RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380828.6

RABGEF1-202, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

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Gene RABGEF1, Length 3,864 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-202ENST00000380828 MDM4O15151 490 aa6.29□□□□□ -1.4
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RABGEF1-202ENST00000380828 METTL18O95568 372 aa6.29□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 SLC25A27O95847 323 aa6.29□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 ACTL6AO96019 429 aa6.29□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 HOXB5P09067 269 aa6.29□□□□□ -1.4
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RABGEF1-202ENST00000380828 HOXA5P20719 270 aa6.29□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 EDN2P20800 178 aa6.29□□□□□ -1.4
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RABGEF1-202ENST00000380828 CFAP206Q8IYR0 622 aa6.29□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 AQP11Q8NBQ7 271 aa6.29□□□□□ -1.4
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RABGEF1-202ENST00000380828 INPP5KQ9BT40 448 aa6.29□□□□□ -1.4
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RABGEF1-202ENST00000380828 OR52A1Q9UKL2 312 aa6.29□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 HSF4Q9ULV5 492 aa6.29□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 XIRP2A4UGR9 3374 aa6.29□□□□□ -1.4
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RABGEF1-202ENST00000380828 LOC100289279A0A1B0GTE1 492 aa6.29□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
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RABGEF1-202ENST00000380828 KLF11O14901 512 aa6.29□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 NARSO43776 548 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
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RABGEF1-202ENST00000380828 PRDX5P30044 214 aa6.29□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 AQP2P41181 271 aa6.29□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 SLC19A1P41440 591 aa6.29□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 CDX1P47902 265 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
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RABGEF1-202ENST00000380828 CRMP1Q14194 572 aa6.29□□□□□ -1.4
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RABGEF1-202ENST00000380828 FCN2Q15485 313 aa6.29□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
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RABGEF1-202ENST00000380828 CES5AQ6NT32 575 aa6.29□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 TRIM46Q7Z4K8 759 aa6.29□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 NAXDQ8IW45 347 aa6.29□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 COMMD1Q8N668 190 aa6.29□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 BMPERQ8N8U9 685 aa6.29□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 OR6N1Q8NGY5 312 aa6.29□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 ARRDC2Q8TBH0 407 aa6.29□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 ARNTL2Q8WYA1 636 aa6.29□□□□□ -1.4
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RABGEF1-202ENST00000380828 TRIB1Q96RU8 372 aa6.29□□□□□ -1.4
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RABGEF1-202ENST00000380828 DSCR3O14972 297 aa6.28□□□□□ -1.4
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RABGEF1-202ENST00000380828 SLC37A4O43826 429 aa6.28□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 OR2T1O43869 369 aa6.28□□□□□ -1.4
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RABGEF1-202ENST00000380828 MOSPD3O75425 235 aa6.28□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 VPS26AO75436 327 aa6.28□□□□□ -1.4
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RABGEF1-202ENST00000380828 CADM4Q8NFZ8 388 aa6.28□□□□□ -1.4
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RABGEF1-202ENST00000380828 SETD6Q8TBK2 473 aa6.28□□□□□ -1.4
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RABGEF1-202ENST00000380828 BCL2L2Q92843 193 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 HIST1H2BAQ96A08 127 aa6.28□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 SLC25A32Q9H2D1 315 aa6.28□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 CALHM2Q9HA72 323 aa6.28□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 PLEK2Q9NYT0 353 aa6.28□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 RNF150Q9ULK6 438 aa6.28□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 NDRG4Q9ULP0 352 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 FAM170BA6NMN3 283 aa6.28□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 M0R036 132 aa6.28□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 IL7RP16871 459 aa6.28□□□□□ -1.4
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