C1GALT1C1	Q96EU7	318 aa		10.19	□□□□□ -0.78
RAD9B-204	ENST00000409300	ZNF582	Q96NG8	517 aa	Predicted RBP	10.19	□□□□□ -0.78
RAD9B-204	ENST00000409300	MED20	Q9H944	212 aa		10.19	□□□□□ -0.78
RAD9B-204	ENST00000409300	VCX3A	Q9NNX9	186 aa		10.19	□□□□□ -0.78
RAD9B-204	ENST00000409300	PLCXD1	Q9NUJ7	323 aa		10.19	□□□□□ -0.78
RAD9B-204	ENST00000409300	PLA2G3	Q9NZ20	509 aa		10.19	□□□□□ -0.78
RAD9B-204	ENST00000409300	IER3IP1	Q9Y5U9	82 aa		10.19	□□□□□ -0.78
RAD9B-204	ENST00000409300	COMMD3-BMI1	R4GMX3	469 aa		10.19	□□□□□ -0.78
RAD9B-204	ENST00000409300	TRAV36DV7	A0A075B6V5	113 aa		10.18	□□□□□ -0.78
RAD9B-204	ENST00000409300	IGLV3-32	A0A0A0MS00	114 aa		10.18	□□□□□ -0.78
RAD9B-204	ENST00000409300	TRIM64C	A6NLI5	447 aa		10.18	□□□□□ -0.78
RAD9B-204	ENST00000409300	ASAH2B	P0C7U1	165 aa		10.18	□□□□□ -0.78
RAD9B-204	ENST00000409300	AHCY	P23526	432 aa		10.18	□□□□□ -0.78
RAD9B-204	ENST00000409300	CD96	P40200	585 aa		10.18	□□□□□ -0.78
RAD9B-204	ENST00000409300	APOBEC1	P41238	236 aa	Known RBP	10.18	□□□□□ -0.78
RAD9B-204	ENST00000409300	XAF1	Q6GPH4	301 aa		10.18	□□□□□ -0.78
RAD9B-204	ENST00000409300	JMJD6	Q6NYC1	403 aa	Predicted RBP	10.18	□□□□□ -0.78
RAD9B-204	ENST00000409300	PLBD1	Q6P4A8	553 aa		10.18	□□□□□ -0.78
RAD9B-204	ENST00000409300	B3GLCT	Q6Y288	498 aa		10.18	□□□□□ -0.78

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